1.千手扉間
千手扉間可以說是木葉村中最早的科學家，他不僅實力強大，而且還開發出了許多強大的禁術，比如影分身之術，穢土轉生、飛雷神之術、互乘起爆符等等，裡面的很多忍術可以說都改變了忍界的歷史，也成為了很多強大忍者的招牌忍術。比如影分身之術就是漩渦鳴人最常用的忍術，波風水門靠著飛雷神成為了四代火影，穢土轉生在第四次忍界大戰中也發揮了十分重要的作用。
2.大蛇丸
大蛇丸也是繼千手扉間之後，木葉村的有一名傑出科學家。不過相比於千手扉間專門研究忍術的開發和創造，大蛇丸研究的重點則是在生命學。雖然他也對於忍術的研究也很拿手，還研究出了咒印，但是他最大的成就就是將自己改造成了不老不死之身。在《博人傳》中已經不老不死的他又開始研究人造人，博人的同伴巳月就是他的手筆。
3.藥師兜
藥師兜可以說是大蛇丸的得意門生了，他從大蛇丸那裡學到了很多。在當初大蛇丸當初被佐助吸收之後，他便開始了自主獨立的研究生涯，他先是將之前大蛇丸以及他手下的種種特殊能力都移植了過來，並且還成功的學會了仙人模式。他從大蛇丸那裡學到的穢土轉生讓他成為了第四次忍界大戰的發起者之一。
4.二代土影
二代土影雖然出場次數不多，但是他絕對是一個可以媲美大蛇丸的科學家。他開發出了塵遁這種血繼淘汰，並且將它傳授給了自己的學生大野木，另外在他身上出了塵遁以外，還有很多十分神秘的特殊忍術，比如他的隱身能力，還有他的分裂能力這些能力在作品中只有他一個人使用過，想必其中也有他自己開發出來的。
5.方助先生
方助可以說是科學界中一顆冉冉升起的新星了，在《博人傳》中，方助先生開發出了一種可以大幅圖提高忍者作戰能力的工具——科學忍具。使用科學忍具無須修行，無須查克拉便能輕鬆使用出各種各樣的忍術，可以說改變了忍界的歷史。想必在之後的忍界中，科學忍具將會成為大部分忍者執行任務時候標準配置。
6.因陀羅
因陀羅是忍者始祖六道仙人大筒木羽衣的長子，繼承了六道仙人天賦的他可以說是忍界中第一個科學家，也是對忍界貢獻最大的科學家。為什麼呢？因為印和忍術就是他發明的。如果沒有他，忍者們之間戰鬥或許完全都是靠體術來戰鬥，可以說他在科研事業方面的成就完爆了二代火影千手扉間和大蛇丸。
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