16世紀至17世紀歐洲爆發宗教改革運動，由馬丁·路德、加爾文、慈運理、亨利八世等神學家與政治領袖發起，，創建了新教，在諸多方面新教和天主教有所區別，具體有以下幾點，
（一） 在經典方面，新教認為，《聖經》是教徒的唯一最高權威，而天主教則認為《聖經》只有經過羅馬教廷的解釋才能成為教徒的最高權威。
（二）在教義方面，新教不承認沒有《聖經》根據的天主教傳統教義——馬利亞、煉獄說，而天主教則主張馬利亞為天主之母和煉獄之說；新教主張“因信稱義”，信徒靠信仰與上帝直接交通，無須神父作中介，而天主教則強調信徒要與上帝交通，必須通過神父作中介；新教主張要破除羅馬教皇的絕對權威、永無謬誤，開展革新，而天主教則要維護教皇絕對的傳統權威和領導地位，保持原有的舊東西。
（三）在教規方面，新教無嚴格的教規制度，其活動方式較為靈活、開放，與各方面接觸和對話，而天主教則有嚴格的教規制度，其活動方式較為保守。
（四）儀式方面，舉行儀式時，新教教士在衣著裝扮上不強調一律，比較自由，有的教派教士穿聖袍、戴聖帶，有的教派教士只穿普通服裝（西服、中山服和其他服）就可以了，而天主教主教則要頭戴神帽，身穿神袍，胸掛十字架，手戴權戒。祈禱時，新教使用地方語言，而天主教則在長期內只能使用拉丁語言，現在偶而也使用地方語言，新教主張簡化宗教儀式，只承認2件聖事：洗禮和聖餐禮，而天主教則堅持繁縟的宗教禮儀——7件聖事。洗禮時，新教採用點水式或浸水式，而天主教剛採用注水式；
d）新教主張主教、牧師都可以結婚，反對獨身，而天主教則規定，主教、神父都不能結婚，必須“守貞潔”，終身不娶。
（五）在節日方面，新教只過聖誕節和復活節，而天主教則要過4大瞻禮——耶穌聖誕瞻禮、耶穌復活瞻禮、聖神降臨瞻禮、聖母昇天瞻禮。
（六）在教階制方面，新教一般無教階制，但少數派別如聖公會等保留有某些簡化的教階制，而天主教則有教階制，主要分3個等級：教皇、主教、司鐸（神父）
（七）在組織方面，新教在世界上沒有統一的教會中心，教會組織是分散的，各自為教，而天主教則有統一的教會中心和統一的領導。有一套完整的體系。被國際法承認就相當於一個主權國家，教宗通過聖座的各種行政機構管理天主教會。聖座由一系列複雜的機構組成，包括國務院、9聖部、3個教務法院、以及12個宗座理事會，這些機構被統稱為羅馬教廷。國務院由國務樞機卿領導，主要負責處理聖座和梵蒂岡城國的內部行政與外交事務。聖座中只有國務卿居住在梵蒂岡城中。其它機構則散佈在羅馬城中，並享有治外法權。
（八）在教堂式樣方面，新教的教堂外部式樣很一般化，內部裝飾極為簡樸，臺上只掛一個十字架，而天主教的教堂外部呈古典式（羅馬式或哥特式），內部佈置得格外華麗和莊嚴，臺上懸掛有聖母像，牆的兩側掛有耶穌受難像。
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