果樹的根可分為2種一一吸收根和運輸根。根系也是有壽命的，根壽命是指一定數量的根有一半死亡所需要的時間。根壽命對植物生長、養分競爭、養分吸收、碳和養分循環有重要意義。
果樹修根對於根系發育是很有必要的，可延長根系壽命，剔除弱根。當年生而呈乳白色的根是吸收根，有它才能吸收土壤中的水分和各種養分，供給果樹生長結果的需要、以後根莖加粗變成橙黃色，這些根統稱輸導根，這種根的作用，是把吸收根從土壤中獲得的養分輸導到樹冠，樹體衰老一般從根系開始，因此對根系的修剪更新有著和地上部枝條修剪同樣重要的作用。
根系修剪也應每年年進行，那麼根系埋在土裡怎樣修剪呢？可結合秋施基肥進行，有目的地挖斷部分粗根，促使其萌發更多的新根，這樣能有效縮短根冠距離，使養分輸送更高效，運輸更順暢。
但修剪根系時當注意以下向題：
1. 適時適度
10月份山是根系第二次生長高峰期，這時傷根，容易癒合。而一次斷根不宜過多，尤其是直徑在0.8釐米以上的大根，只能截斷部分根段，這樣才不會影響果樹的正常生長髮育。因此，每次最好挖稱的兩面坑，不要急於挖傷周的根，修根要逐年輪換方位進行斷根。
2. 儘量施用腐熟糞肥及含礦源黃腐酸肥料
要施用經過充分腐熟的肥料，以兔燒根，而未過腐熟的秸稈、雞糞等，使用時和細土拌勻才可以，然後再分層施入這樣就避免燒根了。
礦源黃腐酸水溶肥料，一般在春季開花前使用，生根效果最好。
3.發現得有根癌病、根腐病等兩害時，要及時將根病部分徹底刮除乾淨，並取出燒掉，用硫酸銅溶液清洗消後好、若病害重時，也可把病害部位全部截斷取出燒掉，以免繼續感染。
4.要毎年進行根系修剪
就像剪枝一樣，須要年年進行，密植園可在秋季進行全園深翻一次，斷根、施肥、除病根仍按照述上述進行操作。
5.及時回灌水
切忌不要暴曬數日或越冬以後再填施肥，那樣會給果樹造成損失，影響正常的生長髮育。
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