黑旗軍，中國19世紀末的一支地方武裝，以七星黑旗為戰旗，因以得名。前期主要軍事行動為抗擊清朝統治。1867年清軍的進攻迫使黑旗軍進駐保勝(今越南老街)。後在抗擊法國侵略越南(中法戰爭)的戰爭中多次取得勝利，將領劉永福(1837年-1917年)曾被越南國王授予三宣副提督之職。協同老將馮子材的部隊，創下了打死法軍千餘人的鎮南關大捷，從而扭轉了戰爭形勢，迫使挑起戰爭的法國茹費理內閣倒臺。劉永福返回中國後被清廷下令解散。甲午戰爭中黑旗軍奉清政府命令重新編組，仍由劉永福率領，進駐臺灣島。後日軍侵臺，因戰局受困，將士大多戰死。
黑旗軍原是太平天國革命期間，活動於我國廣東、廣西邊境的一支農民起義軍。首領劉永福，1851年，劉永福參加廣西農民起義， 1865年率部加入以吳亞忠為首的天地會起義軍。其軍在歸順州(今靖西縣內)安德北帝廟前舉行祭旗儀式，以七星黑旗為軍旗，故稱黑旗軍。
黑旗軍的基本成員是貧苦農民，多是歸順、龍州、上思、寧明和欽廉人。它初創時有200多人，起義失敗後，"餉源己絕"為了"另覓生機" ，找個立足之地，眾人決定不一。
根據《劉永福歷史草》的記載為同治乙丑，即1865年，劉永福從廣西的波鬥進入越南的安禮好、高平好， 再經左大州到六安州，接著又把勢力發展到中越邊境的保勝，並以保勝到河陽一帶為根據地， 活動於越南北部。
中法戰爭
上世紀(十八)末，流亡在外的廣南國王阮福映，得到法國傳教士的協助，一七八九年，跟法國簽訂同盟條約，允許法軍長駐交趾中國地區(越南南部)，並把土倫(峴港)割讓給法國。法國承諾派遣一支軍隊，幫助阮福映復位。一七九四年，法國遠征軍攻陷首都順化，西山黨政權消滅。這時正逢法國大革命，無法消化它的勝利果實，而把軍隊撤回。阮福映繼續北伐，滅掉安南王國，統一全境。
本世紀(十九)初葉，阮福映請求中國加封，中國改封他為越南國王，他就是越南歷史上著名的嘉隆王。一八二O年，阮福映逝世，他臨死時，囑咐他的兒子阮福晈[1] 說:"不可忘記法國的大恩，對法國要敬愛不衰，但千萬不要把土地割給法國。"可是他的後裔對法國卻採取敵視態度，法國傳教士受到動輒被殺的迫害，法國的憤怒自在意料之中。
延遲到一八五六年，法國才採取行動，海軍少將魯約裡到順化呈遞國書，要求越南履行一七八九年跟嘉隆王阮福映簽訂的條約。越南政府理也不理，原封退回。魯約裡就在土倫(硯港)登陸，摧毀越南炮臺。越南政府等法國艦隊撤退後，把在越南傳教的法國傳教士，屠殺淨光，作為報復。
一八五九年，英法聯軍在中國大沽口挫敗，但對越南並不放鬆。法國艦隊再度光臨越南，攻陷交趾的首府西貢(胡志明市)。越南只好屈膝，一八六二年，跟法國簽訂《西貢條約》，把交趾割給法國。
法國政府對於佔領越南三分之一的國土，似乎已經滿意，但法國商人卻垂涎被稱為"北圻"地區的越南北部，商人久闢酉在北圻首府，交趾古都東京(河內)，發現一條可以通往中國雲南省的交通新道，就是紅河。他利用這條河道販賣軍火到雲南省，賣給正在作戰的伊斯蘭教邊民和清政府的軍隊。但軍火在越南卻是違禁物品，越南官員無法阻止他，就要求駐在西貢的法國總督召回這位商人。一八七三年，法國總督派遣海軍官員葛爾裡前往調查，葛爾裡率領兩艘軍艦到達東京(河內)後，竟被久闢酉說服，建議總督派兵併吞越南北部--北圻。越南官員對葛爾裡痛恨入骨，就跟山區的黑旗軍秘密聯絡，葛爾裡遂在黑旗軍一次狙擊戰中，中伏被殺。
