從1931年“九·一八”國難事變起，國民政府就策劃“古物南遷”行動。北京故宮中最精華的一部分一路南遷，最後到臺灣省，從此就再也沒有回來過。
金文甲骨、秦漢碑拓、敦煌遺卷、唐人寫經、佛道經藏、宋元古本、《永樂大典》、《四庫全書》……，今天，臺灣島中研院、臺北市故宮博物院、臺北“國立中央圖書館”珍藏的就是這批中華3000年文明中最精華的典籍。
中國收藏家協會報刊收藏委員會副秘書長秦傑說，根據臺灣方面資訊，臺灣地區藏古籍約100萬冊，善本有27~28萬冊。而臺北故宮從北京故宮博物院在抗日戰爭初期南遷的書籍，僅善本圖書就有6萬餘冊，其中有許多極為珍貴的宋、元善本書，還有文淵閣《四庫全書》、《四庫薈要》，都完整無缺。
多災多難的《四庫全書》
運到臺灣的故宮文物，開始存放在臺中山村北溝的老房舊舍中，日夜經受著颱風和暴雨的考驗。
1963年3月，臺灣正值春雨期。一日，古籍圖書專家梁廷煒在例行檢查中，發現文物箱上有一攤水跡，嚇了他一跳。他立即打開這臺標有633號的箱子檢查，發現貯藏在裡面的《四庫全書薈要》9冊被雨水浸溼後發生粘連。
《四庫全書》是我國古代最大的官修叢書，共7套，保存在北溝的文淵閣版《四庫全書》是成書最早的一部。這套《四庫全書薈要》是《四庫全書》的精華本，是現世僅存的一套孤本，孤本的破壞，損失重大不言而喻。
1963年6月3日，臺灣“教育部”收到了“檢察院長”于右任寫給他們的信函：“其損失情形如何，主管人員有無失職咎責？應予調查，以明真相。”結果，聯管處主任孔德成引咎辭職。孔德成是孔子的77代嫡孫，1920年被民國政府冊封為“衍聖公”。
1965年，包括這部國寶在內的所有文物，都運到了新建的臺北故宮博物院。
清乾隆年間纂修的古代文化典籍《四庫全書》，幾乎涵蓋了古代中國所有學術領域。編修歷時十餘年，參與編撰學者三百六十多人，抄寫人員近四千人，收錄典籍三千五百餘種、七萬九千餘卷，裝訂成三萬六千餘冊，約七億字……它收錄了從先秦到清乾隆時期我國大部分重要典籍，幾乎涵蓋了古代中國所有學術領域。當時一共抄寫了七部，這七部書命運卻各不相同。
其中文源閣本在1860年英法聯軍攻佔北京，火燒圓明園時被焚燬，文宗、文匯閣本在太平天國運動期間被毀；杭州文瀾閣藏書樓1861年在太平軍第二次攻佔杭州時倒塌，所藏《四庫全書》散落民間，後由藏書家丁氏兄弟收拾、整理、補抄，才搶救回原書的四分之一。文溯閣本1922年險些被賣給日本人，現藏甘肅省圖書館。文津閣本於1950年由中國政府下令調撥到中國國家圖書館，這是目前唯一一套原架原函原書保存的版本。文瀾閣本則藏於浙江省圖書館。
200多年來，當年抄寫的七部《四庫全書》，流傳至今僅存三部半，較為完整者就兩部——如今國家圖書館“鎮館之寶”、文津閣《四庫全書》，以及藏於臺北故宮的文淵閣《四庫全書》。而臺北故宮所藏，收書三千四百七十一種，全書有三萬六千三百八十一冊，七萬九千三百餘卷，比傳存的文溯，文津兩閣本超出甚多，是存世最為完備、也最為精美的一部。
一頁千金的宋刻本
宋版書在明末清初已經是非常值錢了，甚至以頁論買賣，清代著名藏書家黃丕烈為購宋刊《戰國策》，竟花去八十兩黃金。因此收藏界有“一頁宋版，一兩黃金”之說。
宋刻本的珍貴，不僅在於它的稀少，它的做工講究，更在於它最接近古本。藉助宋刻原版，校正明清以來所刻古籍的訛誤，恢復古籍的真實面貌、搜索後代刻本中沒有的資料、查找典故、考察史實，宋刻本有其極高的學術參考價值。
