冬棗主要病害有棗炭疽病、縮果病、棗鏽病、細菌性瘡痂病、枝腐病、斑點病、棗瘋病，在防治這些病害時需要根據棗園實際情況，在全面貫徹“預防為主，防重於治，綜合防治”的方針下，綜合運用農業、人工、物理、化學等各種方法進行防治，最終達到生產無公害優質冬棗的目的。
1 棗炭疽病
危害：棗炭疽病主要危害果實、棗吊、棗葉、棗頭及棗股，嚴重時會引起落果。
防治措施：清掃果園、清掃落地的棗吊、棗葉、僵果、摘除樹上老棗吊；結合修剪剪除病枝、枯枝，集中燒燬；加強肥水管理，秋季追施有機肥，花期和幼果期及時追施磷鉀肥以增強抗病能力；6 月下旬噴 70%（質量分數，後同）多菌靈 800 倍液或 70%甲基託布津 1 000~1 200 倍液，福星乳油 8 000~10 000 倍液防治，每隔15天噴施一次，連續噴2~3 次即可。
2 縮果病
危害：縮果病發生與刺吸式口器昆蟲密度成正相關，空氣溼度大越流行，該病害主要危害危害棗果，引起果實腐爛和提前脫落。
防治措施：集中清理病果，集中燒燬或深埋；加強棗園肥水管理，提高樹體的抗病能力；加強對刺吸式口器害蟲的防治，降低蟲口密度，減少傳播媒介；棗果變色轉紅期的發病前用農用鏈黴素 100~140 單位/毫升，或農用土黴素 200 單位/亳升，或卡那黴素 140 單位/毫升進行樹冠噴霧防治，每隔10天噴施一次；在發病高峰期，噴春雷黴素 500 倍液或多抗黴素可溼性粉劑 500 倍液控制此病。
3 棗鏽病
危害：棗鏽病主要發生在葉片上，嚴重時會危害果面，被危害嚴重的果樹8-9 月全樹葉片落盡，果實無法正常成熟，產量銳減，樹勢衰退。
防治措施：栽植時不宜過密，對於過密的樹要進行修剪，增加通風透光，增強樹勢；雨季及時排除積水，降低棗園溼度；將落葉集中燒燬或深翻掩埋於土中，減少越冬菌源；棗樹行間不宜種植高稈作物；5 月中旬噴50%翠貝 7 500 倍液一次，7 月初每隔 10 天噴一次 1∶2∶200 倍量式波爾多液或綠乳銅 800 倍液，連續噴施2-3次；發現病果後用 20%三唑銅可溼性粉劑 800 倍液或 12.5%烯唑醇懸浮劑 1 000 倍液噴霧防治。
4 細菌性瘡痂病
危害：主要侵染棗葉、棗吊、棗頭等部位，致使棗吊斷裂，落葉，落果，嚴重時會使得花蕾不能形成，葉片大批脫落，直接影響冬棗的坐果率，成為冬棗生產的大敵。
防治措施：培肥地力改良土壤，提高土壤有機質含量，增加有機肥料和鉀肥的使用量；適時澆水,降低發病高峰期的土壤溼度；芽前 對樹體噴布 3~5 波美度石硫合劑一次；越冬病害防治可以用 72％農用鏈黴素、花黴素、春雷黴素等防治 1~2 次。
5 枝腐病
危害：在樹幹或枝條的基部形成暗褐色至黑褐色病斑，小樹常造成乾枯死亡，大樹樹勢衰弱，甚至死亡。
防治措施：加強栽培管理，增強樹勢，提高抗病能力；及時剪除病枯枝；發芽前噴 3~5 波美度的石硫合劑進行預防；發病期用刀尖在病部劃道5 毫米左右後用辛菌胺醋酸鹽 50 倍液加氨基酸 50 倍液塗幹。
6 斑點病
危害：是一種危害棗葉片的嚴重病害，特別是樹勢弱、棗葉發黃的棗樹容易發生斑點病，環剝、環割樹，新梢少，葉片薄，葉色淡，樹勢弱，發病早而重。
防治措施：降低菌源基數，減少病源；提前做好害蟲防治；對蝽象類、葉蟬類等刺吸式口器害蟲要重點防治；參照真菌性病害防治。
7 棗瘋病
防治措施：石灰處理土壤或高錳酸鉀浸種苗；防除蚜蟲等害蟲。
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