英國劍橋學者揭示新冠病毒演化起源？這件事中國學者2月份就做了
騰訊醫典 2020-04-13
晨霧 / 轉帖
一場新冠病毒疫情，始於2019年年底，結束似乎還遙遙無期，還有愈演愈烈之勢。
但是，這次疫情源頭是哪兒，一直備受關注。
近日，一項來自劍橋大學遺傳學家彼得·福斯特（Peter Forster）博士團隊的研究引發熱議，他們從新冠患者分離的第一批160個完整基因組序列分析發現，新冠病毒起源可能來自美國和澳大利亞，而不是中國武漢患者。
（劍橋大學新冠病毒進化研究引發爭議。來源：劍橋大學官網）
無獨有偶。4月10日，國家衛健委高級別專家組成員、中國疾控中心流行病學首席科學家曾光教授接受媒體採訪，談及海外疫情時也表示：“如果（疫情）沒有控制住，只能說明兩個問題：一是可能除了武漢以外，還有別的源地，我們沒有發現，也許在國外還有；另一個問題，也許是因為他們防疫措施不到位。”
（曾光教授判斷，病毒源頭不排除來自國外的可能性。來源：中新視頻）
新冠病毒的來源，已經成了一個“燙手的山芋”，它到底來自哪裡，我們一起來看看。
新冠病毒源自哪裡？
3月30日，劍橋大學研究人員在《美國科學院院刊》(PNAS)以“Contributed”（ 注：Contributed是PNAS的一種機制，即可通過院士內推發表論文。）的形式發表了一篇針對病毒溯源的研究，他們發現全球的新冠病毒已經變異為A、B、C三種類型，並且這三種類型的病毒在全球分佈範圍各不相同[1]。
（英國劍橋大學研究人員關於新冠病毒進化的研究快速發表。來源：PNAS官網）
仔細看來，這篇論文沿用了中國武漢病毒研究所石正麗團隊發現的BatCovRaTG13病毒[2]（即新冠病毒在動物中的”祖先”）作為源頭，從“全球共享流感數據倡議組織”（GISAID）中提取了160個世界各地的新冠病毒組成了系統進化網絡。
（通過全球不同地區來源新冠病毒基因組做出的進化樹。來源：劍橋團隊研究[1]）
A群新冠病毒，是在人類社會里傳播的最原始的病毒，上圖可以看出：A群在中國、東亞、美國、澳大利亞、歐洲均有分佈。
這項進化分析研究的作者將A群分為了兩個亞群：
T-等位基因亞群中，有4箇中國人（來自中國廣東省）帶有祖先基因組，而3名日本人和兩名美國病人則有許多突變，據報道，這些美國患者有曾在武漢疑似疫情暴發地的居住史；
C-等位基因亞群，其中包括來自武漢的5個人（有兩個攜帶祖先基因），另外8個來自中國其他地區和鄰近國家的東亞人，該亞群有近一半（15/33）主要位於美國和澳大利亞。
(劍橋新冠病毒進化研究對病毒起源的分析。來源：劍橋團隊研究[1])
B群新冠病毒，被認為是通過A群突變而來，分佈以亞洲為主（93個裡面佔74個），中國武漢22例，東部其他地區31例。較早的B群完全在東亞傳播（共26個），但是亞洲以外的每個B群都進化出了突變（共19個），作者認為這種現象可能不是因為B群在中國傳播而自然發生的突變導致的，而是因為B群本身適應了亞洲人群，需要再次突變以適應歐美人群。
而C群冠狀病毒被認為是B群突變而來，在中國大陸不存在，主要在歐洲分佈（11例），新加坡有5例，中國香港、中國臺灣和韓國也有。
該論文作者還討論了病毒在歐美的傳播鏈條：
巴西的第一例病人是訪問意大利後感染的，其病毒屬於C群；
墨西哥的病毒也是意大利起源的，是2020年2月28日在墨西哥的意大利旅行者身上被檢測出來；
意大利的病毒源頭是德國，一位在慕尼黑Webasto公司工作的員工。
結合上述信息，這篇論文本身並沒有回覆大家都關心的問題“新冠病毒是起源於美國，還是中國”。
據悉，作者已經更新了他們的樣本至1000例，但目前尚未通過同行評議發表出來。
而後，論文作者Peter Forster博士接受了環球時報耿直哥採訪表示[3]，不論是哪篇論文，目前仍無法就病毒的來源地給出一個明確的答案。
他對A族群的分佈問題，也做出了回應：
“為何A型病毒並沒有在武漢和中國大範圍地出現，這可能是因為A型並不適應當地人的免疫系統，所以才變異成了B型。但也可能是因為，武漢當地更多的病例是由B型感染者傳染出去的，即遺傳學上的“奠基者效應”（founder effect）。”
至於A型為何更多出現在美國和澳大利亞，他認為這有可能是因為A型更適應那裡人的免疫系統。
但是，A型在武漢出現過，感染過一些武漢人，也感染過有武漢居住旅行史的美國人。
所以，從現有證據來看，美國的A型病毒仍然可能是從武漢居住史這個途徑過去的。而並不是有些人猜測的“起源於美國”。
（Peter Forster博士回應耿直哥採訪原文。來源：環球時報評論[3]）
“病毒源自美國”真的實錘了嗎？
事實上，關於病毒的起源，我國的學者也發佈過不少論文，劍橋大學這篇研究幾乎是在重複我國學者的工作。正如歐美的防疫，一步步驗證了我國已經驗證過的問題（比如戴口罩、加強隔離等）。
2月21日，國內的預印本網站ChinaXiv上曾發表過一篇論文，也是將新冠病毒分為了三個族群。
（國內學者2月份發表的新冠病毒進化傳播研究。來源：ChinaXiv[4]）
當時，這篇論文主要的熱點集中在破除了“病毒源自華南海鮮市場”的認知，但我們仔細閱讀下來就會發現，劍橋大學的研究幾乎和該論文如出一轍。
（國內學者2月份新冠病毒進化傳播研究裡的全球分佈地圖。來源：ChinaXiv[4]）
可以看到，同樣的有A、B、C三個族群，不過我國學者是以B群為最早期的病毒群；
而後來我國學者這篇論文，被臺灣某節目引用論述是否源自美國而大火，騰訊醫典此前也曾專門做過解讀：
美國雖然有更多的病毒種類，但是基本上都與中國患者有關：患者要麼到過中國，要麼在中國以外的國家接觸過中國的患者。
（美國確診病例分佈和溯源。來源：美國CDC[5]）
因此，分析了這麼多，源頭到底是哪兒？目前暫未可知。
不過，從越來越多的研究追溯發現，中間宿主可能是分佈在東南亞國家的馬來西亞穿山甲，病毒的起源可能不是中國。
尋找真正的源頭是科學問題，也是讓類似的疫情不會再次上演的重要因素，我們就讓子彈再繼續飛一會吧。
參考文獻
[1] Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, et al. Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes. PANS. 2020.
[2] Zhou P, Yang XL, Wang XG, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020, 579(7798):270-273.
[3] 環球時報新媒體. 《這篇論文，能說明“病毒並非來自中國，而是美國嗎”？》
https://view.inews.qq.com/a/20200411A0627T00
[4] Yu WB, Tang GD, Zhang L, et al. Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data. ChinaXiv. 2020:202002.00033.
[5] https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-in-us.html
【主創團隊】
編輯：葉正興、王鳳靈、喬輝
排版：周舟
運營：吳家翔
統籌：張寧
信息來源：2020-04-13 騰訊醫典
https://xw.qq.com/cmsid/20200413A04BHX00