而在臺灣地區，就目前所知，僅藏於臺北故宮博物院和臺灣“國立中央圖書館”的宋刻本就有近400部。其中包括《爾雅》、《周禮疏》等學術價值極高的傳世孤本。
《爾雅》原為常熟汲古閣毛氏父子舊藏。毛晉汲古閣是名冠江南乃至全國的大藏書家和名刻書家。而此書後為清畢沅經訓堂所得。畢沅累官至湖廣總督，他死後的第二年，因其在湖廣總督任內濫支軍款事發，子孫被革職，家產被沒收，此書應在其時進入內廷收藏，後隨其他珍寶南遷，入臺北故宮博物院儲藏。
《爾雅》與“晉王羲之快雪時晴帖”、“清翠玉白菜”等一起被視為臺北故宮博物院鎮館之寶。《爾雅》是中國最早的一部詞典，原作者是誰，至今沒有定論。
三卷三冊宋刻本《爾雅》，由南宋國家最高學府——國子監刊印，保存得相當完整。國子監自五代時開始刊刻經籍，到如今，五代與北宋的刊本已經不多見。這部南宋時代的《爾雅》是珍貴的孤本，也是研究五代刻書規模的重要物證。值得一提的是，古書的字體與刊印形式也如藝術品一般有其風格演變的歷史。這部《爾雅》的字體端莊有力，版面寬大疏朗，又稱為宋刻大字本，是難得一見的精品。
而《周禮疏》由唐代的學者、經學家賈公彥等編撰，是唐人為“九經”所作的註疏中最為朱熹稱道的一部，現存版本為南宋的兩浙東路茶鹽司所刻，宋元遞修本。
據近代學者考證，此書在我國出版史上獨具地位。清初康熙年間“帖學四大家”之一的何焯在故宮武英殿工作曾見過此書，但在中國清代官府藏書目錄《天祿琳琅書目》中卻未收錄此書，其原因令人不解。
“古籍與秘檔”
臺北故宮所藏清代文獻檔案，也是屬於清宮舊藏。依其存放地點主要區分為“宮中檔”、“軍機處檔”以及“內閣部院檔”、“清國史館與民國清史館檔案”四大類，其中以“宮中檔”硃批奏摺與“軍機處檔”錄副折件與附圖所佔數量為最大宗。這些檔案文書，由於具有高度機密性，向來深藏大內，外界人士鮮少認識，但在清代統治者有意識的管理與保存情況下，得以存世迄今。
臺北故宮的古籍善本主要源自清宮舊藏，包括宋、元、明歷代傳承下來的善本舊籍與清代宮廷抄寫刊印的書籍，其中以昭仁殿“天祿琳琅”、養心殿“宛委別藏”、文淵閣“四庫全書”、摛藻堂“四庫全書薈要”、武英殿殿本圖書最負盛名。
乾隆九年（1744年），乾隆帝命內臣檢閱宮廷秘藏，選擇善本進呈御覽，列於昭仁殿，賜名“天祿琳琅”，並親書匾額及對聯。“天祿”一詞取漢朝天祿閣藏書，“琳琅”為美玉之稱，意謂內府藏書琳琅滿目。此後，昭仁殿成為清廷收藏善本珍籍的專門書庫。而“天祿琳琅”，則成了乾隆皇帝藏書菁華的代稱，也是至今仍存的清代皇室藏書。
“宛委別藏”是清朝學者阮元花費幾十年心血收集、編纂、抄錄而成的，沒有副本，只此一套。
阮元學問很大，曾奉乾隆諭旨參與編纂過多部皇家出版的書籍。他在南方做官時，很注重收集散落在民間的古書。通過徵集、購買、借閱等途徑，幾十年間，阮元收集到160部連《四庫全書》中都沒有的古書，陸續精心抄寫，編纂成冊，統稱為《四庫未收書》，進呈給乾隆的兒子嘉慶皇帝。
嘉慶皇帝對這套書非常珍愛，命名為《宛委別藏》（據古書記載，“宛委別藏”是大禹珍藏典籍的地方），還在每部書的首頁加蓋了“嘉慶御覽之寶”的御璽，又命工匠製作了100個楠木書匣，加以精心包裝，然後陳列在養心殿御書案背後的書架上。
