我们从哪里来？我们要往哪里去？这两个问题不仅对我们是一种困扰，对宗教和科学更是一种斗争。宗教宣称人类是由上帝创造，在伊甸园里亚当和夏娃创造了人类；对于科学来说，达尔文仅证明了进化论，并未证明我们从哪里来。本书中埃德蒙·基尔希在古根海姆博物馆将为我们揭晓“我们从哪里来？”，谁知基尔希被人暗杀，在发布会上发生的一切是斗争？是阴谋？还是基尔希的表演？
基尔希提出的两个问题轰动了全世界，这将是对宗教的抗争，他将米勒-尤列的实验进行了延续，在其基础上加入了熵元素，实验从最初的核苷酸慢慢演变成双螺旋形状化合物“DNA”。这一实验对宗教来说是一个重型炸弹，彻底颠覆了《创世纪》中的人类起源一说。
米勒-尤列实验
米勒-尤列实验：米勒和尤列复制了早期海洋和大气中存在的水、甲烷、氨和氢等化学物质，对这种化合物进行加热来模拟沸腾的海洋。然后他们用电荷模拟闪电对化合物进行电击。最后他们让化合物自然冷却，就像地球上的海洋冷却下来一样。他们的目的就是从没有生命的原始海洋中激发生命的火花，创造“原生汤”。
我们要往哪里去？埃德蒙被暗杀后，兰登教授为了埃德蒙的发现公布天下，经过了政府和宗教的追杀，但一直帮助他们的“人”温斯顿是一台大型计算机，人工智能。而埃德蒙的对“我们要往哪里去？”这个问题的答案就是：人类在未来很短的时间内，将会被人工智能取代。在原有生物分类的六界（生命的六个界：动物界、植物界、原生生物界、真细菌界、原始细菌界、真菌界）基础上，新增了第七界：技术界。
埃德蒙建造了E 波，成为了他一生最大的成就，从而也诞生了温斯顿。温斯顿是一台人工智能机器，而在书中他就是一个具有人类感情的机器，已和人类无异。丹布朗借温斯顿贯穿全书，兰登教授成功逃离政府的追捕，成功将埃德蒙的发现公布出来离不开温斯顿的帮助。最后的谜底，杀手任务的派遣，王宫的电话号码等均为温斯顿布局。埃德蒙给温斯顿最后的命令：自我删除。一台人工智能机器能以人类的思维和感情去布局，也侧面证明了“我们要往哪里去？”的答案，若人类真的被人工智能所替代，那么人类的命运也将是杂交种了。
人类进化史
“人类正朝着某种不同的东西进化。”他说道，“我们正在成为一个杂交种--生物与技术融合的产物。今天活在我们体外的工具--智能手机、助听器、阅读眼镜、大多数药品，五十年后将被大量植入我们的体内。到那时我们就再也不是‘智人’了。”
《本源》是丹布朗2017年的巨作，结合了当前的社会形式和传统的宗教背景，在本书著作时他请教了很多宗教学者和科学教授。宗教和科学在以往都是相对立的，宗教的很多知识是科学无法解释的，就像基督教内，人类的起源是上帝的创作，我们需要善意和谅解，当一个人打了你左脸一巴掌，你应该把右脸也给他打，并宽恕他。
丹布朗
在中国的宗教信仰是道教，由于道教的主张追求是长生不死、得道成仙、济世救人、无为而治，以致于改革开放后道教慢慢的退出了我们的视野。但后来中国很多人信奉佛教和基督教，由于两教主张的均是众生平等，心怀善意，普渡众生，现在国内慢慢的盛行起来了。作为无宗教信仰者的一句话：信奉宗教并无对错，在社会上心怀善意，不危害社会危害他人即是善。
《本源》是集悬疑、高科技、侦探、言情一体的小说，在书的开头以总悬念：我们从哪里来？我们要往哪里去？和各种小悬念共存，在书中通过各个小符号来给读者设下谜题，“圣杯”“victor”“字母A”“达尔文鱼”等，这些符号服务于故事的叙述。同样在《天使与魔鬼》中，丹布朗也以各种符号来进行承接，给读者设下悬念，牵引着读者一步一步的解谜。在《本源》中，更有解密网来对剧情服务，每到一个关键点时，解密网发布的信息领导着读者进行下一步的探索。而在本书中解密网有一个无所不知的用户[email protected]，将用户名分解为“山上的教堂”而丘吉尔Churchill也可分解为山上的教堂，这个用户就是温斯顿，那台人工智能机器。书中这样的推理有很多，环环相扣，不断给读者带来全新的视野。
