南方科技大學郭紅衛發現22-nt siRNA的生物學功能及產生機制

小干擾RNA(siRNA)對於真核生物的正常發育和免疫力至關重要。

植物產生的siRNA的長度為21、22或24個核苷酸。21和24個核苷酸分別介導信使RNA的切割和DNA甲基化,但22個核苷酸的siRNA的生物學功能仍然未知。

2020年4月29日,南方科技大學郭紅衛團隊在Nature 在線發表題為“Plant 22-nt siRNAs mediate translational repression and stress adaptation”的研究論文,該研究報告鑑定和表徵一組由植物中的DICER-LIKE 2(DCL2)蛋白產生的內源性22個核苷酸的siRNA。當胞質RNA衰變和DCL4不足時,由此形成的22個核苷酸的siRNA的大量積累會引起多效性生長障礙,包括嚴重的侏儒症,分生組織缺陷和色素沉著。

值得注意的是,編碼硝酸鹽還原酶的兩個基因NIA1和NIA2產生了將近一半的22個核苷酸的siRNA。產生22個核苷酸的siRNA會觸發基因沉默的擴增,並導致基因特異性和整體性的翻譯抑制。此外,這些22個核苷酸的siRNA優先在環境脅迫下積累,尤其是那些源自NIA1 / 2的siRNA,它們起著抑制翻譯,抑制植物生長和增強脅迫反應的作用。因此,該研究揭示了22個核苷酸的siRNA的獨特特性,並揭示了它們在植物適應環境脅迫中的重要性。


南方科技大學郭紅衛發現22-nt siRNA的生物學功能及產生機制


小RNA(sRNA)由不同的蛋白質產生,具有不同的長度,並通過不同的機制對細胞產生作用。通常,由Dicer家族的蛋白質將由依賴RNA的RNA聚合酶和髮夾微RNA(miRNA)的前體產生的細胞雙鏈RNA(dsRNA)的前體裂解為20-24核苷酸(nt)sRNA雙鏈體。sRNA雙鏈體的一條鏈被加載到Argonaute(AGO)蛋白中,形成RNA誘導的沉默複合物(RISC)。


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破壞細胞質RNA衰減和DCL4會觸發22nt siRNA的大量生產,並導致生長障礙(圖源自Nature )


擬南芥基因組包含四個Dicer樣(DCL)蛋白,DCL1至DCL4,具有多種作用。DCL1是miRNA生物合成所需的主要DCL蛋白,miRNA靶向同源RNA進行切割和/或翻譯抑制。DCL3將dsRNA前體裂解為24-nt siRNA,後者參與RNA定向的DNA甲基化。DCL4是產生21個核苷酸的siRNA所需的,指導mRNA的切割。人們認為DCL2調節病毒22-nt siRNA的生物發生。


儘管21-和24-nt siRNA的作用已廣為人知,但內源性22-nt siRNA的缺乏極大地限制了它們的研究。在這裡,該研究通過使用產生大量此類分子的遺傳突變體,探索了22-nt siRNA的生物學作用和調控機制。


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22-nt siRNA抑制mRNA翻譯(圖源自Nature )


在這裡該研究鑑定和表徵一組由植物中的DICER-LIKE 2(DCL2)蛋白產生的內源性22個核苷酸的siRNA。當胞質RNA衰變和DCL4不足時,由此形成的22個核苷酸的siRNA的大量積累會引起多效性生長障礙,包括嚴重的侏儒症,分生組織缺陷和色素沉著。


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22nt siRNA抑制翻譯模型及其在植物逆境適應中的作用(圖源自Nature )


值得注意的是,編碼硝酸鹽還原酶的兩個基因NIA1和NIA2產生了將近一半的22個核苷酸的siRNA。產生22個核苷酸的siRNA會觸發基因沉默的擴增,並導致基因特異性和整體性的翻譯抑制。此外,這些22個核苷酸的siRNA優先在環境脅迫下積累,尤其是那些源自NIA1 / 2的siRNA,它們起著抑制翻譯,抑制植物生長和增強脅迫反應的作用。因此,該研究揭示了22個核苷酸的siRNA的獨特特性,並揭示了它們在植物適應環境脅迫中的重要性。


參考消息:

https://doi.org/10.1038/s41586-020-2231-y



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