黑旗軍的領袖劉永福，是中國廣西人，在五十年代中國遍地民變時，劉永福是其中的一支，但他不像太平軍那些領袖有政治理想。太平天國失敗後，清政府逐漸恢復秩序，劉永福在中國無法立足，就率領他的部眾逃到越南，在中越邊境北圻西北部山區一帶屯墾，當然也免不了種種不法的勾當，自成一個獨立王國。越南一向把中國人當作天朝人，所以對劉永福的侵入，既無力驅逐，也不想驅逐。劉永福這批約二千餘人的綠林豪傑，使用黑顏色的旗幟，越南人因之稱他們為黑旗軍。當劉永福把葛爾裡等五顆法國人頭呈獻給越南國王阮洪任(二任王阮福皎的孫兒)時，阮洪任大為高興，認為法國已經喪膽，就任命劉永福當三宣兵團副司令(三宣副提督)。
臺灣抗日
1885年劉永福率三千黑旗軍由安南迴國後，歷任南澳、石褐總兵將近十載，備受壓制，鬱郁不得志。黑旗軍經過瀕年裁減，只剩下三四百名老兵，著名戰將亦多離去，這支英雄勁旅被清朝政府摧殘殆盡。
1894年中日戰爭爆發，清軍水陸大敗，臺灣孤危，清政府把這支"異端"軍隊調赴危區。當年七月廿六日劉永福奉命渡臺，他要求閩、粵總督準其回粵西、桂南招集舊部，重建黑旗軍，受到婉言拒絕。他沉痛地說:"當此之時，既無糧鈉，何能招軍?言至於此，不禁痛哭!此皆福平日有統軍之名，無統軍之實。"(劉水福《乞總署代奏下忱書》)劉永福儘管困難重重，萬分悲憤，但他為了保衛祖國領土的完整，救臺心切，立即就地補足四營人，續招兩營，於八月一日成軍，九月二日在汕頭乘輪東渡。
臺灣巡撫邵友濂、蕃司唐景崧忌憚劉永福，奏調黑旗軍駐防颱南窮荒之地，他們則坐踞臺北富庶之區。1895年初，邵友廉設法調回湖南，唐景崧升臺灣巡撫，劉永福建議合力守衛臺北衝要之地，唐管政務，劉管軍事，受到唐景崧拒絕。在籍工部主事丘逢甲是粵東嘉應州客家人，劉永福的先世亦是嘉應州客族。他們主張相同，加上同鄉之誼，關係甚篤，丘極力斡旋，仍不能阻止唐、劉分軍，臺灣抗戰因而種下禍根。
1895年4月，李鴻章赴日本簽訂《馬關條約》，割棄臺灣。臺灣人民誓死不肯脫離祖國，於五月廿五日成立臺灣民主國，挽留唐景崧、劉永福主持杭戰。唐景崧接大總統印時，向北三跪九叩首，大哭而入。他電奏清廷說:" 臣先行，民斷不容，各官亦無一保全;只可臣暫留此，先令各官陸續內渡，臣當相機自處。"(《清季外交史料》卷一)劉永福的態度和唐迥然不同:他在臺南軍次，接到唐景崧送來"臺灣民主國" 大將軍印，立即出佈告激勵軍民共守危疆。他說:" 自問年將六十，萬死不辭" 。表示" 抗不奉詔，"棄職而為" 。(《中東戰紀本末》卷四)劉永福不但在宣言中慷慨激昂，而且行動上也做了認真準備。據《臺灣戰記》載:"劉永福守臺南，尤民望所歸。自安平至旗後各港，重重佈置，百姓鹹恃以無恐。"
六月二日，清政府派李經方到臺北海面向日本臺灣總督樺山資紀遞交割臺清單。三日日軍在基隆港外登陸，四天後即佔領了臺北首府。唐景崧私微服出走，潰軍難民湧向新竹。新竹、苗栗一帶聚居著粵東遷來的客家人，勇敢漂悍，團結性強，自動聯防保鄉。丘逢甲的部將吳湯興、徐驤、徐紹祖率領義軍，在三角湧殲滅日軍櫻井隊六十餘人和敵偵察隊十九騎。雙方相持月餘，互有勝負，使日軍佔領新竹後不敢貿然南下，臺中、臺南軍民贏得時間進行戰鬥準備。
