岡村寧次的軍事生涯基本都與中國相關，日本侵華的每一個步驟都有他的參與，稱他為“侵華日軍第一人”也不為過。在華期間，他曾帶領日軍組織數次掃蕩，大好的中國河山，荒冢累累，就是這樣一個壕無人性的戰爭罪犯，最後卻逃脫了審判，而且還搖身一變成了國民黨的顧問，這其中有著什麼樣的變故呢？
時間進入1945年，國民黨第四方面軍在司令官王耀武的指揮下，湘西會戰取得了雪峰山大捷，殲敵30000餘人。 中國共產黨的敵後戰場形勢也發生了巨大變化。從1944年起，八路軍、新四軍和華南抗日縱隊就先後轉入對日偽軍的局部反攻，僅這一年就作戰20000多次，斃傷日偽軍26萬人，收復國土80000平方千米。 至1945年春，中國共產黨軍隊已發展到91萬，民兵200萬，建立了19個解放區，面積達95萬平方千米，從而在全國範圍內形成了對日本佔領的大多數城市和主要交通線的戰略包圍。
國際方面，1945年5月8日，納粹德國戰敗投降，歐洲戰場戰事結束。蘇、美、英三國首腦為了處置德國，解決他們對歐洲及其他問題的安排，於7月17日至8月2日，在德國柏林郊外波茨坦舉行會議，通過了《波茨坦公告》。 在這個公告中，中、美、英三國要求日本立即宣佈所有武裝部隊無條件投降。日本軍國主義分子執迷不悟，他們只想著“本土決戰”，叫囂“一億玉碎”，對波茨坦公告置之不理。
1945年8月6日和9日，美軍在廣島、長崎投下了兩枚原子彈。日本本土受到重大打擊，日本國內陷入一片恐慌。 雖然大勢已去，岡村寧次仍想做垂死掙扎。9日，岡村寧次向部隊發佈訓示說：“蘇聯參戰早在預料之中。我數百萬精銳皇軍正嚴守皇土及大陸。必須發揮最大勇猛之傳統，為維護國體，保衛皇土，只有斷然決一雌雄。本官決意率百戰百勝皇軍之最精銳部隊，抱全軍玉碎之決心，誓將驕敵殲滅，以挽狂瀾於既倒。”
正當岡村寧次要帶領侵華日軍同中國軍隊決戰時，卻收到東京大本營密電，此文的核心內容透露了準備接受投降的實情。 看了這封電報，岡村寧次立即向陸軍大臣和參謀總長發了電報，要求拒絕《波茨坦公告》，繼續作戰。
8月8日，蘇聯正式對日宣戰。 8月9日，蘇聯紅軍150餘萬人，在華西列夫斯基元帥指揮下，以迅雷不及掩耳的攻勢，分四路突入中國東北的中蘇邊界，對關東軍發起全線總攻擊。 經過10多天的凌厲進攻，一舉打垮了侵佔中國東北多年的號稱“皇軍之花”的關東軍。在整個遠東戰役中，蘇聯軍隊共擊斃日軍83000多人，俘虜59.4萬人。
8月15日10時10分，岡村寧次接到了東京發來的關於“天皇陛下已決定接受《波茨坦公告》”的陸第六十八號密電。他心中頓時明白了，戰敗投降已成定局，除謹遵詔命外恐別無他策了。 11時過後，中國派遣軍總司令部2000餘名日軍官兵，按平時遙拜天皇的隊形，在南京市鼓樓廣場東面集合，聆聽天皇親自播講的投降詔書。
雖然投降的消息，岡村寧次早已知曉，但親耳聽見天皇裕仁宣佈這個“悲慘”的結局時，他仍禁不住悲痛與絕望。正當岡村寧次倍感絕望之際，收到了蔣介石的一封電令，命令他的部隊“暫保有武器及裝備，保持現有態勢，並維持所在地方秩序及交通，聽候中國陸軍何應欽總司令之命令”。
