早在1960年，合肥工業大學就被中央指定為全國重點大學（彼時全國範圍內僅有64所），而這64所高校中又包括文理（即蘇聯式綜合類）、工科、專門性三種不同性質的高校。而在這三類高校中，又以入選文理類和工科類最為困難。
合肥工業大學
首批入選的文理類重點大學共有13所，包括北大、人大等頂尖綜合性大學。而14所工科類全國重點大學中，就囊括了5所C9高校和名聲赫赫的四大工學院。能夠入選這一榜單，就能充分證明這所高校在工科領域內的絕對實力。後來的發展也充分的證明了這一點，幾乎所有的文理類和工科類高校都入選了985工程和雙一流大學A類建設高校。
遺憾的是，只有合肥工業大學沒有入圍這兩項重點工程，甚至合工大都沒有入選首批211工程建設高校。更令人疑慮的是，當時的合肥工業大學已經通過了原機械工業部組織的211工程部門預審，卻最終沒有出現在立項建設的名單上。為什麼同時期入選全國重點大學，如今的發展卻大相徑庭，這一切都要從211工程立項建設開始說起。
工科領域的王者——清華大學
合肥工業大學在1960-1962年曾直屬於教育部，後來部委直屬高校調整，合肥工業大學因其機械工業學科特色顯著被劃轉至機械工業部直屬，這為其落選首批211留下了伏筆。上世紀90年代中期，國家推出了211工程，即面向21世紀，建設100所左右的高水平院校。狼多肉少，名額有限，如何分配這些名額成為最令人關心的問題。彼時直屬於教育部的高校多為綜合性高水平大學，基本代表我國大學的最高水平，因此這部分高校拿走了可觀的名額。然後根據地域均衡政策，又推出了“一省一校”的分配辦法，這樣一來，又從總名額中划走了三十多個名額。因此，留給直屬於國家部委高校的名額已所剩不多。
合肥工業大學“紅衣主教”
對於其他部委來說，直屬高校多為1-2所，因此確定進行211預審的學校並不困難。而對於機械工業部來說，這就成為了一個難題，因為彼時直屬於機械工業部的高校多達5所。而合肥工業大學在機械工業部的排名為第三位（排在吉林工業大學（今吉林大學）和湖南大學之後），因此能否進行211工程預審成為關係到合肥工業大學發展的一個核心問題。
當時國家共有40多個部委，如果機械工業部拿走3個211工程的名額，那麼勢必將擠壓其他部委的名額。但考慮到合肥工業大學的辦學實力，當時機械工業部的負責人還是頂住壓力，堅持對合肥工業大學進行了211工程預審。遺憾的是，為了均衡各方面，通過了211工程預審的合肥工業大學還是沒有出現在首批211工程立項建設的名單之上。
吉林大學
因此合肥工業大學落選211與安徽真的沒有關係，合肥工業大學原是機械工業部直屬高校，後又轉為教育部直屬，因此推薦合肥工業大學進入211確實不是安徽方面所能左右的。因此，安徽省推薦安徽大學作為本省一省一校的代表進入211工程也就是在情理之中了。
落選首批211工程對合肥工業大學的打擊是巨大的，根本原因在於許多辦學實力不如合肥工業大學的學校入選了這個名單。出於安撫這些學校的考慮，教育部及一些領導多次強調：
實施“211工程”，由於因素很多，不能把進不進“211工程”作為衡量一所學校辦學水平的標誌，更不能把它看作是重點大學的重新排隊。
值得感動的是，雖然沒有首批進入211工程，但機械工業部和安徽方面仍然表態，要全力推動合工大滾動進入211工程。
後序
因此，合肥工業大學滾動進入211工程的夢想從落選那一天就開始植入每個工大人的心中。1998年，合肥工業大學劃轉教育部直屬，為進入211工程和快速發展奠定了堅實基礎。2005年，合肥工業大學歷經多年最終圓夢，得以滾動進入211工程。2010年，得以入選985優勢學科建設平臺...........
參考文獻：
[1] 陳心昭. 《1998年合肥工業大學重歸教育部紀實》.合肥工業大學建校65週年校慶文章.
[2] 《機械工業部積極支持我校進行“211工程”部門預審》.合肥工業大學學報（社會科學版）.
[3] 《深化教育體制改革，爭取滾動進入“211工程”》.合肥工業大學學報（社會科學版）.
