如果相互獨立，同時引爆，那基本沒什麼影響，因為無論鏈式還是聚變反應基本上都是瞬時完成的，反應釋放的中子基本上還沒來的及相互影響。真要是考慮相互影響的話，那個人估計應該是當量變大，裂變釋放的高壓高溫可促進聚變發生，而聚變釋放的中子會加速裂變反應並提高核料利用率。不過總體而言感覺影響應該不大，氫彈裡的小原子彈足夠氫彈聚變，原子彈本身中子也夠用，原子彈剛開始裂變、氫彈剛開始聚變的話，那麼最大的可能是原子彈的裂變過程被打斷，原子彈被炸成一堆無用的碎渣落在地上，而氫彈照常爆炸。
氫彈是核聚變，核聚變最麻煩的反應條件就是——需要瞬間上億度的高溫才能引起核聚變反應，而如此高的溫度是用傳統加熱方法所無法達到的，所以人類目前的科技，只能用原子彈引爆氫彈。還有個秘密，原子彈是威力是有上限的，而氫彈沒有。原因是如果鈾/鈈太多就會達到臨界狀態，也就是自爆。所以原子彈的當量不能超過幾十萬噸。
氫彈（這裡認為是純粹的核聚變）爆炸將產生大量的高能中子，這時旁邊的原子彈（這裡姑且認為是鈾彈）當中本來不參與裂變的少量鈾238（武器級的鈾元素中也有很少量的238），也將被髮生裂變。這裡的原理有點類似三相彈（即內核原子彈——引爆中層氫彈——引爆貧鈾外殼）。儘管這一過程很輕微，對總體不會產生很明顯的影響。如果是鈈彈的話，應該就不會發生什麼了，1+1=2.當然我認為題主所提的氫彈這個概念比較模糊，平時我們所說的三相彈、中子彈都實際上都是是一種氫彈。
原子彈是在有限的小空間，產生及其快速的鏈式反應，能量瞬間釋放的武器。氫彈原理則是靠利用氫原子聚變，質量損失，釋放能量的。但是聚變需要非常高的壓力才能發生，太陽內部因為自身重力的原因，具有這麼大壓強，才能使氫原子聚變，甚至氦原子以後元素週期表後原子量更大的原子。地球上常規無法提供這麼大的壓強，需要引爆一個小型的原子彈，然後利用原子彈產生的壓力，促使氫彈內氫原子產生聚變反應。
氫彈的聚變需要有一顆原子彈（初級）的裂變來提供高壓、高溫以及中子。所以“氫彈剛開始聚變”，表示氫彈的初級已經發生了裂變，釋放出大量X射線和中子，而這時那顆獨立的原子彈還沒引爆呢。問題就在這裡：中子具有高度穿透性，既然題主說原子彈和氫彈是綁在一起的，那麼原子彈必然會受到大量中子的襲擊。這些中子會導致原子彈內部的鈈提前裂變，把原子彈炸成碎片。中子還會摧毀引信系統，導致原子彈無法正常引爆。
總之，原子彈被廢了。反過來，假如精確地同時引爆原子彈和氫彈呢（精度達到納秒級）？那麼最有可能的事是氫彈被原子彈廢掉。在這種情況下，獨立的原子彈和氫彈裡的初級幾乎同時爆炸，它們之間應該沒什麼干擾。但是氫彈的重頭是次級，而次級在引爆前需要做兩件事：1 利用中子流把鋰6分裂成氚和氦；2 利用初級的X射線壓縮氘氚混合氣體。這一過程需要極端精確，提前引爆只會把氘氚炸飛，無法實現核聚變。那顆獨立的原子彈在這個時候正好起到攪屎棍的作用：它釋放出的大量中子會引發次級裡的鈾238發生裂變，把次級炸飛，氘氚散落在空氣裡。結果氫彈只發揮了十分之一的能量。
總之，原子彈和氫彈的中子流會相互干擾，攪黃其中一個。
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