2004年兵敗底特律之後，菲爾.傑克遜因為與科比的矛盾而沒有繼續執教湖人，後來禪師在出版的新書中也對那個時候的科比進行了批評，說他是一名不可調教的球員。接下來的一個賽季，圍繞著科比進行重建的湖人因為球員磨合、傷病和主教練等原因而未能打進季後賽。為此，洛杉磯湖人在2005-06賽季做出了一個重要的決定，那就是邀請禪師重回湖人進行執教。雖然科比曾經與禪師有過分歧，但是為了球隊的未來，他還是對此表示贊同，並與禪師再次合作。
2005-06賽季是科比職業生涯最為巔峰的一個賽季，在這期間他打出了很多讓人驚歎的個人數據，也創造了不少屬於他自己甚至是歷史級別的紀錄。這一個賽季，科比從一開始就表現出了極佳的競技狀態，他在前四場比賽就連續砍下了30+的數據。
在2005年12月21日對陣達拉斯小牛的那一場比賽中，科比僅用三節的時間就31投18中爆砍62分，而整支小牛隊的前三節也僅僅只得到了61分而已，此時的湖人則以95-61遙遙領先於對手，隨後的一節科比並沒有上場繼續打比賽，而湖人最終則以112-90大勝小牛。
一個月之後，科比和湖人在2006年1月23日坐鎮主場迎來了多倫多猛龍的挑戰，這一場比賽湖人上半場一度以49-63落後於對手。進入到下半場，科比則開始了他的表演盛宴，僅用最後的兩節時間就砍下了55分，並且幫助湖人以122-104逆轉了比賽。此役，科比出戰42分鐘，46投28中砍下了職業生涯最高的81分，這是繼張伯倫單場100分之後的NBA歷史第二高得分。
整個2006年1月份，科比率領湖人取得了9勝4負的戰績，在這期間，他場均可以貢獻43.4分5.6個籃板4.1次助攻和1.8個搶斷，憑藉著如此出色的戰績和個人數據，科比當選為這一個月的月最佳球員。
進入到4月份，科比依然延續這之前的優異表現，這一個月，他幫助湖人取得了6勝2負的戰績，場均也能貢獻41.6分5.5個籃板3.6次助攻和2.3次搶斷，正是因此科比和湖人這麼出色的表現，讓他在2006年的4月份再度當選為月最佳球員。
整個2005-06賽季，科比代表洛杉磯湖人打了80場常規賽，場均可以貢獻35.4分5.3籃板4.5助攻和1.8個搶斷。這一個賽季，湖人在科比的幫助之下，取得了45勝37負的戰績，並且以西部第7的身份晉級季後賽。場均35.4分，讓科比成為了這一個賽季的得分王，而他在攻防兩端的優異表現則讓他時隔一個賽季再度入選雙一陣。只可惜因為這一個賽季洛杉磯湖人的戰績不太理想，科比未能當選常規賽MVP，不過他也獲得了22張首輪投票，僅次於最後的獲得者，史蒂夫.納什。
這一年的季後賽，科比和湖人的對手正好就是納什所在的太陽，雖然太陽的整體實力要強於彼時的湖人，但這一輪系列賽湖人卻在科比的率領之下打得非常的頑強，前6場比賽雙方還打成為了3-3平手，只可惜在最後的搶七大戰中，太陽7人得分上雙，而湖人則因為科比獨木難支，最終以90-121遺憾地結束了這一個賽季。在與太陽的系列賽中，科比場均可以得到27.9分高居兩隊之首，另外他還能貢獻6.3個籃板和5.1次助攻。
2004年隨著奧尼爾的離開，科比過去兩個賽季單獨帶隊的戰績都不太理想，為了忘記過去的輝煌重新開始，科比在2005-06賽季結束後作出了一個非常重要的決定，那就是把他穿了整整9個賽季的8號球衣換成了24號。
