阿拉爾北起天山南麓，南至塔克拉瑪干沙漠北部，東臨沙雅縣，西抵柯坪縣，傍依阿克蘇河、塔里木河、臺蘭河、多浪河水系，東北接新和縣。東西相距281公里，南北相距180公里。與吉爾吉斯斯坦、塔吉克斯坦和哈薩克斯坦接壤，與巴基斯坦和印度臨近，有著較豐富的邊境口岸和邊貿資源。
土地革命戰爭時期，農一師屯墾阿拉爾以後，經廣大軍墾戰士披荊斬棘，艱苦創業，開墾良田120萬餘畝，興建了10個農牧團場，被譽為“塞外江南”，創造了人進沙退、人造綠洲的曠世奇蹟。“生在井岡山、長在南泥灣、轉戰數萬裡、屯墾在天山”是農一師的光輝歷程，它使阿拉爾有著豐厚的軍旅和屯墾歷史積澱。
二十世紀60年代初，就提出了“北有石河子，南有阿拉爾,兩顆明珠交相輝映”的兵團城市建設的戰略構想，後因多種歷史原因未能如願。
阿拉爾市屬塔里木河沖積細土平原，沿河岸及沖溝兩側略有抬升，地勢由西北向東南傾斜。水資源有阿克蘇河、塔里木河及勝利、上游、多浪三大平原水庫。
阿拉爾市屬於暖溫帶極端大陸性乾旱荒漠氣候，極端最高氣溫35℃（沙井子墾區每隔5～10年遇最高溫40℃），極端最低氣溫-28℃（四團墾區最低氣溫為-33.2℃）。墾區太陽輻射年均133.7～146.3千卡/平方釐米。年均日照2556.3～2991.8小時，日照率為5869%。墾區雨量稀少，冬季少雪，地表蒸發強烈，年均降水量為40.1～82.5毫米，年均蒸發量1876.6～2558.9毫米。
阿拉爾市農業以灌溉為主，主要利用昆馬力克河、哈拉玉爾滾河、阿克蘇河、多浪河、葉爾羌河以及和田河等河水。
阿拉爾市轄幸福路街道、金銀川路街道、青松路街道、南口街道、託喀依鄉、一團金銀川鎮、二團新井子鎮、三團甘泉鎮、四團永寧鎮、五團沙河鎮、六團雙城鎮、七團、八團、九團、十團、十一團花橋鎮、十二團、十三團幸福鎮、十四團金楊鎮、十五團、十六團。
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