指紋的歷史起源可謂非常的久遠，甚至是早於四大發明的。人類對指紋技術的應用卻起於非常遠古的新石器時代，製陶術孕育了指紋技術。仰韶文化的陶器大都是手製的，因為用手捏製所以器壁常常留有指紋。後來彩陶上出現了螺旋紋的指紋畫，彩陶上的立體指紋無疑都是刻意形成的裝飾紋。
人在胎兒期的四個月開始，指紋開始逐漸形成，直至14歲左右，基本定型。但在成長期內，因為指肚的變大、摩擦、受傷等原因，紋路可能有輕微的改變。形成後的指紋由皮膚上許多小顆粒排列組成，分佈著敏感的觸覺神經。指紋的生理機能主要用於觸覺以及增加摩擦力、抓緊物體，用指紋占卜算卦也是指紋的娛樂功能之一。
指紋的紋路特徵是唯一的，但這種假說無法通過科學手段去一一加以驗證，迄今為止，沒有發現過兩個人擁有一模一樣的指紋。同卵雙胞胎的基因幾乎完全一樣，但是受環境等各種因素影響，指紋也有很大的不同，只是比普通人的差異要小而已。
指紋差異也有地域性分佈，例如歐洲、亞洲人之間對比，指紋區別較大。極少數個例因為基因和染色體的異常，會導致天生無指紋。
計算機出現讓指紋識別技術更加強大
20世紀六十年代開始，部分國家利用計算機技術的自動指紋識別系統，開始探索電子指紋技術。到現在，指紋識別技術已變得十分普及。通常，指紋自動識別系統將指紋分為弓形紋（弧形紋、帳形紋）、箕形紋（左箕、右箕）、鬥形紋和雜形紋等。指紋的信息採集主要包括類型、座標、方向等參數，然後輔以端點、分叉點、孤立點、短分叉、環等這些細節特徵。
道高一尺魔高一丈，假指紋開始出現
有人使用導電硅膠或明膠製成假手指，用以欺騙各種指紋傳感器。隨著技術的發展普及，現在很容易得到導電硅膠，甚至利用電腦合成的指紋模型，做成指紋貼膜。
進入21世紀，指紋識別仍然會“失手”
由於指紋的特徵點是有限的，所以不可避免會出現誤差。
當然，就是FBI也有犯錯的時候，製造了指紋鑑定史上最著名的誤判案。2004年3月11日，西班牙馬德里的城鐵受到爆炸襲擊。警方在現場採集到一個不完整的指紋。兩個月後，美國聯邦調查局(FBI)逮捕了一個叫梅菲爾德的人。警方宣佈其指紋與爆炸案現場指紋相符。
又過了半個多月，西班牙警方逮捕了另一名疑犯，這名疑犯的指紋與現場指紋更吻合。FBI不得不承認他們在此前的分析中出現了多處誤差，並釋放了梅菲爾德。
這次失誤是由於警察在犯罪現場普遍獲取的指紋都是局部或模糊的指紋。手指的動作、承受客體外表的形態與光滑程度、手指與承受客體表面不同附著物及形成指紋時的作用力大小等各種複雜因素，就形成了殘缺不全的，局部或大部模糊、變形的指紋。
靜脈識別未來將成為主角
後來隨著發展，在一些安全級別需求較高的設備上，又增加了汗水、氣味、溫度等傳感器，用來區別真假手指。目前，指紋識別由於易操作和低成本的原因，仍然在移動智能設備、門禁系統、身份採集、司法認證等領域廣泛存在。
隨著科技的不斷進步，出現了諸如靜脈識別、虹膜識別、面部識別等多種生物識別技術，安全等級更高，而指紋識別作為一種生物識別方式，將逐漸成為輔助手段。
相比指紋識別，指靜脈識別的優勢明顯
手指靜脈血管的含氧活體紅細胞可以吸收紅外光，因此當紅外線照射時，就可以得到清晰的靜脈血管流動形成的清晰圖像，然後採用複雜算法對獲取的影像進行分析、處理，從而得到手指靜脈的生物特徵，再將得到的信息與事先註冊的手指靜脈特徵進行比對，從而確認身份：
1.無法複製盜取：由於指靜脈位於皮膚之下，並且必須是活體流動的血液，所以目前還沒有複製的方法，是業內公認最安全的識別方式。
2.必須是活體識別：含氧、流動的血紅蛋白才可以吸收紅外線，才能夠形成指靜脈圖像，所以必須是活體的，但是指紋只是表層的、靜態的圖像，不具備活體識別的特徵；
3.不受手指皮膚狀態影響：靜脈血管是在皮膚之下的，所以手指脫皮、沒有指紋、外傷、溼手都不受影響；
4.不受年齡影響：老人的手指比較粗糙，小孩的指紋很淺，都是很難識別的，但指靜脈是不受影響的；
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