雁荡山站是甬台温铁路进入温州的第一站，位于乐清市北雁荡山风景区东部，唯一的纯客运服务中间站、旅游终点站，站房设计方案立面构思取自“秋雁宿之”之意，整体建筑呈古典特色，和周边秀丽的风景融为一体，距离雁荡山风景区旅游集散中心4公里
绅坊火车站位于石帆街道绅坊村，建成于2009年，隶属上海铁路局宁波车务段管辖，是乐清市三个火车站之一。它也是我国为数不多的以村名命名的火车站之一。
乐清火车站位于白石镇下阮村，隶属上海铁路局宁波车务段，在3个站点中与乐清中心区相对距离较近，规模为2台4线，靠近中雁荡山风景区。
永嘉站址位于瓯北城市新区黄田片区千石村前，现有规模2台4线，杭温高铁建成时将重新扩建为温州北站。该站是甬台温铁路唯一设在高架桥上的站房，有着“空中火车站”之称，永嘉站离楠溪江风景区仅40分钟车程，将给楠溪江风景区带来了新一轮的发展契机。
温州南站位于浙江省温州市瓯海区，为甬台温铁路、新金温铁路的终点站和温福铁路的起点站，经停车次一律为动车/高铁列车。是一座的现代化的综合交通枢纽，外形大气美观，体现出温州浓浓的水乡气息。
瑞安站，位于浙江省瑞安市飞云镇，2009年使用，隶属上海铁路局宁波车务段管辖。瑞安火车站主体采用钢结构，高3层，外形犹如一艘流线型的“船”，凸显瑞安独特的海域地理位置。
鳌江站，站址为浙江省平阳县鳌江镇，背靠仙岩山，三面环山，环境优美，鳌江镇境内旅游资源丰富，境内拥有国家十大最美丽的海岛，被海洋生态届和旅游届誉为“碧海仙山”的南麂岛；浙江省三大涌潮江之一的鳌江，以及3A旅游风景区——西湾。同时，在鳌江流域还有国家4A级风景区南雁荡山、有“浙江延安”之称的山门革命革命根据地、鹤溪古建筑群等。
苍南站，站址为浙江省苍南县灵溪镇山东村，隶属上海铁路局宁波车务段管辖。2009年12月20日 中午11点40分，D5586次苍南至上海南始发动车开行。这标志着苍南火车站已成为全国第一个开行始发动车的县级站；2016年1月10日，苍南开出全国首列由县级车站始发到首都的高铁G164次；2017年11月20日，浙江省第一列复兴号列车在苍南站首发。2017年11月20日，浙江省第一列复兴号列车在苍南站首发
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