相信大家都真的科研繪圖對於作者的SCI論文發表至關重要。
期刊編輯審閱投稿文章一般都是分為三步的，第一看文章總體排版，第二看標題摘要，第三就是看文章中的圖表。
專業能力強、研究成果也非常硬核，卻因為編輯嫌棄圖表太過凌亂，反覆修改還是被拒的小夥伴也不佔少數。
連著名物理學家牛頓都說要站在巨人的肩膀上，所以學習高分文章的精美圖片為我所用也可以算是一個取得成功的捷徑吧。
好了，廢話不多說了，接下來讓小編和大家一起分享高分SCI的圖形繪製方法吧！
Half Violin的繪製
小提琴圖（Violin plots）是箱線圖與核密度圖的結合，因其形態類似小提琴而得名。
箱線圖展示分位數的位置，小提琴圖則展示了任意位置的密度。
Graphpad Prism 8.0 Column下選擇Box and violin可以繪製小提琴圖：
Graphpad Prism不能繪製可視化數據點的分佈與概率密度共存的Half Violin。
Half Violin與雲雨圖相似，右側顯示數據點概率密度，左側顯示對齊的數據點：
Half Violin繪製步驟：
打開Origin2020軟件，在Book1中輸入數據：
選擇數據，菜單欄點擊Plot -> Statistical -> Half Violin：
得到Half Violin，右側密度圖中顯示mean與標準差（Standard Deviation）：
雙擊圖片進入Plot details界面下Plot properties，Group下設置Distribution Fill color為By one,顏色順序及細節可自行設置：
密度分佈填充顏色後效果如下：
接下來可對左側Symbol的符號形狀、Symbol顏色等參數進行設置：
File -> Export Graph導出圖片（快捷鍵Ctrl+G）即可。
Origin繪製桑基圖
桑基圖（Sankey Diagram）是一種特定類型的流程圖，圖中延伸分支的寬度對應數據流量的大小，通常應用於能源、材料成分、金融等數據的可視化分析。
最基本桑基圖只有左右兩個流向，Cell文章使用桑基圖很好的顯示了不同性別小鼠的內皮細胞的表型分類：
如果我們剛好有相似的細胞類別註釋數據需要展示，我們該如何繪製桑基圖呢？
1. 軟件準備
本次在Win10系統下使用Origin pro 2020繪製桑基圖。
Origin pro 2020可於OriginLab 官網下載：https://mail.hust.edu.cn/coremail/XT5/jsp/，
下載安裝軟件後需使用學校提供的以edu.cn結尾的郵箱進註冊激活。
2. 繪製桑基圖
示例數據為來自城市或鄉村的男孩或女孩的目標：
- 打開Origin pro 2020軟件，在Book1中輸入示例數據：
- 選擇A、B兩列，菜單欄點擊Plot -> Categorical -> Parallel Sets:
得到男孩、女孩分別來自城市/郊區/鄉村的桑基圖，顏色代表性別、分支的寬度對應數據量的多少，例如來自城市的女孩比男孩多：
選中A、B、C三列繪製桑基圖，一個非常實用的功能是Origin pro 2020會列出最近實用的圖表類型，因此我們可以很便捷的選擇Parallel Sets：
得到多流向桑基圖如下，顏色代表性別：
- 調整、美化圖片
設置分支顏色
雙擊圖片進入Plot details界面下Plot properties，得到的桑基圖默認根據性別Index: Col（A）顯示顏色：
Color List可以更改配色方案：
點擊Color List右側的鉛筆可以對Color List進行編輯：
在Color Options下可將顏色設置為由B列決定：
File -> Export Graph導出圖片（快捷鍵Ctrl+G），可設置導出圖片格式、寬、高與分辨率等：
相關性係數圖的繪製
繪圖工具為聯川生物在線繪圖，網址：http://www.lc-bio.cn/overview。
在繪圖下選擇相關性係數圖：
上傳數據後設置參數，相關性係數計算方法有pearson、spearman、kendall三種方法，：
得到相關性係數圖：
相關性係數在數據下載處可供下載：
下載得到數據的相關性係數如下：
導出圖片。值得注意的是網站可導出可縮放矢量圖形格式SVG：
擴展
如何使用Excel繪製相關性係數圖？
原始數據如下：
Excel下PEARSON(array1, array2)可以返回 Pearson相關係數r，這是一個範圍在 -1.0 到 1.0 之間（包括 -1.0 和 1.0 在內）的無量綱指數，反映了兩個數據集合之間的線性相關程度。
依次計算各組Pearson相關係數，以Demo_A與Demo_B的相關係數為例，其相關係數為0.983929（這與在線繪圖工具導出結果一致）：
各組Pearson相關係數計算完成後我們得到各組相關係數的數據：
開始 -> 條件格式 -> 色階，選擇紅白色階或自定義色階：
調整相關性係數圖寬度，效果如下：
視圖下不選擇網格線：
導出圖片即可。
今天給大家分享的科研繪圖就到此為止了，希望對大家有所幫助！
參考文獻：
Kalucka et al., Single-Cell Transcriptome Atlas of Murine Endothelial Cells, Cell (2020), https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.01.015
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