aico incarnation
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整部劇選擇運用多層次的結構來展示劇情，使得劇情更加生動。角色的動作都比較細膩，描繪的栩栩如生，也使得觀眾觀看起來都有一種好奇感。
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此番結局所表達的意義得追溯到未來2035年的日本，日本桐生研究所aico計劃引發了一場名為“大爆炸”的意外，失去控制的人工生命體“混沌”侵蝕了整個黑部峽谷。曾被譽為人類希望的研究重鎮就此遭政府全面封鎖，擔心混沌會蔓延更廣。
aico神崎和愛子
在“大爆炸”事件中失去家人的15 歲少女橘愛子從轉學生神崎雄哉口中得知令人難以置信的事實。那是連愛子也不知道的自身體內隱藏著的一個秘密。接觸他後，一連串以夢形式的記憶都呈現為現實，而一切謎題的解答就在“大爆炸”的中心地“原初點”。
aico打撈隊員
神崎把愛子帶去了打撈隊的根據地裡，並確切的告訴事情真相。其父親在送出公司所研究的集智型吉祥物給愛子當生日禮物，為了保護愛子當場死亡。當時的情況愛子都可以直接見上帝了，送到研究所才被啟用最新技術人造人複製大腦得以存活。
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動用了史無前例的治療方法，把愛子的大腦和身體分離並分別治療。大腦和身體哪邊都不能單獨存活，採用了人工生命所製成的複製體。把大腦放進複製妳的身體裡，身體則放入複製的大腦裡，各自組合。等於有兩個獨立體的愛子，這並不是克隆，是由人工細胞組成和本人極為相似的身體，成為複製體。這就是愛子父親公司和桐生生命工學研究所之間的合作契約，不過這項目擅未完全成熟，愛子的複製體的身體因渴求遭分離原大腦而陷入混亂異常增殖，並化為混沌。從而造成了這次大爆炸事件，傷及無辜群眾。
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愛子為了救回媽媽和弟弟亮太，決定與打撈隊一同前行到原初點。得知愛子是合成體，一路上都被迫運送混沌的餌，打撈隊成員很不滿。因為後知後覺才知道事情原委，篠先生表明為了終止大爆炸為這一切劃上句點而來的。而成員相模先生也再次說明還有所隱瞞或是情況陷入僵局，為了保護同伴，會殺了愛子她們。
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過程中最令人感動的是篠山先生用命保護愛子她們三人，因為知道這一切毫無根據，還是願意相信，證明了這趟旅行是有意義的。
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而伊佐津他是桐生門下的優秀弟子，在桐生和天才弟子由良離開後接管了醫院和研究所，大爆炸的導火線是因為他使用細胞組譯器二型。
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為了復活女兒柚子而走火入魔到要把二號實驗體抓回來而不惜讓混沌形態的真愛子毀滅世界，強烈表達了一個父親拯救女兒轉變成一個惡魔，只能說明愛女心切！
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還揭露了由良俊英在大爆炸時把自己的大腦移植到素不相識的少年神崎的複製體裡存活了下來，為了終止大爆炸必須毀掉愛子的大腦和真正身體。
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這時的愛子才恍然大悟，原來自己才是要被毀滅掉的人造物。即便知道真相之後，勇於接受自己並非真正的橘愛子這個事實，沒有選擇自己化身為混沌毀滅這個世界，而是努力尋找自己與真正的她最適合的道路，寧願赴死也要終止這場災難。讓真愛子得以和家人團聚，讓人類得以安全。
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眾人紛紛為此而感動，而神崎看見她這份堅定的決心，才知道了她並不是自己造出的假貨，在她誕生於世的那瞬間，她就是真正的自己。承諾著並不會讓她死去，還會用這雙手打造出能以自己身份生存的世界。
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她的善舉也引來了集智型吉祥物的保護而在換腦後以人形活了下來，結尾時她以轉學生身份出現在愛子的教室裡，過上幸福生活。
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