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到戰爭末期，日軍已經被美軍打殘了，海軍基本上灰飛煙滅，陸軍還能掙扎一下。在準備“本土決戰”時，日軍把能用的裝備都用上了，連中世紀的弓箭、竹槍都拿了出來。防空說著容易，但實力低下、漏洞百出。
日軍在1944年末對美軍作戰時開始將希望寄託在“神風特攻”上，大約一半的日軍空勤人員都被吸收進了特攻部隊。到1945年初，日軍已經完全不再進行正規的空戰訓練，全部飛行學員接受的全都是用於特攻的飛行訓練。在這些被美軍戲稱為“終結學校”的特攻學校裡，學員們要進行8到25小時的飛行訓練，這已經足以讓他們完成自殺攻擊了。大量能飛的飛機也都是被用來撞擊美國軍艦。
當美軍結束沖繩戰役，近逼日本本土時，日本無論是老手還是新手飛行員，幾乎每一架能飛的飛機都隨時準備用於特攻作戰。當時日軍總共擁有8000～10000架飛機，其中能夠作戰的戰鬥機不足2000架，至於熟悉空戰技巧的飛行員更像熊貓一樣珍貴。也就是說，那個時候的日軍空中攔截力量虛弱到可有可無的地步。因此，美軍飛機轟炸和掃射時，幾乎遇不到多少日軍飛機的攔截。
日軍地面防空火力主要是中小口徑的高炮，射高較小，對萬米高空飛行的B-29戰略轟炸機基本構不成威脅。四式75毫米高炮、三式120毫米高炮、九九式88毫米高炮、五式150毫米高炮雖然射高可以達到1萬米以上，特別是三式120毫米高炮射高達14000、五式150毫米高炮射高達19000米，但是這些高炮數量太少，像三式120毫米高炮生產總數為120門、五式150毫米高炮只生產了2門，這用來對付美軍B-29轟炸機只能是聊勝於無。
由於日軍防空力量太弱，美軍B-29到1945年夏經常可以在白天以單機進入日本本土進行偵察和轟炸，如入無人之境。（S）
聯合防務
之所以日本無法防禦美國空軍對日本的轟炸，原因是多方面的。除了因為美軍自身的轟炸機性能好，武裝強大，護航機強大與護航戰術成熟之外，還有日本海軍和陸軍隔閡巨大，根本無法協同防空，且日本高射炮和探照燈雷達等技術落後等一系列原因。
首先是美軍的轟炸機和護航戰鬥機十分強大。美軍轟炸日本採用的是當時最先進的B29型轟炸機，這款轟炸機能夠攜帶多達7噸炸彈轟炸日本，尤其是硫磺島被美軍攻佔之後，美軍更是天天對日本組織千機大轟炸。在轟炸日本期間，美軍採用提前護航，箱型編隊的戰術，提前護航的P51系列戰鬥機利用強大的高空性能像打火機一樣將日本陸航的隼式等戰鬥機和海航的零式戰鬥機打的七零八落，隨後箱型編隊將成千上萬噸燃燒彈扔到日本的城市裡，把整個城市點燃，燒成一片片廢墟。
其次則是日本陸海軍的巨大隔閡，日本陸海軍爭端可謂是由來已久，到了二戰末年更是到了仇敵的地步。陸軍和海軍分別研發完全不同的戰鬥機，連作戰理念都不同，這嚴重削弱了日本本來就捉襟見肘的工業實力。其次，陸軍和海軍採用的雷達系統完全不兼容，雙方在發現敵情之後也不會互相通報，更令人難以想象的是，陸海軍採用的是完全不同頻率的敵我識別器，這意味著，陸海軍一旦開始共同攔截美軍的轟炸機隊，不僅不會取得1+1＞2的效果，還會因為雙方的互相制肘甚至是誤傷導致美軍能夠大搖大擺的轟炸日本本土。
最後則是日本的高射炮性能實在是太差，數量實在是太少。日本陸軍有75毫米高射炮，有性能不錯的30毫米高射炮，但是這些高射炮都不能攻擊B29轟炸機，唯一能對B29造成足夠威脅的只有少數的105毫米高射炮。而海軍雖然有100毫米的優秀高炮，但是數量也嚴重不足，大部分都被安裝在各型戰艦上。因此，高炮的不足嚴重限制了日本陸海軍的防空作戰效能。此外，日本雷達落後，根本無法在夜間預警和防禦美軍的空襲，所以，美國在日本上空投放炸彈，日本無法防空。
軍情解析
這個主要有兩個原因！
第一
美國B-29戰略轟炸機飛行高度可以達到10000米，速度536公里每小時！續航里程可以達到恐怖的6400公里，這可是相當驚人的，當時只有美國有續航里程這麼遠的轟炸機！而且B-29火力十分強大！裝備了10門12.7毫米的機槍和一門20毫米火炮！這種火力一般的戰鬥機根本無法近身
第二
太平洋戰爭進入末期，日本的零式戰鬥機已經被美國人打成火雞了！而且速度還不如b29轟炸機的速度！上面裝備的機槍也很難對這種轟炸機造成有效的傷害！同時日本新研發的紫電，月光等戰機，雖然可以達到這種飛行高度，但是不能做長時間的逗留！根本無法攔截美國那麼龐大的轟炸機群。而且新式飛機數量相對較少。地面火力如果想攔截這種飛行高度的戰機！口徑至少120毫米以上，當時整個東京大約只有30門左右120毫米以上的高炮！根本對這麼龐大的機群形成不了任何威脅。
總結：
二戰末期的日本可以說已經到油盡燈枯的地步了！國內的資源基本上被消耗完了！而且由於美國在太平洋戰場上實行潛艇戰！導致二戰後期基本上沒有一艘運輸船到達日本本土！大多都被擊沉在太平洋上！資源不足，無法生產更多的武器裝備。飛機沒有燃油，機槍沒有子彈，百姓連溫飽問題都解決不了！在這種情況下，美國實行戰略轟炸日本只有挨炸的份沒有還手之力。
