助力開展疫苗研發和藥物篩選!上海超算中心為科研人員提供免費資源

助力開展疫苗研發和藥物篩選!上海超算中心為科研人員提供免費資源

“請允許我代表高性能計算項目組對你們的支持和無私幫助道一聲誠摯的感謝。”在這個特殊的新春裡,上海超算中心收到了一份特殊的感謝信:甘肅省計算中心高性能計算組讚賞上海超算科技HPC plus 平臺和技術人員的協同努力,只需6個小時,就建立了多地互聯互通的合作研究機制;只用了16小時,就上線了大量CPU和GPU的免費計算資源,服務於正在進行的一線科學研究。

在病毒疫苗和藥物的研發過程中,先要對病毒進行基因測序,瞭解病毒的基本結構。超級計算機在基因測序、藥物研發、病毒結構等方面可以發揮重要作用,加速研究進度。上海超級計算中心在歷次突發公共衛生事件如SARS、禽流感等的藥物研製中也發揮了重要作用。

1月30日晚,蘭州大學和澳門科技大學中藥質量研究國家重點實驗室的科研團隊通過甘肅省計算中心(上海超算甘肅分中心)與上海超算中心取得聯繫,希望可以提供計算資源和技術支持以滿足即將開展的更大規模的計算模擬工作。雙方溝通後得知,研究人員至少需要1000核CPU,30塊以上invida V100GPU加速處理器,以及50TB的存儲資源。瞭解情況後,上海超算通過HPCPlus平臺迅速整合了超過3000核CPU和32塊V100GPU的免費計算資源(分別由上海超算、甘肅超算和蘇州超算中心共同提供)。

在上海超算中心主任周曦民的倡議和努力下,在此前的互聯共享機制基礎上,上海超算又聯合甘肅省計算中心、江西省計算中心、蘇州超算中心、崑山超算中心共建互聯互通合作研究機制於2月1日向社會宣佈,將統籌協調大規模CPU和GPU資源免費提供給廣大科研人員開展疫苗研發、藥物篩選等抗擊疫情相關研究工作,與時間賽跑,為生命護航。

上海超算中心相關工作人員告訴記者,面對此次疫情,研究工作者需要弄清楚什麼樣的分子可以和病毒結合,使病毒失去功能。通過超級計算機模擬不同的藥物分子與病毒結合後發生的變化,可以極大的加速這一過程。

新民晚報記者 馬亞寧


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