關於日本天皇的祖先是朝鮮人還是中國人的爭論一度再出現。爭議出現的背景是，日本皇室一直不願意對外公開對於皇室古墳的考古挖掘，而在日本學術界卻強烈要求儘快對外公佈古墳真相。並由此推斷皇室古墳的確隱藏著秘密。英國《泰晤士報》和新加坡《聯合晚報》2006年6月18日和19日卻披露了一個驚人的消息：其中最大的秘密就是早期日本天皇極有可能是中國人或者朝鮮人。事實如何？雖然有各種傳說，比如說徐福東渡成為最早的日本天皇。但是歷史的蛛絲馬跡讓世界史研究所的湯重南研究員傾向認為，日本最早的天皇是朝鮮人的可能性更大。
據現今的考古證據，古代的日本是由眾多的部落國家以及自東北亞遷來的遊牧民族融合演變而成。當時處於部落戰爭時期，由於生產力比較發達，所以來自中國和朝鮮的部落大王可能在戰爭中佔據有力的位置，最終統一其他部落，並進而成為第一個天皇。
長期以來，日本國民一直以為，日本皇室擁有純正的血統。事實上，就連日本天皇本人曾經也在公開場合承認自己的祖先來自古代朝鮮皇室的成員，當年明仁天皇68歲生日這天撫今追昔，談起了自己的先祖。他說，“就我而言，我感覺自己與朝鮮半島有某種親切感。據日本編年史記載，（日本）桓武天皇的母親是古代朝鮮百濟王國一位國王的家族中人。
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