1
處理汙染技術的問題
處理汙染技術投入高，佔地面積廣，而且糞汙的處理技術推進也比較緩慢，對於小型養殖戶而言，投入太多精力和資金去處理糞汙染相信很多人都是不願意的。因此，開發新型高效低廉的處理汙染技術是目前解決農村糞汙染的關鍵。
2
農民個人意識的問題
即使現在技術發展日漸成熟，但很多農民個人在糞汙的排放上還是保持固有的方式，自然排放，讓大自然化解，但隨著越來越多規模化養殖廠的建立，糞汙染越來越多，早已超出了大自然的承受範圍，因此，要改善農村汙染環境，也要加加農民保護環境的意識。
3
養殖業成本的問題
自然災害、市場影響、疾病原因、原材料成本等影響養殖業的發展，任何一方面因素都會給養殖戶帶來損失，再者農業生產太過孱弱，無法旱澇保收，農民也不具備抵抗風險的能力，因此，養殖戶只能儘可能多的利用自然環境去減緩養殖工作的成本。
造成農村環境汙染的主要原因是糞汙染，該如何化解養殖糞汙染問題。一方面要提高處理汙染技術的能力，利用技術降低養殖生產的成本問題；另一方面就需要提高農民個人意識，儘可能多的利用環保的方式去處理糞汙，減輕自然環境的負擔。要真正改善農村環境，需要國家和農民的共同努力。
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