臺北陷落後，臺南紳民商議再立民主國，迎劉永福入駐府城，三次進呈大總統印，劉永福都堅拒了。他說:" 區區此印，無能為力。" 號召人民出錢、出槍、出力，才是當務之急。沿海督撫張之洞、譚仲麟，邊寶泉等相繼函囑劉水福堅守，答應源源接濟餉械。劉永福內受臺民熱誠所感動，外恃祖國大陸的支援，便以幫辦臺灣軍務的名義主持大局。六月間，臺南數千軍民集會，劉永福率十七名文官員登臺歃血誓盟，盟書十七款，有關戰守、財經、獎懲等事宜。(詳見《臺灣抗戰日方資料》)在盟書裡，反映了劉永福等將領的愛國愛民思想，守土抗敵的決心，民主團結的作風。軍民公推劉永福為軍統，臺南總兵楊泅洪為分統，指揮台灣的軍事。又選舉七名委員組成議院，諮商政事和財務。
臺南抗戰中心的建立，面臨著一系列複雜問題。由於清廷傳諭各官內渡，文武官員紛紛向劉永福繳印辭職，役吏開小差，軍隊缺員。劉永福本著去留自願原則，擢選了一批忠勇之士擔任黑旗軍、新楚軍、鎮海軍以及臺中、臺南義軍的統領和管帶。委任了一批自願留臺的文官，充任臺中、臺南兩有八縣的官員。經過整頓後，臺灣軍民團結在劉永福黑旗軍的周圍，安定了社會秩序，重振了人心。但嚴重的問題在於經濟。由於臺北財富之區喪失，藩庫、軍械局、兵工廠盡落敵手，臺中、臺南貧困，不足養戰，餉械須仰賴於沿海官民的支援，但是清朝下令嚴禁，日艦攔截，只能少量暗濟。劉永福想方設法就地籌晌，盤點庫存銀二十多萬發行鈔票廿五萬元，發行郵票得數千元，動員鳳山鹽商捐軍響得十一萬元，總數約五六十萬。當時臺灣駐軍、義勇近百營，每月需餉十七萬兩，加上政費、雜費開支，這筆錢僅可支持兩三個月。
八月，三國干涉還遼的問題結束，日本增兵兩萬到臺灣。一面派兵艦騷擾臺南各港，牽制黑旗軍北援。主力則從新竹分三路南下臺中進迫府城彰化。為了配合軍事進攻，樺山致書劉永福，威迫他停戰撤兵，日本負責用船"禮送還國。" 劉永福立即回書駁斥，指責日本無端侵略臺灣，表示"餘奉命駐防颱灣，當與臺灣共存亡。……臺南一隅，雖屬偏小，而餘所部數十營，均系臨陣敢死之士，兼有義民數萬眾，飲血枕戈，誓死前敵。" 勸告樺山"將臺北地方全行退出。……否則餘將親督將士，剋日進徵。"(吳桐林《今生自述》)這封信義正詞嚴，表現了崇高的民族氣節。劉永福回信後，知道一場惡戰即將到來，他加強了臺南沼海的防務，築炮臺，挖陷阱，裝竹籤，防敵登陸。月初，派遣四營黑旗軍進援臺中，連他的親兵七星隊和新裝備起來的旱雷兵也源源派赴前線，穩定了臺中地區紛亂的局面。
黑旗軍的前敵主將吳彭年，浙江人，流離廣東，充劉永福文案，自請領兵救臺中，他組織前線各軍扼守彰化北面十里的大甲溪，和日寇隔溪大戰，適有一隊日本糧船開進溪來，黑旗戰士冒著槍林彈雨，跳進河中俘獲兩艘敵船而回。八月廿三--廿八日，兩軍隔溪大戰，黑旗軍果不負眾望，一上陣就銳氣百倍，"日軍多死傷，不能前，別軍轉由溪上下涉，七星隊則望對岸戰而北，五人為伍，以背相向，迥環放槍散成數十隊，呼聲大進。"(洪棄父《臺灣紀戰》上卷)這支訓練有素的精兵，表現出熟練的戰術動作和勇敢精神，使得敵人驚愕，友軍讚歎。這一仗日軍傷亡慘重，被俘多人。大敗奔入山內。吳彭年率兵追殺，封鎖住山口，準備聚而殲之。劉永福接到捷報，拍案驚叫:" 書生誤事矣!" 他知道內山有小路通彰化城外的八卦山，中了敵人的奸計，立即電令全軍退守八卦山，急派王德榜率軍四營馳援彰化。果然，日軍以漢奸引路，廿九日抄襲八卦山，排炮連翻施放，步兵滿山遍野往上攻;守軍死守不退，逐山肉搏爭奪，主將吳彭年、吳湯興陣亡，七星隊全部殉國。彰化城內漢奸樹起白旗，日軍衝進城內，黑旗將士多在巷戰中犧牲;義軍首徐驟突圍入高山族地區，重組隊伍。
