牛球蟲病以出血性腸炎為特徵。寄生於牛的球蟲有10多種，主要寄生於小腸下段和整個大腸的上皮細胞內，以邱氏艾美爾球蟲和牛艾美爾球蟲的致病力最強且最常見。隨糞便排出的球蟲稱為卵囊，在外界一定條件下發育成熟，且有侵襲性。
主要危害6月齡以下的犢牛，老齡牛多為帶蟲者。本病多發於4~9月；在潮溼、沼澤的草場上放牧易感染和發病；飼料突變，患有某種傳染病或腸道線蟲病，機體抵抗力降低時，易誘發此病。
潛伏期約為2~3周，有時達1個月。發病多為急性型。主要症狀為腹瀉、便血、精神沉鬱、體溫升高至40~41℃。食慾減退或廢絕，貧血，消瘦，產奶量下降，糞便呈黑色，並不斷由肛門流出，最後因貧血和衰弱死亡。慢性型一般在發病後3~5天逐漸好轉，但下痢和貧血症狀持續存在，直接影響生產發育和產奶。
診斷臨床上以血便、糞便惡臭、剖檢見直腸有特殊的出血性炎症和潰瘍最具診斷意義；鏡檢糞便和直腸刮取物，發現卵囊可以確診。
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