今天是生信星球陪你的第487天
大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~
就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~
这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我!
花花写于2019-11-18
抱歉前两天的关键词”富集输入“,由于我晚上临时出去,所以上传晚了,我补上了哈,这一篇:
对不起,过纪念日去了,没学习,来点富集分析给大家补营养
今天的内容是,话说有个大佬,他开发了一个牛批的新包。
为啥子开发新包
这要从两个牛批的老包说起。
dplyr
先科普一下dplyr,是Rstudio首席科学家hadly大佬的包包套装tidyverse里最能打的一个包,将基础包$,[ ]这类乱码式的语法变得可读性更好,复杂的功能简单化,大大减少初学者的学习成本,是我的真爱
氮素,被吐槽的比较厉害的是处理大数据的速度(小的数据就憋说了,速度不重要)。
data.table
其实data.table里面我只用过fread这个函数读取数据,非常能打,又快又智能,也是我的真爱。但他的语法就不如dplyr优秀了,大佬专用系列~
有人整理了data.table和dplyr包的对比:
还有两张截图就不放了。
对于这两个包的优秀程度,从我以前写的这两篇笔记可见一斑:
写给零基础同学的R语言第四篇教程-神奇R包dplyr
超有诚意的R语言数据读取指南(长文慎入)
pia的一下双剑合璧了
大佬冲冠一怒写了个新包出来,把他俩双剑合璧了!登上CRAN的时间市11月12号,下图市他的介绍现场。
他明明是个实力派,但是颜值跟PPT都不允许啊。
放张大图,如果看到这里你已经看不懂了,就去文末看图舔屏吧。
dtplyr肿么用?????
吹爆,首发介绍的博客地址是https://www.tidyverse.org/blog/2019/11/dtplyr-1-0-0/
最基础的用法灰常简单:
加载
library(data.table)
library(dtplyr)
library(dplyr, warn.conflicts = FALSE)
懒蛋表格?
✨重点是将你的tibble数据结构改一下:
mtcars2 class(mtcars2)
## [1] "dtplyr_step_first" "dtplyr_step"
具体改成了啥类型不打紧,重要的是改这么一锤子,就能提速了!
假装还在用dplyr:
下面的语法还是dplyr的语法,但其实已经被翻译走啦,速度杠杠的:
mtcars2 %>%
filter(wt < 5) %>%
mutate(l100k = 235.21 / mpg) %>% # liters / 100 km
group_by(cyl) %>%
summarise(l100k = mean(l100k))
博客里面,后面的代码是大佬为了表示提速了他很膨胀,就不用演示了,直接上结果:
差别不在一个数量级啊!!!!
是他,是他,就是他!我的偶像,大佬哈。长得这么好看,又优秀又努力,还能不能给别人留点活路了~
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