居住在日本偏遠地區的青年阿希達卡，是故事的主人公。他在這邊土地上生活了幾年，這裡十分安寧祥和，是人類居住的好地方，阿希達卡對這片土地有深厚的感情。有一天，有一個從西方來的發了瘋的野豬，打破了小鎮的寧靜，將這裡鬧得天翻地覆，不僅使村民受到了驚嚇，還破壞了村民們的家園。
阿希達卡為了阻止野豬繼續破壞，就與它進行了正面的較量。由於野豬的龐大，瘦弱的阿希達卡在雨夜中進行鬥爭的過程中，受了非常重的傷，他的右手被野豬的血沾染，被詛咒了。如果詛咒不解除，阿希達卡的生命就快要結束了。在這個村子裡找不到一個醫治的方法，於是阿希達卡為了破除詛咒，離開了居住已久的家園，告別了自己的親人，獨自一人踏上了尋找破除詛咒方法的路。在路途中，他碰到了一群貧窮的人類，他們正在森林裡開採礦石，並建立鐵礦廠，大片的森林被破壞，工廠煙囪裡排放著黑壓壓的汙染氣體。
他看到森林裡所有的動物，都在於人類為敵，並且時常的襲擊人類。其中有一個具有超能力的白狼神莫娜，她身邊帶著一個被她養大的類似人類的孩子，被別人叫做幽靈公主，其實真實的名字叫珊。她們一同攻擊人類，更想把人類的城市破壞掉，眼神中可以看出，她們痛恨人類，恨不得將他們都殺死。阿希達卡慢慢走近那個類似人類的女孩珊，被她那種不怕犧牲只為保護森林的精神深深吸引，也理解了白狼神和山想要保護森林的那顆赤誠之心。
阿希達卡處於中立的位置，他想要幫助人類，也想幫助珊，想讓他們成為好朋友。一次戰鬥中，阿希達卡被麒麟獸所傷，但是由於珊的幫助，他很快的復原了，他在森林裡靜養。慢慢的他改變了自己中立的位置，更傾向於保護珊，與他一起戰鬥，保護森林。就在靜養時，以疙瘩和尚為主的進攻森林團體，與森林煉礦廠的建造者相勾結，用火槍殺死了麒麟獸，並搶走了他的頭顱。
失去頭顱的麒麟獸，似發瘋一樣的毀壞森林，所到之處都燃起烈火，傷害了森林裡的生靈。阿希達卡看到如此場景，想盡自己一份綿薄之力，於是和珊聯手，運用巧妙的辦法，將麒麟獸的頭疙瘩和尚手中奪回，並還給了麒麟獸。這時麒麟獸的靈魂才得以安息，破壞森林的行為停止了。在這之後，森林竟奇蹟般的恢復了原貌，而且比昔日更加繁茂。
宮崎駿用這部影片又一次明顯的講明人與自然的關係，講述了隨著科技的發展，人們越來越破壞環境，一點都不知道憐惜它，最終受到自然的報復，併為之付出了沉重的代價。這引發了人無限的思考，它不是單純好處上的對人類破壞環境的聲討，而是發人深省的一部人與自然的悲劇。
我們真的應該好好思考人與自然應如何和諧的相處了，我們要在發展的基礎上保護大自然，又在保護大自然的基礎上發展。現在我們要應該為以前所做的錯事，想盡辦法來彌補過失，比如植樹造林，退耕還林。我們要為我們這個共同的家而努力，讓它變成一個更適合人類居住的地球，讓我們一起努力吧。
結束語：幽靈公主這篇動漫，可以從許多不同的角度去欣賞，人與自然的環境保護只是一方面，其中還有許多令人深思的地方。因為阿希卡達的外出，他增長了許多知識，開闊的眼界，明白了世界上還有如此美妙的地方，並且他邂逅了她自己一生最愛的人，這是多麼美妙的事情啊。
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