此時，蔣介石的軍隊大多在西南地區，蔣介石電告岡村寧次，為的是防止中國共產黨就近“得利”，依靠日偽軍先替自己看好地盤。日軍敗北，蔣介石的目標可要集中於“反共”了。 岡村寧次收到蔣介石的電令，心領神會，立即命令所屬部隊：“未得蔣統帥系統命令，對敵人的任何要求，堅決予以拒絕，必要時則採取武力行動。” 岡村寧次這個殺氣騰騰的“命令”，公然繼續把中國人民的武裝力量看做敵人。根據岡村的命令，被八路軍、新四軍圍困的日軍作困獸鬥，不但不投降，還使用了武力。
8月21日，岡村寧次按照國民黨受降主官、陸軍總司令何應欽的命令，先派他的副參謀長今井武夫乘飛機去湖南芷江城，談判投降事宜。
8月23日，今井武夫返回南京向岡村寧次作了彙報。 岡村寧次根據國民黨備忘錄的要求，迅速草擬了《和平後對華處理綱要》，堅決支持重慶中央政權的統一，關於移交武器、彈藥、軍需品等問題，要完全徹底地交付給重慶政府軍隊。
9月1日至5日，中國新編第六軍被陸續空運到南京。
8日，陸軍總司令何應欽上將進駐南京。中國方面特意選擇9月9日，在原國民黨陸軍總部大禮堂舉行受降簽字儀式。
上午9時整，何應欽宣佈受降儀式開始。首先，岡村寧次出示了日本政府出具的授權岡村寧次投降的證明書。然後，小林淺三郎從何應欽手裡接受受降書兩冊，轉身走回日方座位交給岡村寧次。 岡村寧次將受降書一一閱讀，手微微顫抖地簽了字，雖然對方是舊日相識，而且一貫親日，但還是由於心情慌亂，而將圖章蓋歪了。
何應欽接過受降書，代表中國戰區簽名蓋章，然後，宣佈受降儀式結束，命令日軍投降代表退庭，整個受降儀式僅用了18分鐘。當晚，岡村寧次即對所屬部隊下達了向中央軍各受降組官辦理投降事宜，交出武器、裝備的命令。
受降儀式的第二天，何應欽便率一些高級將領，與岡村寧次舉行了“親切會見”。何應欽對岡村寧次說：“對日戰事結束了，國共戰爭就要開始，我們對共產黨作戰困難不少，蔣主席說要請貴軍協助。” 岡村寧次馬上響應，說道：“我既受天皇之命向中國投降，就應該忠實地為中國政府效勞。”
10月21日，何應欽邀請岡村寧次舉行第二次會談。23日晨，蔣介石還親自出馬與岡村寧次會晤。這時的岡村寧次哪裡像個階下囚，儼然是一個座上賓了。
11月6日，國民政府在光復後的南京設立“戰爭罪犯處理委員會”。當月，中國共產黨在延安公佈戰犯名單，岡村寧次被列為第一號戰犯。1946年1月，遠東國際軍事法庭將岡村寧次和東條英機、松井石根等人一起列入戰犯名單。 岡村寧次知道後暗想，自己的“死刑也在所難免”。但蔣介石國民黨政府此時卻想方設法庇護他。
2月12日，何應欽派人轉告岡村寧次：“總司令部參議政府不以戰犯論。”這使岡村寧次懸著的心稍安下來。 不僅如此，在1946年6月國民黨軍隊挑起內戰後，在何應欽、湯恩伯等人的建議下，岡村寧次竟被秘密聘為國防部高級軍事顧問，以發揮他的所謂“軍事天才”。此前，岡村寧次有名的《剿共指南》就已被譯成中文後大量印發給國民黨軍各級指揮官。 這一年的年底，國民黨當局把他從南京薩家灣原日軍總部大院遷居到鼓樓以西金銀街4號，以隱其行蹤。
