1662年鄭成功率軍擊敗荷蘭人光復臺灣，其實鄭氏此時在主要統治地區在臺南，包括嘉義，屏東地區，北部則在淡水、基隆一帶有少許地盤，至於山地地區，則基本不在鄭氏號令所及。
人口方面，當時全臺軍民約20萬人左右，人口不多，因此基本上是民屯與軍屯相結合，兵民合一，軍隊所在地，基本當地行政中心，雖然鄭氏也試圖加強對原住民的統治，但是似乎效果不大。臺灣雖然地處海外，可謂蠻荒之地，但其獨特的地理位置，以及鄭氏集團脫胎於海盜集團的特點，使得鄭氏集團很快壟斷了海上貿易，以臺為基地，不斷騷擾大陸沿岸，並時不時的反攻大陸，給剛剛定鼎中原不久的清王朝帶來了不小的麻煩。
康熙皇帝親政後，通過削藩之戰，平定了南方，針對鄭氏集團，開始海禁。此時的鄭氏集團內部開始出現權力鬥爭，鄭成功的兒子鄭經在權力鬥爭中獲勝，成為鄭氏集團新當家，可是分裂已經產生，許多將領叛降清王朝，1683年降將施琅的水師攻取了臺灣，鄭氏政權的第三代統治者鄭克爽投降清王朝，臺灣正式併入福建省管轄，開始中央政府對臺灣的直接統治。
鄭氏集團對臺灣的三代治理，帶去了中原文明，促進了臺灣地區的文明進步，為中華文明在臺灣地區的紮根奠定了基礎，這點上鄭成功不愧為中華民族的民族英雄的稱號。
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