知错就改是父母从小就孜孜不倦教育着我们的道理，这部电影也用一种隐晦的方式告诉我们。电影一开始就是彼得和自己的伙伴们在草坪外面自由自在的奔跑，它们准备潜入进菜园去偷蔬菜。菜园子的主人是叫麦克雷戈的老头，彼得的父亲就是被他杀害的。彼得让其它四个负责望风和放哨，它则进入菜园子里面偷蔬菜。五只兔子对这种事情早已经轻车熟路了，相互之间非常的默契。麦克雷戈在前院除草，除草机声音很大，彼得毫无顾忌的偷着。
麦克雷戈除完草之后把除草机关了就听见了菜园子里的动静，他马上就意识到是彼得它们来偷蔬菜了，他拿起叉子就往菜园子里面走。彼得小心的在菜园子里面逃窜，小伙伴们也一直给彼得指方向。在彼得成功出逃的时候，它却为了报复麦克雷戈，就用胡萝卜去捅他的屁股。最后被麦克雷戈给抓住了。就在大家都胆战心惊的时候，邻居贝伊出现从麦克雷戈的手上救回了彼得。贝伊一直很喜欢彼得它们，也非常照顾它们。在彼得心目中贝伊就如同母亲一样。贝伊是一个画家，她的画的不好，却很擅长画彼得它们。彼得每一次看到贝伊的画都会想起自己过世的父亲。
在大家打算回家的时候，彼得一个人潜入了菜园子里，因为彼得发现自己父亲留给自己的蓝色外套丢在了菜园子里面。彼得进入了菜园子里，在捡回掉落在里面的蓝色外套时被早已在此等候多时的麦克雷戈抓住了。麦克雷戈抓住彼得的两只耳朵，凶狠的告诉彼得准备把它做成兔肉馅饼时，麦克雷戈突然倒地心脏病突发的猝死了。彼得先是兴奋的在麦克雷戈身边查看，发现他真的猝死了之后就开心得去告诉了所有的动物这个消息。彼得它们在麦克雷戈的家里举办狂欢派对，并私自占有这一片菜园子。在几天的享乐之后，麦克雷戈的舅孙托马斯来到了这里，他打算买掉这里的房子去城里面开一家玩具店。托马斯是晚上来到这里的，却发现了这里一片狼藉，很生气的大扫除。
彼得为了不失去菜园子，又和托马斯展开了斗争。彼得它们又打算潜入菜园子中却被托马斯发现，彼得虽然幸运的逃脱了但是本杰明却没有那么幸运的被抓住了，生气的将本杰明扔进车里，进入城里。彼得和另外几个小伙伴也偷偷摸摸的跟上了车。它们在路上趁托马斯不注意，把被抓住的本杰明给救了出来。托马斯进入了一家五金店，买了炸药准备炸死彼得他们。在回去的时候托马斯遇到了贝伊，托马斯邀请贝伊坐自己的车一起回家，两个人便一起回家，并且两人也相互产生了好感，并迅速的坠入了爱河。
因为贝伊的缘故，托马斯只能够背着贝伊去收拾彼得他们，因此彼得在与托马斯的斗争中一直都处于上风。托马斯在墙上安装电网也没有伤害到彼得他们，反而彼得他们用老鼠夹这些把托马斯整得够呛。托马斯在贝伊家里面做客的时候，彼得也来了，两个人在打斗过程中把贝伊的画给毁了，托马斯诬陷给了彼得，贝伊生气的把彼得给赶了出去。这个时候彼得才明白自己之所以这么厌恶托马斯还有一个原因就是他夺走了贝伊的爱。所以彼得又联合他的小伙伴们变本加厉的去捉弄托马斯。它们用弹弓去打托马斯，还将他会过敏的黑莓射进了他的嘴里。托马斯终于忍无可忍，他拿出在五金店里面买的炸药，准备炸死彼得它们。兔子们在菜园子里面逃窜。彼得不幸的被托马斯给抓住了，就在托马斯准备掐死彼得的时候，贝伊出现了，托马斯撒谎说是彼得被噎住了在帮助它。贝伊相信了他，和托马斯恩爱的往屋子里面走。
托马斯把炸药的遥控器掉在了地上，彼得捡了起来。彼得不小心按下了炸药的开关，把贝伊的家和自己的家都给炸毁了。贝伊难以置信的看着这一切，托马斯跑出来说这一切都是彼得干的，贝伊却认为是托马斯因为讨厌彼得而撒的谎，所以一气之下和托马斯分了手。彼得看到自己的目的也达成了，但是彼得却开心不起来。它对贝伊很愧疚。之后彼得去了它爸妈的画像忏悔，得到父母的指点，告诉它其实还是可以去和别人一起去分享贝伊的爱。彼得在醒悟之后，它准备了道歉信去向贝伊道歉，却发现贝伊准备离开这里了。所以彼得打算去找托马斯，希望他可以来挽留贝伊。它的姐姐们都和它头靠头的鼓励它，本杰明却生气的指责彼得做得太过火了，并离开了。彼得准备进入城里，跳上火车的时候，传来了本杰明的呼喊，本杰明原谅了彼得并和彼得一起进城去找托马斯。在城里面它们询问了非常多的动物，终于见到托马斯。但是托马斯却不愿意理彼得它们。托马斯逃进了一个小房间里面，彼得尽心尽力的劝说，托马斯原谅了彼得并决定去挽回贝伊。与此同时贝伊已经打包好了行李准备离开了，却被一只鹿给拦了下来，它也舍不得贝伊离开。
托马斯和彼得它们赶了回来，托马斯向贝伊解释，贝伊却还是不原谅托马斯诬陷彼得的行为。彼得它主动的去和贝伊头靠头的感应了一下，贝伊才相信托马斯。
最后托马斯和贝伊开了一家玩具店，大家都幸福的生活在了一起。