養心殿，是清朝自雍正皇帝以來歷代皇帝日常辦公和居住的地方（雍正以前的皇帝住在乾清宮）。殿中的御書案是皇帝批閱奏章的書桌，嘉慶把《宛委別藏》收藏在此處，可見他對此書的珍視程度非同一般。
日寇在東北製造“九·一八事變”之後，故宮博物院擔心戰火會燒至北京，便將故宮最珍貴的部分文物裝箱運到南京，後又輾轉運到四川保存。其中就包含這套《宛委別藏》。
解放前夕，這批文物被國民黨運至臺灣，《宛委別藏》被收藏在臺北故宮博物院。所以，現在北京故宮博物院裡，只餘下那些空書架，還按兩百年前的原貌，擺放在養心殿中。
臺北故宮博物院裡所藏的數萬件古籍善本，許多來自於大陸歷代遺存，甚至直接來自北京故宮博物院，祖國大陸藏書界很少有人見到過這些典籍。
也許有那麼一天，萬流終於歸宗，散落海峽兩岸的文化瑰寶，終有團聚的一天。
臺北故宮裡，另外的精品
1.藏文大藏經
不管從歷史、文物自身質量還是珍貴稀有性來看，藏文大藏經都堪稱稀世珍寶。康熙八年，蒙古籍、篤信藏傳佛教的孝莊皇太后，亦即民間熟悉的“大玉兒”，動員孃家資源籌款，由康熙皇帝動員僧眾171名，將年久破損的明代大藏經，用泥金重新抄寫一遍，命名《大藏經》，這也是清朝第一部重修的佛經。當時使用金箔逾37萬兩，金粉近1800兩，共分108函（象徵世間芸芸眾生108種煩惱），總計10萬頁經文，每一函經文重達50公斤，今日市價估逾百億元。
藏文佛經的裝幀形式不同於漢族人習慣，以經葉、經版和經衣組成。經葉呈長方形，一張張疊成一摞，上下以經版夾住，然後用絲帶紮緊，並附上白色哈達，最後以黃綾經衣包裹，成為完整的一函經篋。這種經本形式源自印度，為西藏佛教沿用，稱為“梵夾裝”。此為清朝收藏，泥金寫本藏文甘珠爾經的經葉，正反兩面均以金泥正楷書寫，每函300～500葉不等，經葉依次序疊放後，邊緣即呈現金泥彩繪的法螺、法輪、寶傘、白蓋、蓮花、寶瓶、金魚、吉祥結等8種圖案。
2.帝鑑圖說
這是張居正為當時年僅10歲的明神宗（萬曆皇帝）所編的教科書，每段故事先錄一段簡短的史傳記載，再翻譯成當時通行的白話文，於文末提醒為政之方，通俗易懂。“臺北故宮”所藏《帝鑑圖說》共兩冊，是清代內府的圖繪寫本，色彩鮮豔，製作精美。依製作人員的年代判斷，應該完成於咸豐十一年（1861）之後。
3.明《永樂大典》
《永樂大典》編撰於明永樂年間，初名《文獻大成》，是中國的百科全書式的文獻集，全書目錄60卷，約3.7億字，這一古代文化寶庫彙集了古今圖書七八千種。
《永樂大典》成書600年來，屢遭變亂劫難，先是其正本不知所蹤，嘉靖末年抄錄的惟一副本在清康熙年間便已佚失不少，1900年八國聯軍侵入北京，《永樂大典》又遭兵燹，除大部分被焚燬之外，倖存殘本被劫掠至英、美、法等國，流散海外。
《永樂大典》成書時共有22877卷，裝成11095冊。然而，目前全世界各地所發現的《永樂大典》數量全部加在一起也只有800卷，400冊左右。也就是說，目前在全世界範圍內，已知和能見到的《永樂大典》加起來，不到原書的百分之四。
目前，《永樂大典》散落在八個國家和地區的三十多個單位和個人手中。國家圖書館目前擁有221冊（包括現存臺北故宮博物院的60冊），居世界各處收藏之首。
此外，臺北故宮沒有列出的重要古籍善本還有很多，比如宋《孟子註疏解經》、宋《南軒文集》、宋《宣和奉使高麗圖經》等等。
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