美麗的病毒

我們在頂級期刊上看到的病毒,往往充滿了對稱與規則性的美感。

美麗的病毒

人乳頭瘤16型病毒 藝術家:Eleanor Lutz


美麗的病毒

登革熱病毒 藝術家:Eleanor Lutz


美麗的病毒

綠藻病毒 藝術家:Eleanor Lutz

如果注意觀察,這種圖的標註一般是病毒結晶。

病毒結晶?病毒也可以結晶?

答案是:可以。病毒當然能結晶,蛋白質也能結晶,很多有機物都能結晶。比如說在我國廣泛宣傳的人工合成牛胰島素結晶。從定義講,結晶就是指在一個天然或人工的工程中形成固體的過程。如果這種固體中的分子或者原子具有高度的組織性和結構性,就可以稱為晶體。

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人工合成牛胰島素結晶

人類費這麼大力氣提純製造病毒的結晶,其實是為了看清楚它們。

受限於可見光的波長限制,傳統的光學顯微鏡對於病毒這樣尺度(100納米級別)的目標是無能為力的。好在基於X射線晶體學的結構解析拓展到了有機分子,由此發展出的結構化學,才使得人們對於各種原子間的化學鍵的鍵長、鍵角、二面角有了翔實的瞭解。受限於X射線衍射法的限制,樣品必須是乾燥粉末且有晶體結構能夠衍射X射線。

美麗的病毒

某種病毒性關節炎的病毒粉末

1935年,Stanley 實現了病毒的提純結晶(TMV:Tobacco Mosaic Virus 菸草花葉病毒)。 利用複數個晶體結構對衍射信號進行強化,從而使得信號能夠從背景中分離出來,這就是XRD的基本原理。

美麗的病毒

XRD原理示意圖


美麗的病毒

蛋白質晶體

XRD與電鏡EM(掃描電鏡SEM或者透射電鏡TEM)的觀測結果相結合,就可以得到近似的病毒立體結構和表面特徵,為了滿足觀測的條件,對被觀測的對象是有一定要求的,並不是所有的有機物都能被這種方法觀測到,比如要能溶於水,能夠結晶且單晶大小合適等。

不過最新的冷凍電鏡(cryo-EM),適用範圍更廣,可以在液體環境中獲得目標活性結構的掃描圖。因而我們得以看到更加真實的微觀世界。

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噬菌體電鏡圖


美麗的病毒

噬菌體電鏡染色圖


美麗的病毒

噬菌體三維模擬圖


美麗的病毒

皰疹病毒電鏡圖


美麗的病毒

皰疹病毒三維模擬圖

美麗的病毒

Zika病毒電鏡圖


美麗的病毒

Zika病毒三維模擬圖


美麗的病毒

Zika病毒三維模擬剖面圖



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