黑旗軍在彰化決戰中精銳盡失，但卻表現出敗而不餒的頑強精神。八月三十一日楊灑洪到前線督師，兵不滿五百，到嘉義後就夜襲大林甫，日寇全軍潰奔，楊在追擒日酋時中彈身亡。劉永福來到嘉義，組織反攻彰化，以肖三發、王德標為主將，招編綠林簡成功、葉義成、黃榮幫參加抗戰，圍殲他裡霧日寇，收復雲林縣城，聲勢復振。日寇本想乘戰勝之威形成破竹之勢，遇到哀兵拼死再戰，被迫收縮兵力，譴守彰化。這時劉永福推行聯莊法，" 一莊聯十，十莊聯百，由臺南聯至臺中，由臺中暗聯至臺北。僑至則協力攻僑，屢去則嚴查土匪。只待糧銅籌足，即約臺北同時並舉。"(吳質卿:《感事詩》注)臺灣抗戰有了轉機。但是財政狀況繼續惡化，八月間各軍已無晌，僅發伙食，到九月連伙食也沒有了。劉永福掃庫得銀八千兩解濟前線，途中被土匪劫去三千。劉永福派人向沿海督撫哭求援助，無一應者。他電質張之洞說:"諭福守兩月，俄即出援，今兩月有餘，南中幸無恙，今仍未見，何以戰守?" "乞為大局計，痛哭流血，乞設法救援，守走生死，望公一言為定。"張之洞回電說:" 守臺之舉，出自閣下義勇，鄙人並未置詞。至守臺兩月俄即來援之說，實系訛傳，鄙人並未發此電。或去或留，仍請閣下自酌，鄙人不與聞。自協濟晌械，屢奉諭旨嚴禁，萬不敢違。"(兩電皆見《張文襄公電稿》)這位保臺運動的策動者，為了自己的烏紗帽，翻臉食言了。劉永福仰天長嘆:" 內地諸公誤我，我誤臺民。"此電一傳開，市面上拒絕使用民主國的銀票，臺南經濟崩潰。蒼海橫流，更顯英雄本色。肖三發召集前線諸將商議，與其餓死，不如戰死，捨命奪彰化以求活路。這支衣衫檻縷的飢軍，肉搏攻城兩天，前仆後繼，黃榮幫倒下，林義成重傷。
十月上旬，日本為了避免引起國際干涉，決心一舉解決臺灣問題，調集陸軍五萬，戰艦三十多艘，實力與黃海海戰相當，分水陸三路進攻臺南。陸路從彰化南下，十月九日，臺南門戶嘉義陷落，肖三發陣亡，日近衛師團長能久親王也被擊斃。十日第二路日軍在布袋咀登陸，十一日第三路日軍在枋寮港登陸。日軍進攻臺南，遇到了黑旗軍和當地居民的頑強抵抗。日寇驚呼:"東南西北，到處無不戰鬥" 、"可稱為中日戰爭以來未曾有的勇兵。"(《臺灣抗戰日方資料》)但是敵我力量十分懸殊，戰線節節瓦解。侵略者叫囂說:"臺南四面已成鐵桶，不管劉永福如何強悍，插翼亦難飛了。"(《臺灣抗戰日方資料》)十九日臺南城絕食，劉永福移駐安平炮臺，仍親自發炮擊敵艦，但親信們已為他安排了出走計劃。二十晚城內亂起，劉永福急欲回城，部將們曰:"軍心散矣，各路倭兵又大至，此城萬不可守，請公去。" 公曰:"吾何以報朝廷，何以對臺民!"仰天推胸，呼號慟哭。部將陳樹南日:"天下多事，願公留有用之身，切勿留連。"(《昊質卿感事詩注》)左右遂擁劉永福上艇，乘英輪爹利士號駛向廈門。日艦兩次追來反覆搜查，在船主掩護下，劉永福僥倖脫險。時人詩曰"孤城無援計終盡，撥隊歸來氣亦雄。"
劉永福出走時，黑旗軍和臺灣義軍數千人還堅守在臺南北面的曾丈溪一線，在日軍的全線猛攻下，徐驥、柏正才、林義成血戰陣亡，王德林、簡精華突圍而出，不知所終，全軍玉碎。時人詩云:難嗚孤掌忿，風雨吊臺南。
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