新城疫野毒(強毒型)的發病率和死亡率都可高達100%，但是臨床表現與病毒毒力、家禽種類及其易感性、環境因素、免疫狀況關係密切，尤其是部分遷徙鳥類可以攜帶強毒但並不表現出臨床症狀。加上病毒變異等原因，目前可能見到的多為非典型的新城疫症狀，單純的非典型新城疫發病率和死亡率都不高，在蛋雞上有的只表現為蛋殼異常、產蛋率下降等。能見到的出現一定死亡率的多是非典型新城疫與其它病原(大腸桿菌、支原體、球蟲、H9型禽流感等)混合感染的病例。強毒型的高發病率和高死亡率的病例鮮有發生。
一、非典型新城疫發生的主要原因
變異毒珠不斷出現，是導致非典型新城疫發生的主要原因。在實際養雞過程中，雞新城疫病毒在反覆的高免疫抗體水平的壓力下變異毒株不斷出現。這也可能與我們所用疫苗、用苗方法等有一定關係。
有研究證實，目前的商品疫苗，也存在對新城疫野毒已經不能產生良好的保護作用的情況，有必要研製新型疫苗來控制新城疫的傳播。
二、流行特點和表現症狀
儘管目前對雞新城疫採取了強制性免疫、撲殺、限用中等毒力疫苗(如I系活苗等)、生物安全措施保障等預防手段，但非典型新城疫還是成了雞新城疫新的流行趨勢。
發病時往往混合感染細菌和病毒， 比如大腸桿菌、支原體、H9型禽流感、傳支等。 經過免疫的雞群多發生在25-40日齡之間。主要表現為輕微的呼吸道症狀，食慾減少，產蛋雞主要出現產蛋率降低。2-3周後產蛋率恢復，但是沙皮蛋、軟蛋等劣質蛋數量增多，種蛋孵化率降低。發病嚴重者有明顯的呼吸道症狀如呼吸困難、甩頭、張口呼吸、綠色糞便增多等症狀，與其他一些呼吸道疾病如傳染性喉氣管炎、傳染性支氣管炎、慢性呼吸道病等病的症狀十分相似。低發病率和低死亡率是非典型新城疫的一個特點。發病率一般在10%-25%，死亡率在15%-35%，蛋雞產蛋率下降30%左右。有的單純性的非典型新城疫僅僅表現出輕微的不宜察覺的呼吸道症狀或者拉稀現象，混合細菌或者其它病毒感染後，發病率和死亡率均有所提升。
解剖只見少數出現胃腸變化，有時只見腸道壞死潰瘍，小腸淋巴濾泡凸起等，同小腸球蟲混合感染時還容易誤判，並不見腺胃乳頭出血、盲腸扁桃體腫大出血等系列的典型新城疫症狀。
三、防控措施
對於發生了新城疫的雞群一定要用疫苗緊急接種免疫，並且輔以藥物進行治療，木易推薦的獨敗和囊瘟康的配合使用對於治療新城疫有著很好的療效，速安對於控制細菌的繼發感染也有著可見的效果。
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