身在大馬士革的怯的不花得知馬木魯克軍隊兵進巴勒斯坦並向北移動後，起初有些猶豫。這是不難理解的，他手下的軍隊太少，而且並不都是蒙古人——不但有格魯吉亞與亞美尼亞盟軍（大約500人），甚至有剛剛在戰爭中被收編的敘利亞當地士兵。但最後怯的不花仍然決心迎戰，立刻聚集敘利亞各地的蒙古軍，親自率軍南下，率先在離艾因賈魯特不遠的地方安營紮寨。就戰場位置的選擇上看，蒙古軍佔據了有利條件。艾因賈魯特位於吉爾博阿山西北角的耶斯利河谷，今巴勒斯坦的吉多納村，距今約旦河左岸的貝桑西北 15 公里處。艾因是一條泉水，吉爾博阿山麓有一條河，名納西爾·賈魯特河，河水為蒙古騎兵提供了充足的水源，耶斯利河谷為蒙古人提供了良好的牧草，吉爾博阿山可以保護蒙古軍側翼的安全。蒙古人選擇在艾因賈魯特靜待馬木魯克軍隊的到來。怯的不花希望馬木魯克軍走狹窄且多岩石的哈魯德河進入耶斯利河谷，在艾因賈魯特與馬木魯克軍隊決戰。
艾因賈魯特會戰
但是，馬木魯克軍隊卻在十字軍的指導下繞道卡梅勒山，來到吉爾博阿的後山，臨近艾因賈魯特之後，拜伯爾斯率先鋒軍登上吉爾博阿山鄰近的莫雷山岡，發現蒙古軍在艾因泉水附近，蒙古人也發現了馬木魯克向他們逼近。拜伯爾斯察覺到自己所處位置的危險，立即派人告知統帥主力的庫突茲馬上後撤，馬木魯克軍成功脫離了蒙古人的包圍圈。
馬穆魯克軍隊在敘利亞與尼羅河三角洲飼養他們的馬匹，然而他們仍然需要從阿拉伯半島與北非進口大量馬匹。馬穆魯克人的戰馬要比蒙古人的好，這是因為他們使用的阿拉伯馬是世界上最好的馬種，身高腿長，衝刺速度極其驚人，耐力也不錯。稍後忽必烈派往波斯覲見旭烈兀汗的常德對阿拉伯馬的評價就是，“龍種馬出西海中, 有鱗角, 牝馬有駒不敢同牧, 被引入海, 不復出”。另一種馬穆魯克軍隊使用的馬匹是來自北非的昔蘭尼加（今利比亞東部）馬。這種馬僅次於純種的阿拉伯馬，其外形與純種的阿拉伯馬極為類似，非常漂亮。同時,它們的腿極其強健有力，適合在崎嶇的山路中行進，這對於任何軍隊來說自然都是個很重要的優勢。
不過，作為農業社會的埃及（尼羅河三角洲）與敘利亞地區缺乏牧場，這意味著馬穆魯克王朝不得不採用耗費高昂的飼料（大麥或者三葉草）餵養馬匹，這就限制了騎兵的規模，迫使素丹依靠相對少的騎兵精英去面對作為騎馬民族的蒙古人。即使是馬穆魯克的一位精英騎士通常也只有一匹戰馬，雖然往往攜帶有一兩匹運送行李的駱駝（每一位參與軍事遠征的馬穆魯克士兵至少都可以得到一頭駱駝。有時，馬穆魯克士兵也可得到兩頭駱駝，而哈勒嘎等非馬穆魯克士兵卻只能兩人擁有三頭駱駝），但其進軍速度終究不能與人有數馬的蒙古騎兵相垺。至1260 年9月3日，馬木魯克軍隊從西北方沿著耶斯利河谷進入戰場展開，怯的不花的蒙古軍和庫土斯的馬穆魯克軍隊主力於三英里寬的艾因賈魯特河谷展開會戰。
馬穆魯克軍隊的戰鬥力在伊斯蘭世界首屈一指。經過訓練合格後的馬穆魯克全部都成為重騎兵。他們的頭盔是用精鋼打造的，身上穿著用鋼絲密織的鎖子甲。跟歐洲騎士相比，他們的裝備要輕便得多，但是防護效果並不遜色多少。武器裝備包括一張強弓、一支長矛、一柄鋒利的大馬士革彎刀和一面盾牌。馬穆魯克的強弓射程遠，穿透力強；至於大馬士革彎刀更是天下聞名的中世紀三大名刀之一。
馬穆魯克騎兵頭盔
阿拉伯馬
