1、採收
採收時應選擇充分膨大、果肉厚而堅硬、果面光亮的綠熟果。採收時要捏住果梗摘下，防止果實受傷；最好用剪刀帶柄剪下，落園後可帶枝剪下或連秧拔起。將採摘的果實放入袋或墊有紙的筐裡，於普通房間或庫內放置1-2天，讓果柄傷口癒合。
2、防腐處理
採前10-15天將50毫克/升（50ppm）甲基硫菌靈（甲基託布津）或250毫克/升（250ppm）多菌靈噴於果實上，可防止或減輕青椒貯藏期的腐爛，採後貯藏前用2000毫克/升（2000ppm）甲基硫菌靈（甲基託布津）、1000毫克/升（1000ppm） 噻菌靈（特克多）、0.1%漂白粉藥液浸果3-5分鐘，若以上三種藥液中加50毫克/升（50ppm）2，4-滴則能更好的防止青椒蒂部腐爛。浸藥完畢，將果實晾乾即可貯藏。
3、 貯藏特性
青椒適宜的貯藏溫度為8-10℃，適宜的相對溼度為90%-95%。貯運過程中需採用包裝保溼，不可長期裸露。
氣調貯藏可推遲青椒後熟變軟，一般氧為2%-8%，二氧化碳1%-2%較為適宜。某些品種的青椒對二氧化碳氣體十分敏感，超過2%時會發生傷害，導致腐爛。
4、貯藏方法
（1）沙藏 : 在溝內、窖內或包裝容器內，用略溼（但手捏不成團）的沙子將青椒包埋用以保持果實水分、維持貯藏溫度，簡便易行。 一般在窖內挖深1米的溝，溝寬不超過1米，長不限，視貯量而定，一般為東西走向。果實在溝內散堆時，溝底部鋪5釐米略溼的沙子，上面均勻鋪一層經浸過50毫克/升（50PPm）仲丁胺的藥紙，其上再蓋2釐米厚的沙，將青椒果柄朝上碼於溝中，碼一層椒，撒一層沙，以蓋沒果實力度，如此方式碼4-5層椒，最頂層用約6釐米厚的溼沙覆蓋，溝頂上橫放秫秸或竹竿，再蓋草簾。也可以將果實裝筐，筐內用細沙層埋。
在菜窖和庫中，也可以在地上用沙埋藏，但也只能埋4-5層，堆大堆高時，果實產生的熱量不易排放，也不便於管理。貯量大時，可在窖中放置用木板做成長1.5-2米，寬、高各1米的菜架。用漂白粉或生石灰粉消毒後，在菜架上沙埋，方法與溝藏一樣，埋3-4層果實後，上蓋5-6釐米沙，最後用聚乙烯膜覆蓋，插上溫度計。貯藏前期，溫度高於10℃時，夜間打開窖或庫的門窗或通風口，同時揭開塑料膜降溫；白天關閉，以防溫度升高。天氣轉涼後，溫度差別不大時，只通過揭膜與蓋膜就將沙溫調在8-10℃，庫內溫度低時，還可採用覆蓋物保溫。
（2）氣調貯藏 :塑料袋小包裝氣調是將浸完藥晾乾的果實10千克裝入0.04-0.06毫米厚的聚乙烯薄膜袋中，紮緊袋口。每袋用直徑0.12毫米的針在膜表面戳孔25-35個，便於透氣，以防二氧化碳中毒。將孔朝上平放於菜窖地面或窖中菜架上貯藏。也可以做成小袋，每袋裝1千克青椒，松扎口，碼放架子上，以3-4層為宜，太高則相互擠壓，對貯藏的果實不利。通風窖在果實裝袋前就調至8-10℃，貯藏中窖溫的控制與前面相似，通過通風調節，半月左右抽樣檢查一次。平常管理中應隨時注意袋內果實的貯藏情況。
大帳氣調是將果實裝筐垛藏，垛底墊一0.02毫米厚的聚乙烯膜一塊，然後墊一層木頭或磚，上面垛5-6層筐，10-20筐為一垛碼成品字，便於通風排熱。垛最上層的筐上面蓋2-3層報紙，以防結露水滴在青椒上。氣調時，可用充氮快速降氧使氧達5%-7%，也可採用自然降氧法。每天應分析氧和二氧化碳含量，當氧低於2%，二氧化碳大於5%時，通入新鮮空氣調整氣體成分。最簡單的是帳不密封，並在帳上每平方米打1-2個直徑約0.5釐米的孔透氣，防止帳內二氧化碳過多，但這種方法帳內一般氧氣含量較高，起不到很好的氣調效果。每10-12天拆帳倒動，剔除腐病果，擦去帳壁水滴或換上新的幹帳。
（3）筐藏法:貯藏前，將蒲包洗淨浸溼，最好用0.5%的漂白粉浸泡消毒，瀝於後襯筐，裝果，碼入窖內，垛的表面也用溼蒲包片覆蓋，每7-10天倒筐檢查一次，同時更換蒲包，換下的洗淨、消毒，可以再用。溫度的控制方法與沙藏一樣。
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