五朵山是久負盛名的中原道教聖地；二十世紀初，旅遊開發者在五朵山東麓重修廟宇道場和建造並完善旅遊設施 ，成為今天的4A級旅遊景點。
旦凡聖地名勝，人們都愛好考究它的歷史成因；五朵山及其道觀，南陽也有許許多多不同的說法；有的說它始於西漢，有的說始於東漢，更有的說是老子修煉的場所……。只有傳說，而缺乏依據。
據文獻記載，《山海經》稱五朵山為依帝山，但這部先秦古典著作中看不到有類似“道觀”方面的隻言片語；北魏酈道元稱五朵山為岐棘山（見《水經注》，）；北宋樂史《太平寰宇記》稱五朵山為騎立山；明代開始才稱此山為五朵山，據《明嘉靖南陽府志》記載，五朵山五峰並歭，聖朵、禪庵朵、摩雲朵、嬌女朵、啞女朵摩肩而立，故稱五朵山，自此五朵山名沿襲至今。
唐貞觀年間，太宗李世民崇奉道教，著名道人吳筠隱居五朵山，後被太宗召見，始在此山建廟，民間以此廟為祈雨之地，頗為靈驗，漸有名聲；這也只是傳說，不過，太宗崇奉道教，吳筠隱居此山倒是真的。
宋朝乾德四年（公元966年）有碑記：稱此山廟為騎立山龍堂；元朝泰定三年（公元1326年）有碑記：稱此山廟為嘉顯候廟；明代《英烈傳》中有朱允炆避難五朵山的說法；說建文帝朱允炆下野後輾轉至五朵山聖朵，在南召太山廟天寶觀出家的著名道人張三丰慕名主動到五朵山相救，共同弘揚道場，自此，稱五朵山為“北頂”，又稱祖師頂、金頂。朱允炆與張三丰後又南下武當山，創建廟宇，被稱南頂；南頂與北頂遙相咉暉，兩地香火一樣，民間有祖師爺“日不離武當，月不離五朵”的說法。
清乾隆《南召縣誌》收錄了明成祖朱棣的《訪張三丰書》，這道御書是想通過張三丰探尋建文帝朱允炆的下落，可以奉為信史。
清代統治者重佛輕道，但南陽民間仍尊奉道教；“朝奉北頂”成為民間重要的祭祀活動。
清光緒九年（1883年），地方人士主持擴修五朵山祖師廟，將真武行宮改大規制，修建聖公聖母殿，均為銅梁鐵瓦，周圍圍以石牆，構成城中之城；其下部建有清牛宮、玉皇殿、老母殿等殿堂，並有道房數十間。民國時期，五朵山道觀均有續建。
1958年大躍進時期，道觀的銅梁鐵瓦被拆，用於鍊鋼鐵桿；文革時期，五朵山道觀遭到進一步毀壞。
1978年改革開放以來，宗教政策得以落實，道教活動恢復，五朵山道觀成為河南省重點道觀之一。1993年，南召縣人民政府頒發聘書，禮聘全國政協常委、中國道教協會會長、中國道教學院院長、著名道人閔智亭任五朵山道觀名譽道長，（閔智亭，南召縣城關鎮人，）
從此，五朵山以道觀名勝和名山秀水為主題的旅遊開發興起，不僅為全國民眾提供了旅遊的好去處，同時，也給五朵山下的群眾脫貧致富帶來了極大的幫助。
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