2014年9月23日，費爾南多·桑托斯被任命為葡萄牙國家隊主教練。同年9月24日，他正式與媒體見面。2014年巴西世界盃，C羅受傷病影響，葡萄牙隊小組沒出線，桑托斯接手的是一個爛攤子。
1954年10月10日出生，六旬老帥桑托斯能力卻很強。執教4年多時間，他使一度青黃不接的五盾軍團重新成為冠軍之師。2016年法國世界盃，葡萄牙隊首奪大賽冠軍。11月17日客場逼平意大利，五盾軍團成為第一支晉級歐洲國家聯賽甲組賽事4強的球隊。
法國歐洲盃奪冠後，費爾南多·桑托斯被隊員們高高拋起。
對意大利一戰，是桑托斯執教葡萄牙隊打的第60場比賽。過去的60戰，五盾軍團取得37勝、13平、10負的戰績，進114球，失45球。除了2016年拿到歐洲盃冠軍，2017年第一次參加聯合會杯，葡萄牙隊取得了第三的成績。俄羅斯世界盃，葡萄牙隊小組出線，但止步16強。
2010年世界盃、2012年歐洲盃和2014年世界盃預選賽，葡萄牙隊都沒能拿到小組第一，靠打附加賽才驚險晉級決賽圈。桑托斯入主之後，葡萄牙隊恢復了自信，丟掉了附加賽大王的帽子。2016年歐洲盃和2018年世界盃，葡萄牙隊都是直接晉級決賽圈，沒用打附加賽。首屆歐洲國家聯賽，葡萄牙隊更是成為甲級賽事第一支晉級半決賽的球隊。
執教葡萄牙隊，桑托斯的一大特點是敢於啟用新人。截至10月14日友誼賽客場對蘇格蘭，已經有38位新人在桑托斯葡萄牙隊首次亮相。不僅重用新人，像誇雷斯馬那樣的老將在桑托斯時代也煥發第二春。2016年法國歐洲盃，“野馬”是葡萄牙隊奪冠功臣之一。在俄羅斯世界盃上，小組第三戰對摩洛哥，他也打進天外飛仙式的外腳背進球。
像斯科拉里一樣，費爾南多·桑托斯與C羅的關係也非常融洽。
俄羅斯世界盃後重啟爐灶，大量啟用90後新人，桑托斯是著眼於葡萄牙隊的年青化，在為後C羅時代未雨綢繆。畢竟葡國頭牌年已33歲，2022年歐洲盃很可能是他的最後一屆大賽。俄羅斯世界盃之後，C羅因個人原因未到國家隊勤王，但迄今為止的5戰，葡萄牙隊取得3勝2平、進8球失4球的佳績，未曾品嚐失利的滋味。
不過，執教葡萄牙隊，儘管成績不錯，但桑托斯也因正式比賽上平局太多而飽受詬病。
法國歐洲盃7戰，只有半決賽對威爾士是在90分鐘之內解決問題。小組3戰3連平，最終葡萄牙隊是以小組第三身份才出線。1/8決賽對克羅地亞，五盾軍團靠誇雷斯馬第117分鐘的絕殺才晉級。1/4決賽對波蘭，比分戰成1比1，葡萄牙點球大戰5比3獲勝。而決賽對法國，是第109分鐘由埃德打進比賽唯一進球。
2017年聯合會杯，葡萄牙隊總共打了5戰，除了小組賽上1比0勝俄羅斯、4比0贏新西蘭是90分鐘內解決問題，另外3戰常規時間都是打平。小組首戰，2比2平墨西哥，半決賽則與智利0比0互交白卷，點球大戰0比3告負。三四名爭奪戰，下半場傷停補時由佩佩扳平比分，第104分鐘才由阿德里恩·席爾瓦鎖定勝局。俄羅斯世界盃4戰，也有兩場平局，包括小組首戰2比2戰平西班牙，小組第三戰1比1平摩洛哥。
桑托斯執教葡萄牙隊打了60場比賽，其中有16場大賽比賽。在這16場比賽中，只有5場比賽葡萄牙隊是在90分鐘內解決問題，另外11場都是通過加時賽或點球大戰才決出勝負。送給桑托斯“平局大師”的稱號，可謂實至名歸。
前鋒安德烈·席爾瓦是費爾南多·桑托斯提拔和重用的新人之一。
而葡萄牙隊之所以平局多，也不能全怪桑托斯，跟葡萄牙隊在進攻上過分依賴C羅，年青球員頂不上來，全面開花做得不夠，整體實力還不是那麼超強也有關。
由於是10月10日出生，桑托斯的生日常常是在國家隊集訓期間或比賽日度過。像他的64歲生日，第二天就是客場對波蘭的歐洲國家聯賽，根本沒時間好好過，家人也不在身邊。
儘管年已六旬，但桑托斯對工作認真負責，仍懷有雄心鬥志。歐洲國家聯賽甲級賽事的半決賽、三四名爭奪戰和決賽都將在葡萄牙舉行。葡萄牙隊已殺進四強，明年6月9日在主場，如果能率領葡萄牙隊奪得史上第二個大賽冠軍，桑托斯在葡國足球史上的地位會進一步提高。
附：費爾南多·桑托斯執教葡萄牙隊歷年戰績
2014年 4戰3勝1負 進4球失2球
2015年 10戰7勝3負 進12球失8球
2016年 17戰10勝4平3負 進42球失11球
2017年 15戰11勝3平1負 進35球失8球
2018年 14戰6勝6平2負 進21球失16球
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