尼泊爾與克欽人CTS5308樣本存在差異

尼泊爾與克欽人CTS5308樣本存在差異

2016年,美國芝加哥大學人類遺傳學系、美國俄克拉荷馬大學人類學系、瑞典烏普薩拉大學組織生物學系和瑞士蘇黎世大學進化醫學研究所的研究者,在國際知名學術期刊《美國科學院院報》(PNAS)上刊發論文,報道了他們對一組尼泊爾古人的全基因組測序分析結果。

基因科普|尼泊爾與克欽人CTS5308樣本存在差異

此前,大美基因數據分析平臺此前曾分析1例約1500年前和1例最早約3150年前的古代樣本,二者均屬於藏緬語系族群的基因型大簇CTS5308。

此後,我們有分析了1例NCBI下載編號為ERR3268624的泰國北部藏緬語系族群克欽人樣本,也屬於基因型CTS5308。那麼,三個樣本之間的親緣關係如何呢?大美基因內測中的私有突變比對器對該三例樣本進行更深入的分析。

經分析,在研究者Poznik報到的可信Y染色體區間中,我們發現,尼泊爾3000年前和1500年前樣本攜帶至少4個潛在的家族性突變,或可定義一個新的尼泊爾CTS5308支系。

基因科普|尼泊爾與克欽人CTS5308樣本存在差異

在這4個突變中,其中一個曾在R1a基因型樣本中測到過,標記為Y70027,另外3個突變,未見其他機構在Isogg數據平臺報到。

俄羅斯數據分析平臺Yfull對CTS5308樣本最近共祖年代的估算為距今5200年前,當前全球測序樣本包括北京、甘肅、雲南的中國樣本,印度東北特里普拉邦樣本和日本樣本。

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CTS5308是藏緬語族群的核心標記,屬於F5基因家族的重要分支。緬語語族,語言系屬分類上屬於漢藏語系,根據2009年《民族語》的資料,目前有435種語言被歸為這一個語族。

該族主要分佈在中國西南某些省份,比如中國西藏、印度東北、以及尼泊爾、巴基斯坦、不丹、緬甸、泰國、越南等國家。

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參考文獻

Long-term genetic stability and a high-altitude East Asian origin for the peoples of the high valleys of the Himalayan arc



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