慈禧太后的精神折磨其實是光緒 帝的主要病因，即便如此，我們卻不能說慈禧太后是直接謀害光緒帝的兇手，光緒帝也不是被人謀害而暴死的。因為從光緒二十五年前後，光緒帝的疾病突然惡化，日趨沉重，從未好轉。到光緒三十四年春季以後，已是病入膏肓，危在旦夕，不必他人謀害，也是必死無疑。這有光緒帝臨死前的“脈案”和他自書的“病原”等大量醫案可以作證。
如從御醫曹元恆在光緒三十四年三月初九日所寫的醫案內可知，光緒帝在臨死前半年內，病勢已十分嚴重，肝腎陰虛，脾陽不足，氣血虧損。在治療上已是寒涼藥及溫燥藥均不能用，醫生們已束手無策。到光緒三十四年五月，御醫陳秉鈞更在“脈案”上寫有“調理多時全無寸效”之語，說明御醫們對光緒帝的沉痾已無能為力。延及當年九月，光緒帝的病情更加複雜多變，臟腑功能已經全部失調，死亡只是時間問題了。
光緒帝本人對自己病情日益加重也十分著急，在他親書的“病原”中，一再指責御醫們無能。光緒三十四年五月二十六日，他因自己的病雖“屢易方藥仍屬加重”而斥責御醫們“總系藥不對症”和“草率立方”。七月初八日，他訴說自己：“病勢遷延，服何藥總皆無效，且一症未平，一症又起”。七月十七日，他責備禦醫“服藥非但無功，而且轉增，實系藥與病兩不相合，所以誤事！”八月初七日，他更申斥御醫是：“每次看脈，忽忽頃刻之間，豈能將病詳細推敲？不過敷衍了事而已。素號名醫，何得如此草率！”等等。這些斥責言詞反映出他當時焦躁絕望的心情。
當時的江蘇名醫杜鍾駿，在他所寫的《德宗請脈記》一書中，也對光緒帝的病情有詳細記載。杜鍾駿是在光緒三十四年七月以後，被徵召到京專為光緒帝治病的。他在七月十六日第一次入診後，立即對吏部尚書陸潤庠說：“我輩此來，本來是滿以為可以治好皇上的病，來博取微名，今天看來多半是徒勞無益，只能不求有功但求無過了。”可見早在此時，杜鍾駿就認為光緒帝的病已救治無望了。
光緒帝臨終時的病情，對於他的死因更能說明問題。從“脈案”來看，大約是在光緒三十四年十月十七日前後，光緒帝的病情進入危急階段。十六日這天，他出現了肺部炎症及心肺衰竭的臨床症候，危急萬分。第二天有三名御醫入診，其中就有杜鍾駿，他們一致認為光緒帝已是上盛下虛，元氣大虧，已經隨時都有生命危險。據杜鍾駿事後的描述，當時光緒帝氣促口臭，帶著哭聲問他：“你有何法救我？”杜問：“皇上大便如何？”光緒帝說：“九日不解，痰多氣急心空。”杜診斷出來，回到軍機處開藥方，藥案中有“實實虛虛，恐有猝脫”語。大臣們說：“你這樣寫病案，不怕皇上害怕嗎？”杜答：“此病不出四日，必出危險。現在不寫，將來一旦變出非常，我難負其責，所以不得不寫。”
到十月十九日，光緒出現胸悶氣短，咳嗽不斷，大便不通，清氣不生，濁氣下降，全身疲倦乏力的症狀。(醫案：“中氣虛損，不能承領上下，以致上而逆滿喘咳，下而大便不行。清氣不升，濁氣不降，而通體為之睏乏矣！”)此時，御醫們一致“甚感棘手”。到二十日，光緒已經是眼皮微睜，流著口水的嘴角輕輕顫抖。(醫案：“目瞼微而白珠露，嘴有涎而唇角動。”)這是現代所謂的中樞神經症狀，說明已危在旦夕。當天夜裡，光緒開始進入彌留狀態，肢體發冷，白眼上翻，牙關緊閉，神志昏迷。(醫案：“脈息如絲欲絕。肢冷，氣陷。二目上翻，神識已迷。牙齒緊閉，勢已將脫。”)到了二十一日的中午，光緒的脈搏似有似無，眼睛直視，張嘴捯氣兒。(醫案：脈息“若有若無，目直視，唇反鼻扇，陽散陰涸”。)夜半，光緒帝進入彌留狀態，延至酉刻，終於“龍馭上賓”，與世長辭了。
從現代醫學上來分析，光緒帝主要是肺結核、肝臟、心臟及風溼等長期慢性消耗性疾病，導致了抵抗力的下降，出現了多系統的疾病。其直接的死亡原因，可能是心肺功能的慢性衰竭，合併急性感染所造成。從光緒親書“病原”及其“脈案”所載的病因病狀及死狀來分析，他自病重至臨終之時，其症狀演變屬於進行性加劇，並無特殊異常症狀出現，既無中毒或其他傷害性的徵象，也沒有突然性暴亡的跡象，應該是屬於正常的病亡，並非慈禧太后加害。但巧合有時恰恰反映了歷史的宿命，光緒皇帝就是命中註定一輩子也走不出慈禧太后的陰影。
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