21世紀的東京某個地方有一間古老的神社，神社住著一家人，其中有一個女孩叫日暮戈薇。某天戈薇正要去上學，看見弟弟在不讓人出入的自家祠堂裡，原來是在找家裡的貓咪小胖，小胖掉到了祠堂裡的古井旁邊，戈薇決定去黑漆漆的古井附近尋找小胖。小胖回來了，古井裡卻開始躁動，突然伸出一隻手將戈薇拽下了井。
這隻手的主人是一個名叫百足妖婦的妖怪，為何在21世紀的井裡會妖怪這種生物？正在戈薇不知道該怎麼辦的時候，她的身體突然出現一股力量將妖怪給擊退了，這令戈薇感到奇怪。她想立馬逃出井底，便自己向上爬，爬出井的那一瞬間卻發現周圍不是自己家的祠堂，而是一片森林。雖然看見了自己家裡的御神木，但只見到了被箭封印在樹上的一個紅衣銀髮長著犬耳的少年。
看到少年的戈薇被少年的耳朵吸引暫時忘掉了自己的疑惑，好奇地捏了捏少年奇異的耳朵，這位少年就是半妖犬夜叉，此時的犬夜叉正被另一位女主桔梗封印著，這個封印牽扯著各種愛恨情仇。戈薇還在好奇少年的時候，突然出現的村民向她射了幾隻弓箭，並把她當做不明的有害生物抓了起來。
原來戈薇意外來到的這個世界是以前的戰國時期，也就是說戈薇穿越了時空，而這一切與一個東西有關——四魂之玉，它能讓妖怪增長妖力。四魂之玉以前的守護者是巫女桔梗，在這個時代的50年前桔梗逝世，將四魂之玉也一併焚化，戈薇是桔梗的轉世，四魂之玉因此就在戈薇的身體裡，而戈薇的到來，將會帶來一場妖怪的混亂。
離開了古井並沒有安全，百足妖婦依舊追了過來，這時候的戈薇還不知道自己身體裡有四魂之玉，只能帶著害怕和疑問拼命地逃跑，跑到古井邊犬夜叉這裡。沉睡中的犬夜叉嗅到了戈薇身上的桔梗氣息，以為是桔梗，居然自己甦醒了，甚至挑釁戈薇。百足妖婦追過來將戈薇與犬夜叉綁在了一起，拿走了戈薇身上的四魂之玉，迫不得已，戈薇不顧村民的阻攔將封印犬夜叉的箭拔掉，給了犬夜叉自由，但也因為這樣他們才得救。
戈薇以為犬夜叉是英雄，卻沒想到犬夜叉也想要四魂之玉，充滿正義感的犬夜叉和想擁有四魂之玉的犬夜叉讓人感到矛盾，而這一切就來源於50年前的犬夜叉和桔梗之間解不開的愛恨情仇，犬夜叉到底是好人還是壞妖？犬夜叉和桔梗之間又發生了什麼？90後的同志們一定知道答案。
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