1、硫酸銅
硫酸銅對細菌和病毒的殺滅作用較小，但有殺死細胞、藻類、真菌和原生動物的高效力。如果蝦池內浮游生物過多、蝦池水太肥，夜光藻和甲藻類等以及水中懸浮物多時，可用濃度為0.7毫克/升的硫酸銅溶液潑灑全池。用藥必須在晴朗天氣進行，用藥時不要投餌，3～4小時後水質逐漸變清，透明度達到理想值為佳，即在30～40釐米。如果沒有條件換水，慎用。硫酸銅的作用機制主要是銅離子能與蛋白質中的巰基結合，干擾巰基酶的活性而達到對病原生物的致死作用。但在蝦病暴發期間，如果多次使用硫酸銅消毒，使池內藻類全部死亡，水清見底，反而會促使對蝦迅速發病死亡，因而切不可亂用，必須慎重為好。
2、漂白粉
漂白粉具有較強的殺菌作用，2%的溶液能在5分鐘之內使細菌幾乎全部致死，也能殺死大量藻類而使生態系發生變化，因此需嚴格控制用藥量。
漂白粉是氯酸鈣、消石灰和氯化鈣的混合物，遇水生成次氯酸放出初生態氧，能氧化細菌的原漿蛋白，使其活性失去作用。氯與細菌蛋白質中的氨基結合成氯胺類化合物，使細菌失去活力。但漂白粉中有效氯含量不穩定，受光照、溼度、溫度及pH影響。pH偏高時藥效降低，pH為8以上時效果明顯減弱。所以，用生石灰時不要用漂白粉。
值得注意的是，在剛放苗後，儘量不用含氯消毒劑（漂白粉、漂白精、次氯酸鈉），因會迅速改變水體生態平衡，有機殘氯會刺激對蝦，引起蝦拒食，抗病力下降，而且易發生水質變瘦，藻類死亡，特別是下大雨前後使用含氯消毒劑危害更大。大多蝦池使用後會出現種種問題。大量的有機氯、氯酚、氯氨、臭氯味的產生，這種副作用會使正常的蝦中毒死亡，體弱的蝦易感染蝦病而死亡。所以用漂白粉是有學問的，不要隨意亂用。漂白粉較便宜，但使用要科學、否則，適得其反。下大雨或暴雨宜用石灰來調節pH和殺菌。總之，選用消毒劑要具體掌握。
3、高錳酸鉀
選用高錳酸鉀作為消毒劑也要掌握好，要具體情況具體處理。高錳酸鉀能將水中有機物氧化，破壞病原生物蛋白，從而起到殺菌作用。但在鹼性或者微酸性水中，其會析出二氧化錳，影響對蝦的呼吸，使其鰓機能減退或脆弱，使用時也必須大量進水，否則會帶來不良後果。
另外，還可選用過氧化鈣進行蝦池消毒。因過氧化鈣遇水後逐漸放氧並生成氫氧化鈣，不汙染環境，它除有生石灰的優點外，還具有增氧作用。全池潑灑，濃度為3毫克/升，可起到殺菌消毒作用，但會引起水色變清，需及時施肥（可用雞糞發酵消毒來肥水），否則會給養蝦池帶來不穩定的水質。
4、過硫酸氫鉀
過硫酸氫鉀複合鹽，作為一種溶安全、環保和高效與一體的新型強氧化劑，有“第五代消毒和淨水產品”的美稱。
複合過硫酸氫鉀類產品在水產養殖中的主要應用包括以下方面：
1、消毒殺菌：
複合過硫酸氫鉀粉消毒劑，已在世界範圍內得到行業專家及政府認可，被認為是當今預防和控制畜禽及水產動物疾病的首選消毒劑。
弧克含有50%過硫酸氫鉀，具有殺菌、消毒、調水、改底四大功能，尤其對弧菌有特效。
2、改底解毒淨水，主要包括以下幾方面：
①氧化硫化氫、亞硝酸鹽、二價鐵化合物、二價錳化合物等還原性有害物質，改底除臭；
②降解多氯聯苯、多環芳烴、農藥、除草劑、染料（如孔雀石綠等）、除草劑、藻毒素等環境危害大、生物法降解難度大的汙染物；
③降解使用氯製劑、溴和碘製劑、二氧化氯、三致的醛類消毒劑等造成的二次汙染；
④絡合和氧化重金屬離子，使其形成穩定的無毒價態；
⑤提高水體氧化還原電位；
⑥在池塘底部形成氧化表層，阻斷底泥中有機質厭氧發酵產生的有毒害物質向水體發散。
3、調節pH，調節藻相平衡。
4、沉澱物循環利用和增益活菌：
見效快、無二次汙染、實現“沉澱物懸浮再利用”：改底解毒後能使底部的泥土變鬆，使解毒後的殘餌和死藻微粒懸浮，形成有機絮團，從而為浮游生物、有益微生物和魚蝦提供了營養源，12小時後搭配活菌使用，能增益活菌的生長繁殖，能使亞硝酸鹽等長時間處於正常水平。因此和微生物產品搭配使用相得益彰，把速效和長效結合起來。
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