ERP這種集成化的信息系統支持各個部門的運作，即涵蓋了各職能信息系統的功能，並且在數據的一致性、支持跨部門流程的高效運作等方面表現出了比一系列分散的職能信息系統更強的優勢。同時，雖然起初以ERP為代表的集成化系統主要側重於理順流程、支持業務流程的運作，更側重於事務處理層面，但隨著技術的發展，進一步地集成決策支持的功能也是發展方向。
ERP主要關注與企業的內部流程，但如今，隨著企業間協作的加強，越來越需要從供應鏈整體的角度對企業進行管理和優化。另一方面，隨著社會的發展和競爭的加劇，良好的客戶關係成為企業盈利的越來越重要的長效動力。因而，幫助企業協調、管理、優化與供應商及客戶間的流程的供應鏈管理系統(SCM)與客戶關係管理系統(CRM)越來越受到青睞。
ERP、CRM和SCM是三類典型的流程導向的集成化的信息系統。從系統的觀點來看，職能信息系統、層次信息系統可視為集成化的信息系統的子系統，因為一個集成化的信息系統往往涵蓋了多個職能信息系統、層次信息系統功能，不僅如此，更重要的是它實現了各子系統間的有效整合，體現出了各子系統所不具有的優勢。
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