花魁小紫
很高興回答您的問題，眾所周知大偵探工藤新一是在解決雲霄飛車殺人事件後追蹤神秘組織被灌下毒藥致使身體變小，至於為什麼要寄居在毛利小五郎家而不是阿笠博士家，筆者認為有三方面的考量：
第一：“單身漢”阿笠博士忙於科研工作無暇照顧柯南
阿笠博士是未婚單身漢，自己的大部分時間都用在了發明上，雖然被新一說研究出來的東西都是一堆破銅爛鐵但是興趣使然他願意花時間投入研究，所以連自己的生活都是馬馬虎虎，更別說再來個小孩子了。
第二：毛利偵探事務所是柯南秘密調查神秘組織的根據地
毛利小五郎以前是一名優秀的刑警，後來因為一起事件而辭職，成為一名私家偵探，開辦了毛利偵探事務所。柯南寄居在毛利家無形中接觸了很多案件，通過自己的縝密推理把糊塗偵探的毛利變成了以睡姿推理案情，屢破奇案的"沉睡的小五郎"，因此經常被邀請參加各種活動和各大重案要案，這就為柯南收集神秘組織情報埋下了伏筆。
第三：動漫情節和吃瓜群眾的需要
眾所周知動漫中工藤新一和毛利蘭是情侶關係，變小的新一也就是柯南寄居在毛利家，一方面兩位主人公可以“朝夕相伴”小蘭情緒的變化會被柯南察覺並能及時的化解，另外一方面小蘭作為毛利偵探事務所的女主人善良可愛廚藝高超，能很好的在生活上把大家照顧好。
綜上所述，柯南寄居在毛利家是最好的選擇，不光是劇情的需要，也是滿足廣大動漫迷“有情人終成眷屬”的情愫，儘管新一身體變小，但是他跟小蘭走在一起總有一種初戀般的和諧和美好。
千語講動漫
在名偵探柯南這部作品中，知道柯南真實身份的角色並不少，其中關係最近的角色，應該還是阿笠博士。
在作品中，柯南變小的第一時間，便是去找阿笠博士。並且阿笠博士也給了柯南很多方便，比如說老是折磨毛利小五郎的催眠針就是阿笠博士的傑作。
但有意思的是，以隱蔽的身份與生活的便捷度來考慮，借住阿笠博士家似乎更為合適，那柯南為何執著於小五郎家呢？
首先我們要確認一點，那就是阿笠博士家其實可以住。
最好的例子就是灰原哀，和柯南立場相近的灰原哀都能住在阿笠博士家中，柯南自然也可以住在裡面。
而且從生活成本來看，怎麼想柯南和阿笠博士都不缺錢，阿笠博士的房子也夠他們生活。
那麼柯南為何執意要生活在小五郎的家裡呢？
首先第一點，也就是最重要的一點，柯南需要確保毛利蘭的安全。
原本柯南就喜歡毛利蘭，兩人算是兩情相悅。若是沒有黑衣組織這個意外，他們的人生幾乎是非常平坦的。
但如今柯南身不由己，被迫加入到了巨大的組織中與他們周旋，甚至牽扯到國家層面的鬥爭，那麼自己身邊人的安慰自然是他最關心的。
為了保證毛利蘭的安全，柯南必須要住在小五郎家。
第二點，在作品的前期也說過
柯南是為了將毛利小五郎這個庸才變成傳說級偵探，只要小五郎夠出名，他就有機會接觸到黑衣組織。
從結果來說，也確實如柯南所設想的。在其幫助小五郎一次次偵破案件，成為了“沉睡的小五郎”這個大偵探後，各個組織都找上了他，而他與黑衣組織的距離也確實越來越近了。
最後也是為了規避風險
住在自己家就不用說了，有被監控的危險。（事實上黑衣組織確實派人潛入到工藤家中）
阿笠博士與工藤家關係太近，為了防止暴露同樣為了防止阿笠博士出現沒必要的風險，遠離阿笠博士居住是個很好地選擇。
總的來說，離開阿笠博士選擇小五郎家，是一個深思熟慮考慮的結果。不可否認有私情的因素，但從結果而言因為柯南對小五郎的幫助，讓小五郎人脈越來越寬廣、名聲也是越來越響亮。
正因為如此，柯南才能一步步走進黑衣組織的視野之中。
黑鼠鼠
我想有三種可能性吧
- 一 更方便調查黑衣組織
在柯南一開始的時候，就有著劇情上的介紹，說是在作為偵探的毛裡小五郎家裡，可以更方便的調查黑衣組織的信息，毛利小五郎之前也做過警探，雖然現在作為偵探不怎麼出名，但是有更多接觸案件的機會，所以更有機會接觸黑衣組織進而進行調查。
- 二 更好的保護毛利蘭
雖然小蘭有著很強的空手道技巧，一般的罪犯無法對其造成什麼危險，但是作為男孩子，更願意留在自己心愛的人身邊保護她，而且作為偵探的毛利小五郎難免會被一些窮兇極惡的罪犯盯上，跟別說一些報復小五郎和隨時都會盯上的黑衣組織了，所以為了確保小蘭的人身安全，還是呆在她的身邊，做一個小小的守護天使最好不過了。
- 三 更好的隱藏自己的行蹤
雖然柯南變小了，但仍然要調查黑衣人的行蹤，更是對發生的刑事案件無法置之不理，但是如果直接接觸案件的話，很容易暴漏身份，而且一個小學生接觸偵破刑事案件的話，更容易引起人們注意，所以要找一個“保護傘”來隱藏自己，毛利小五郎正好充當這個角色，一根麻痺針，一個變聲器，利用“沉睡的毛利小五郎”偵破案件，進行調查，是自己不會暴漏在大眾之下，更好的隱藏自己的身份，不被黑衣組織發現
