在水稻生長髮育的不同階段，其需水量是在變化的；稻田水量多，水位保持時間長，對小龍蝦的生長是有益的，但對水稻生長卻不利。稻田養殖小龍蝦，水稻需水和養蝦需水是一對主要矛盾。所以，做好水位調節是稻田養殖小龍蝦的重要一環。
早期肥水可以促進藻類的繁殖，培育浮游動物，為苗提供開口餌料；豐富藻類可調節水體透明度，避免陽光的直射，控制青苔的生長。EM菌配合有機肥，養殖前期使用，有益菌分解有機質，為水體藻類提供充足的養料，促進藻類繁殖。
酵之源，進口菌種，半乾溼麩皮包裝，麩皮作為肥水有機物，活菌自己發酵便宜還新鮮，菌液pH能降到3左右；關鍵還便宜，畝成本1元錢。
1、在小龍蝦放養初期，田水宜淺，可保持在15釐米左右，隨著小龍蝦的不斷長大和水稻的抽穗、揚花、灌漿，兩者均需要大量的水，可將田水逐漸加深到30～35釐米。
2、在水稻有效分櫱期採取淺灌，保證水稻的正常生長。
3、在水稻無效分櫱期，水位可調節至30釐米，既可促進水稻的增產，又可增加小龍蝦的活動空間。
4、水稻烤田要輕烤或短烤，烤田時使蝦溝內的水位保持在低於大田表面15釐米即可，確保大田中間不陷腳，田邊表土不裂縫和發白，以水稻浮根泛白為適度。烤田結束後，立即恢復原水位。
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