在上古新疆境內，還生活著其他一些種族的人，但有關這些種族的資料流傳下來很少，大致有以下這些種族。
車師人。從考古發掘上來看，車師人操突厥語系烏古斯語分支。古代車師人的種族還未完全研究清楚，頭骨上顯示高加索人種與蒙古人種的特徵，也就是兼具東方人和西方人特徵。但他們到底從何而來，經歷了哪些故事，都不得而知。
莎車人。目前關於這個種族的資料幾乎沒有。在三十六國中有一個莎車國，顧名思義便是莎車人建立的國家，但是《漢書》記載了這麼一件事情：莎車希望能和漢朝建立良好關係，便要求烏孫國解憂公主的兒子萬年去當莎車國的國王。這件事情後面詳述，這裡要說的是，萬年既然可以當莎車國的國王，那麼至少他們的語言是相通的，那麼莎車國居民應該是烏孫國內居民中的一種，烏孫族、塞族或者大月氏人。
漢人。在遠古時期，崑崙山北麓的和田玉就傳入了中原，相傳是通過大月氏人中轉傳到中原的，所以在那時候的書籍中把和田玉稱作“禺之之玉”。在秦朝李斯的《諫逐客書》裡，則稱作“崑山之玉”了，說明秦朝的時候人們已經知道和田玉的原產地是崑崙山了。我們可以設想，有中原漢人繞過大月氏人直接到了崑崙山下，買回了美玉，從此玉石之路上出現了漢人的身影。這種設想是完全可能的。另外，和田地區洛浦縣的山普拉古墓群出土的距今2800年以前的絲綢，精美異常，這說明早在張騫出使西域之前，就已經有絲綢從中原傳入到了塔克拉瑪干沙漠周邊，當時塔克拉瑪干沙漠周邊的人不但學會了養蠶抽絲，而且學會了紡絲。這種絲綢精美技藝的傳入，自然少不了漢人的功勞。
疏勒人。《魏書》記載，疏勒人六個腳趾頭、六個手指頭，但也會有變異，有時候生下來的孩子不是六個手指頭六個腳趾頭，就扔掉，不過看起來還是六指的多。這在之前的歷史中沒見記載。如果六指是真的，那麼疏勒人應該是一種獨立種族。
除了以上這些之外，大夏人、波斯人等恐怕也多少有一些，他們共同組成了新疆的遠古居民。
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