心中心法有六個手印和一個咒語，修法簡便易學，既不用修加行與前行，更不須觀相或觀想，因為和禪宗一樣從第八識起修，且有佛力加持，故易直下見性。密咒為佛、菩薩於禪定中將自己的心化作的密語，如同發電報時所用的密碼；手印則如文件加蓋的印信，又如電視機上的天線。通過結印持咒，使學人與佛、菩薩之心靈溝通，打成一片，故加持力大，證道迅速。心中心的六個手印作用各不相同，依次修習可以淨除學人業習，鞏固入道之基，進而證體起用。
第一印為菩提心印
乃教學人立大志、發大願，上求佛道，下化眾生，鞏固修道之初心。如造百丈高樓，須先打好地基，基礎如不牢固，樓要倒塌。學道如不立大志，不發大願，勢必知難而退，遇挫即止，絕不能百折不撓地奮鬥到底，證成聖果。所以此印最為重要，在密宗的一萬六千餘種手印中，以此印為諸印之王。
第二印為菩提心成就印
修習此印可以消除宿障，治療諸病，為開慧之前奏。《佛心經》上說：“若善男子善女人，得此契持者，轉業消障，速證無上正等菩提。常持此契，得聞持不忘，於諸法要自然通達。從久遠來所未持者，應心所作，皆悉契合。”修持此印者常會出現腹瀉現象，蓋得此印加持之力，將宿世汙染、垢穢盡從大便排除之故。
第三印為正授菩提印
乃諸佛、菩薩發光加持學人，推之前進，迅速入定之要印。學人於修法期間，若遇事煩心亂,修持此印，即能迅速改觀而深入禪定。如遠方有親朋好友生病，或有不如意的事，為其加修此印，亦能於修法後痊癒，或轉好。
第四印為如來母印
是為開慧、成道與往生淨土之要印。《佛心經》上說，修持此印者“諸佛長生，我亦長生；諸佛成道，我亦成道；諸佛度人，我亦度人；諸佛無礙，我亦無礙；諸佛化身，我亦化身；諸佛放光，我亦放光；諸佛寂定，我亦寂定；諸佛三昧 ，我亦三昧；諸佛說法，我亦說法；諸佛不食，我亦不食；乃至種種諸佛所作之事，皆悉能為能作。”所以當六印修完開始專修二、四印時，第二印只修一天，而第四印須修六天，可見此印之重要。很多同仁都是在修此印期間打開本來，得見真性的。
第五印為如來善集陀羅尼印
乃集合諸佛密咒之功德 、威力與妙用於一體之印。其力至大，其勢飛猛，能降服魔障，破除外道邪法，而且能移山填海，消除翻種子等的煩惱。故修心中心法無入魔之虞，亦無受外道邪法困擾之患。
第六印為如來語印
若行者修持此印，所有諸佛所說之經與菩薩所造之論，均能一目瞭然，理解通達，無稍疑惑。持此印契並能召請諸佛、菩薩的加持，滿足諸願。當我們把貪、嗔、痴、慢、疑和各種慾望都化空了，依靠佛菩薩加持的力量，能迅速顯發本具的神通。
因為心中心法的六個手印分別具有發心、消業、得定、開慧、降魔、除障等各種功用，因此學習本法不需歷經加行及生起、圓滿等次第的修持，而可以
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