對這個侵華日軍的總頭目長期逍遙法外而且久無音訊，各界輿論紛紛向政府提出質問，國民政府一直以“此人目前仍任聯絡部長官，遣返僑、俘工作尚未結束”為由進行敷衍搪塞。而東京國際軍事法庭也曾幾次照會國民政府，要求岡村寧次出庭，國民黨當局照樣製造理由，搪塞過去。
1948年6月，迫於國際、國內的壓力，國民黨政府迫不得已，只得把岡村寧次交出來，在國內對其進行象徵性的審判。7月12日，岡村寧次接受法庭調查。8月9日，石美瑜庭長向國防部提出岡村寧次應扣押於戰犯監獄，終獲批准，岡村寧次被送進上海高鏡廟戰犯監獄。
8月23日上午9時30分，開始對岡村寧次公審。禮堂內座無虛席，外面廣場上也擠滿了人。開庭後，檢察官首先宣讀起訴書。 起訴書讀完，對被告人和證人進行庭審。當審判正在進行中，庭長石美瑜忽然接到南京來電，說岡村寧次案子暫停審理。18時30分，石美瑜在法庭宣佈：“今天只審不判，至此休庭。”全場愕然。 對岡村寧次一案的審判，就這樣又拖延了下去，岡村寧次在有關人員的安排下不久離開戰犯監獄。此後，國民黨親日派的要員，一個個都為使岡村寧次逃脫法網而奔走斡旋。
11月，在討論對岡村寧次的判決問題時，何應欽等極力主張無罪。11月30日，湯恩伯派人透露給岡村寧次一個好消息，說蔣總統同意對岡村寧次判無罪。
1949年1月26日10時，時隔5個月後，法庭又對岡村寧次進行第二次公審。這次公審規模甚小，只有新聞記者20多人參加。一套審理程序過後，庭長石美瑜面色苦澀地從公文包內取出兩份文件展示給眾法官，一份是代總統李宗仁和京滬杭警備總司令湯恩伯簽署的命令：“岡村寧次遣俘有功，法庭應該宣告其無罪。”另一份文件則是抄寫工整的判決書：“岡村寧次無罪。” 法官們目瞪口呆，面面相覷。這時，石美瑜才說明真相：“此案上峰已經決定，我已身不由己。” 石美瑜告訴不願簽名的法官們：“你們要不簽字，我也沒辦法。在隔壁房間裡，已有國防部派來的5位軍法官，在此等候。他們馬上可以接辦本案，宣佈重新審理。我們5人就到看守所去。” 法官們被迫在判決書上籤了字。這樣，當天16時，岡村寧次竟當場被宣佈無罪釋放。
國民政府公開袒護日本戰犯的罪行，引起全國人民的一致譴責。 由於此時蔣介石已宣佈下野，代總統李宗仁為爭取和談，下令重新逮捕岡村寧次，但時任淞滬警備司令的蔣介石的心腹湯恩伯卻將命令扣壓不發。湯恩伯還於30日上午10時，安排岡村寧次乘“維克斯號”輪船駛離上海黃埔港，逃回日本。這就是國民政府對一個雙手沾滿鮮血的中國派遣軍第三任總司令官的判決！ 不僅如此，國民黨在敗退臺灣後，企圖“重振旗鼓”，在臺灣成立了“軍事實踐研究院”，1950年，該院還聘請岡村寧次為其高級教官。
岡村寧次返回日本後，1955年6月，出任日本舊軍人組織“戰友聯盟”副會長，後改任“鄉友聯盟”會長、名譽會長，從事復活軍國主義的活動。這個曾對中國人民犯下不可饒恕罪行的戰犯，竟然被國民黨政府放虎歸山，逃脫懲罰，繼續從事反人類活動，這在整個第二次世界大戰中的盟國裡恐怕也是獨此一例。 直至1966年9月，岡村寧次才因心臟病突發去世。
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