4月15日，美国首都华盛顿所在的哥伦比亚特区市长穆里尔·鲍瑟下令将紧急状态延长一个月，因为该地区的病例迅速增长。美国首都的联邦官员预计，华盛顿、马里兰州和弗吉尼亚州将出现类似纽约的流行病，这可能会使政府陷入瘫痪。如果情况失去控制，美国将不得不考虑从华盛顿撤离关键的政府机构。而早在3月份，美军就已经启动了一个负责疏散华盛顿的秘密特遣部队。
这支部队就是“国家首都地区联合特遣部队”(JTF-NCR)，它在3月16日启动，其使命是在陆地、空中甚至海滨“保卫”华盛顿，包括面对武装攻击该怎么办，从保卫华盛顿的天空到准备应对首都引爆核武器可能引发的内乱。他们还肩负着政府最敏感的任务，即如果有必要，还会将白宫和其他关键政府办公室转移到其他地点。
自从国民警卫队开始在全国范围内启动以来，五角大楼官员一直坚称，身穿制服的男女不会执行秘密任务，也不会执行强制隔离的措施。在表面上，国民警卫队仍处于各州州长的严格控制之下，而联邦军队则支持联邦应急管理局(FEMA)等民事机构。然而“国家首都地区联合特遣部队”却不是如此。该部队下辖1万多名军警人员，不听从州长命令而是直接向国防部长报告。而且它的一些部队已经处于一周7天24小时戒备状态，完全隔离在基地中，随时准备出动。
“国家首都地区联合特遣部队”在3月16日启动后，指挥官是奥马尔·琼斯少将（上图左）。琼斯少将的战场在美国法律中被定义为“国家首都地区”，包括哥伦比亚特区；马里兰州的乔治王子县和蒙哥马利县；弗吉尼亚州的阿灵顿、费尔法克斯、劳登和威廉王子县；以及该地区外部边界内的所有城镇。也就是说该部队直接负责联邦政府270多个联邦部门和机构、880多个政府所有和租赁的设施以及近30万联邦工作人员。
琼斯少将有超过10000人的部队。他最大的部队，是第三步兵团，也被称为“老卫兵”，通常为无名士兵墓前站岗和举行葬礼。但启动JTF-NCR后，第三团恢复了其真正的保卫和保护国家首都地区的责任。除了第三团以外，琼斯少将麾下还有十几个或更多的专业部队，所有部队都被分配到JTF-NCR下执行首都地区任务。它们包括：
海军陆战队化学生物事件响应部队(CBIRF)，这是一个专业单位，能够在发生化学、生物、辐射、核或高当量爆炸事件后，向白宫、美国国会警察和特勤局提供“迅速而有力的支持”。两支下属的初始反应部队(IRF)各分配约150名人员。一个IRF保持24小时不变的警戒状态，第二个IRF小组能在48小时内部署。
陆军特别反应小组(SRT)，这是一支军警混搭的特种部队，主要人员包括自第289宪兵连和第947宪兵支队的人员，第3步兵团的精锐步兵，来自基层紧急服务局以及华盛顿特区、马里兰州和弗吉尼亚州警察局的特警。还有一支专门的“技术救援”部队，911工兵连，能够进行城市搜救，甚至在白宫遭到袭击后的瓦砾中挖掘洞穴进行营救。
陆军航空旅，包括第12航空营，陆军优先空运支队，以及现在部署的伊利诺伊州国民警卫队第106航空营。其他直升机疏散单位包括为总统提供“海军陆战队一号”直升机的大型海军陆战队部队HMX-1，以及安德鲁斯空军基地的空军第一直升机中队。这些直升机将被用来疏散从军队首脑到白宫的所有人，就像空中紧急救护车一样把它们送到疏散地点。
目前疫情中其他州的国民警卫队，是根据“第32条”命令启动的。这意味着在州长控制下，但由联邦政府支付费用。第106航空团的国民警卫队士兵是根据“第10条”命令激活的，这意味着他们要服从联邦的命令，就像他们将被送往阿富汗或伊拉克一样。只是在这种情况下，战场是华盛顿特区。
该部队的安全总部和指挥中心位于由华盛顿西南部博林空军基地一座名为联合防空作战中心的两层高的面积达到2千平方米的堡垒。这个中心平时的任务是保护首都上空的安全，负责指挥拦截飞机和地对空导弹部队。而现在它被JTF-NCR接管了。目前JTF-NCR控制着华盛顿特区的天空，华盛顿周围战斗机保持戒备状态，准备在几分钟内起飞。所有战斗机飞行员几乎处于隔离状态。
如果情况极为严重，琼斯少将将执行“联合紧急疏散计划”(JEEP)，这是一项将国防部官员转移到华盛顿地区以外替代地点的国家计划。这并不是唯一的计划，还有疏散立法和司法机构撤退的ATLAS计划。在这两个计划之上是高度机密的八角形、雷霆穿梭和黄道十二宫计划，用于处理其他紧急情况，包括疏散白宫和其他总统继任者的行动。
