印度獨立以來，印度和日本雙邊關係都很好，第三方因素是影響雙邊關係的主因。
在審判日本戰犯的遠東國際軍事法庭，有一位印度法官，名叫Radhabinod Pal。他持同情日本的態度，一定程度上造成部分戰犯被輕判。日本人直至今天仍非常感激Radhabinod Pal。
1949年，印度給東京動物園送去兩頭大象，慶祝日本獲得新生。1951年，印度還拒絕參加舊金山和會，理由是印度認為舊金山和約將損害日本主權的完整。1952年，印度和日本簽署了和平條約，從而正式建立邦交關係。在這個條約中，印度放棄了日本的戰爭賠償。從此，印日關係迅速發展起來。
印度鐵礦豐富，為日本鋼鐵產業輸送了大量鐵礦石。1957年，岸信介訪問印度，一年後，日本開始為印度提供日元貸款援助。印度成為首批接受日本金融援助的國家。
但是，當時日本和印度的關係受到客觀因素的限制。因為日本屬於美國陣營，是美國的軍事盟友。而印度事實上傾向蘇聯方面。這導致印日關係的潛力受到制約。
但是，20世紀80年代起，印度提出“向東看”政策，將日本作為重要合作對象。印日關係得以進一步改善。1986年起，日本成為印度最大的援助國。
1998年，印度核試驗後，西方國家集體制裁印度，日本也參與其中。印日政治交流中斷，日本停止了對印經濟援助。三年後，制裁取消，印日關係迅速回暖。2014年，安倍訪印期間還參加了印度“共和國閱兵”。當年，莫迪訪問日本時，印日建立“特殊全球戰略伙伴關係”（Special Strategic Global Partnership），比原來的“全球戰略伙伴關係”更上一層樓。
2016年，莫迪第二次訪問日本，印日簽署“和平利用核能合作協議”，日本將向印度提供核原料和反應堆技術。在未簽署《不擴散核武器條約》的國家中，印度是唯一獲得這一“特殊待遇”的國家。
當前，美國正試圖在各地區尋求代理人，而日本和印度分別是西太平洋和印度洋的理想合作伙伴。在美國的召集下，印日關係可能會進一步走近。
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