與蒙古騎兵相似，馬穆魯克騎兵同樣強調騎射。在作戰時，馬穆魯克騎兵通常先採取守勢，他們排成整齊的隊形，用強弓一起齊射打擊進攻的敵軍，這等於抵消了蒙古騎兵機動性的優勢；等到敵人的陣形散亂以後，馬穆魯克騎兵才開始後發制人，發動攻擊。這時馬穆魯克騎兵會以嚴整的隊形衝向敵陣，接近敵人時他們會先再施放一撥弓箭，然後衝入敵陣，用長矛或馬刀與敵人格鬥。馬穆魯克騎兵的刀法極其出色，他們可以在策馬疾馳時劈中懸掛在空中的一顆蜜棗。從這個意義上說，馬穆魯克軍隊不像典型中世紀中東軍隊，反而在軍事技能、戰術方面同蒙古人存在著驚人的相似之處。
這天清晨，狡猾的庫土斯甚至在艾因賈魯特戰場上設置了一個陷阱。他把軍隊埋伏好，自己帶著少量士兵騎上馬出動誘敵。悍勇的怯的不花果然中計，他“象火海般地前進，對自己的力量和兵力充滿了信心”，身先士卒發起進攻。“蒙古軍進攻，射箭；庫土斯躲避開，逃跑。蒙古人大膽地追上來，殺死了許多密昔兒（埃及）人”。當蒙古軍隊進入埋伏地點時，馬穆魯克人從埋伏處三方面殺將出來，向蒙古軍猛撲過來。
馬穆魯克騎兵的衝鋒
即使這只是一支蒙古軍偏師，即使馬穆魯克軍隊可能在人數上佔有很大優勢，戰役仍然十分激烈。令人大跌眼鏡的是，數量絲毫不佔優勢的蒙古騎兵竟然衝散了馬穆魯克軍隊的左翼。庫土斯迅速重整軍隊並對蒙古人發起反擊，可是蒙古軍隊又發動了第二次衝擊，幾乎又將馬穆魯克軍隊擊潰。孤注一擲的庫土斯只好親自上陣，他再次重整軍隊，並高喊:“啊，真主安拉! 幫助你的信徒庫土斯去打敗蒙古人吧!”隨後自己朝著蒙古軍隊殺去。片刻之後，他的部下也緊跟著衝了過去用彎刀同蒙古騎兵進行激戰。這時，馬穆魯克騎兵開始展現他們突出的攻擊力。原因很簡單，以騎射見長的蒙古騎兵其實不擅長近距離格鬥，他們在與經過嚴格訓練的馬穆魯克騎兵較量刀法時佔不到任何便宜，這是因為如果可能的話，蒙古騎兵總是傾向迴避白刃戰，而情願用箭殺死敵人和他們的馬匹。只有在勝券在握的時候，蒙古人才不吝惜使用他們的馬刀。
正當兩軍戰鬥到了白熱化的時候，怯的不花手下的（敘利亞）霍姆斯士兵臨陣脫逃，導致蒙古軍軍陣大亂。雙方從清晨肉搏廝殺到中午，蒙古軍隊最後抵抗不住而崩潰，向不同方向逃竄。一部分逃到附近的山頂試圖進行抵抗，很快為拜伯爾斯的軍隊追上並消滅；一部分被當地居民抓住並殺死；一部分在河邊的蘆葦叢裡避難，結果為馬穆魯克人放火燒死。
至於蒙古軍的統帥怯的不花，他仍然騎馬衝去拼命砍殺左右之敵，給予馬穆魯克軍隊有力的打擊。周圍的蒙古人徒勞地勸他撤退，他不聽這種勸告，反而告訴那些人，“不應當讓汗王過分傷心於一支蒙古軍隊的喪失。他可以設想到這只是在一年內他的兵士的妻子沒有懷孕，他的馬場內沒有生駒……”最後，“儘管士兵們都離開了他，他繼續與上千的人作戰，最後因馬跌倒而被俘。” 當他被帶到庫土斯面前時，他嘲笑馬穆魯克克蘇丹：“我終身是君主之臣，不像你們是君主的謀殺者”，並威脅，“一旦有關我的消息傳到旭烈兀汗處，他的債怒將象沸騰的大海，從阿塞拜疆直到密昔兒「的一切」將被蒙古馬蹄踏平，密昔兒的沙子將被裝在馬囊中帶走。旭烈兀汗有象怯的不花這樣的光榮騎士三十萬人，我一個人是微不足道的。”隨後，他被殺身亡，蒙古軍至少戰死了數千人，幾乎全軍覆沒，殘部向北潰逃。
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