2004年兵败底特律之后，菲尔.杰克逊因为与科比的矛盾而没有继续执教湖人，后来禅师在出版的新书中也对那个时候的科比进行了批评，说他是一名不可调教的球员。接下来的一个赛季，围绕着科比进行重建的湖人因为球员磨合、伤病和主教练等原因而未能打进季后赛。为此，洛杉矶湖人在2005-06赛季做出了一个重要的决定，那就是邀请禅师重回湖人进行执教。虽然科比曾经与禅师有过分歧，但是为了球队的未来，他还是对此表示赞同，并与禅师再次合作。
2005-06赛季是科比职业生涯最为巅峰的一个赛季，在这期间他打出了很多让人惊叹的个人数据，也创造了不少属于他自己甚至是历史级别的纪录。这一个赛季，科比从一开始就表现出了极佳的竞技状态，他在前四场比赛就连续砍下了30+的数据。
在2005年12月21日对阵达拉斯小牛的那一场比赛中，科比仅用三节的时间就31投18中爆砍62分，而整支小牛队的前三节也仅仅只得到了61分而已，此时的湖人则以95-61遥遥领先于对手，随后的一节科比并没有上场继续打比赛，而湖人最终则以112-90大胜小牛。
一个月之后，科比和湖人在2006年1月23日坐镇主场迎来了多伦多猛龙的挑战，这一场比赛湖人上半场一度以49-63落后于对手。进入到下半场，科比则开始了他的表演盛宴，仅用最后的两节时间就砍下了55分，并且帮助湖人以122-104逆转了比赛。此役，科比出战42分钟，46投28中砍下了职业生涯最高的81分，这是继张伯伦单场100分之后的NBA历史第二高得分。
整个2006年1月份，科比率领湖人取得了9胜4负的战绩，在这期间，他场均可以贡献43.4分5.6个篮板4.1次助攻和1.8个抢断，凭借着如此出色的战绩和个人数据，科比当选为这一个月的月最佳球员。
进入到4月份，科比依然延续这之前的优异表现，这一个月，他帮助湖人取得了6胜2负的战绩，场均也能贡献41.6分5.5个篮板3.6次助攻和2.3次抢断，正是因此科比和湖人这么出色的表现，让他在2006年的4月份再度当选为月最佳球员。
整个2005-06赛季，科比代表洛杉矶湖人打了80场常规赛，场均可以贡献35.4分5.3篮板4.5助攻和1.8个抢断。这一个赛季，湖人在科比的帮助之下，取得了45胜37负的战绩，并且以西部第7的身份晋级季后赛。场均35.4分，让科比成为了这一个赛季的得分王，而他在攻防两端的优异表现则让他时隔一个赛季再度入选双一阵。只可惜因为这一个赛季洛杉矶湖人的战绩不太理想，科比未能当选常规赛MVP，不过他也获得了22张首轮投票，仅次于最后的获得者，史蒂夫.纳什。
这一年的季后赛，科比和湖人的对手正好就是纳什所在的太阳，虽然太阳的整体实力要强于彼时的湖人，但这一轮系列赛湖人却在科比的率领之下打得非常的顽强，前6场比赛双方还打成为了3-3平手，只可惜在最后的抢七大战中，太阳7人得分上双，而湖人则因为科比独木难支，最终以90-121遗憾地结束了这一个赛季。在与太阳的系列赛中，科比场均可以得到27.9分高居两队之首，另外他还能贡献6.3个篮板和5.1次助攻。
2004年随着奥尼尔的离开，科比过去两个赛季单独带队的战绩都不太理想，为了忘记过去的辉煌重新开始，科比在2005-06赛季结束后作出了一个非常重要的决定，那就是把他穿了整整9个赛季的8号球衣换成了24号。
