旗舰亦称
美国海军第七舰队旗舰蓝岭号两栖登陆指挥舰。
因此,“旗舰”并非一个舰队中某个固定的船舰。在早期风帆时代,军舰以大取胜,而且指挥官与其幕僚也需要较大空间进行作战计划和会议讨论,所以指挥官通常搭乘舰队最大之军舰,此舰是固定的,非不得已(如战损)不会变动。
蓝岭号停泊于香港青衣对出海域。
但20世纪以后,军舰空间增大、防护增强、通信技术改良,主要水面舰都能提供指挥服务,因此舰队指挥官也逐渐以舰队中速度最快、指挥技术条件最好的船只为旗舰,为保证指挥官的安全一般是以巡洋舰作为旗舰,而不是最大船舰(例如航空母舰或战列舰)。