同源性96.2%!Nature首篇新冠论文出炉,基本断定病毒源于蝙蝠

2020年2月3日,《自然》杂志快速发布了与新冠病毒有关的论文,文章开端做出了声明:这是一份未经修改的手稿。终稿会在经过排版、校对后再发布。


同源性96.2%!Nature首篇新冠论文出炉,基本断定病毒源于蝙蝠


这也是《自然》期刊第一次针对新冠病毒(2019-nCoV)发布的论文,论文完整地报告了对2019-nCoV的溯源,研究团队在全基因组水平上,将2019-nCoV与其他的5种病毒进行全序列的对比,发现2019-nCoV与研究团队此前在云南省的中华菊头蝠身上提取到的蝙蝠冠状病毒BatCovRaTG13高度相似,同源性为96.2%,这是目前认为2019-nCoV来源于蝙蝠的最重要证据。这意味着,蝙蝠极有可能是武汉新型冠状病毒的宿主,但目前不明确其间是否还有中间宿主。

论文还从分子水平揭示了2019-nCoV进入细胞的方式与SARS一样,都是通过ACE2分子(血管紧张素转换酶)进入受体,这一发现暗示靶向ACE2的药物,对研究对抗病毒的药物有积极作用。

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此次研究是基于对7位2019-nCoV感染者的临床样本,其中6位病人有华南海鲜市场接触史。研究人员从其中的5名患者中提取到了2019-nCoV的全长基因组序列,它们之间彼此几乎完全相同。

2019-nCoV的基因组有6个开放阅读框和其他的冠状病毒相似。2019-nCoV的疾病爆发特点、时间等让大家和SARS联系在一起。但进一步检测发现,在全基因组的水平上,2019-nCoV和SARS的序列一致性不足80%。然而,在关键的、用于物种分类的开放阅读框1abORF中的7个保守的复制酶区域,2019-nCoV和SARS病毒又有着94.6%序列一致性,可以推断两者来源于同一物种

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研究人员是谁?


中科院武汉病毒所周鹏研究员、杨兴娄副研究员和金银谭医院的王先广医生为该论文共同第一作者。武汉病毒所陈全姣、邓菲、严兵、王延轶、肖庚富研究员、金银谭医院黄朝林、陈慧冬医生和湖北省CDC占发先主任医师、刘琳琳副主任医师为共同作者。

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图丨与病毒相伴的女科学家:石正丽

论文通讯作者石正丽,是中国科学院武汉病毒研究所研究员。她和她的团队一直进行于病毒的研究,其团队是国际蝙蝠病毒研究领域最有影响力的实验室之一。石正丽团队也是中国SARS病毒的源头攻克团队。2004年,石正丽和他的团队开始了寻找SARS病毒自然宿主的旅程。

2011年,石正丽团队在云南一个洞里分离并检测到了和SARS病毒高度同源的,可以说是SARS的直系亲属的一株蝙蝠SARS样冠状病毒。除了进化关系近,在功能上面也非常相近。

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2013年,他们从这个洞的样品中成功地分离到一株病毒,它比以往发现的所有蝙蝠SARS样冠状病毒都要接近SARS病毒,最重要的是,它可以感染人类和其他哺乳动物的细胞。这一发现当年也被刊载于《自然》期刊,是证明SARS起源于蝙蝠的一个极为有力的证据。

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上世纪90年代爆发了两种严重的传染病。一个是在澳大利亚爆发的亨德拉病毒,由马传人。另一个是在马来西亚爆发的尼帕病毒,由猪传人。科学家通过研究发现,这两种病毒的自然宿主都是果蝠。H7N9禽流感、埃博拉、中东呼吸综合征等新发传染病也都和动物有关。研究人员做过统计,有超过70%的新发传染病来源于动物。

所以不要去打扰野生动物了吧!


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