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根據西遊記原著，孫悟空大鬧天宮，被捉拿，包括後來被壓在五行山，菩提祖師都沒有伸出援手。
原因很簡單，西遊記原著寫著，祖師道：“你這去，定生不良。憑你怎麼惹禍行兇，卻不許說是我的徒弟，你說出半個字來，我就知之，把你這猢猻剝皮銼骨，將神魂貶在九幽之處，教你萬劫不得翻身！”悟空道：“決不敢提起師父一字，只說是我自家會的便罷。”
菩提祖師早就料到孫悟空必定會闖禍，早就撇清關係，不許他在外宣揚二人的師徒關係，更別說去救他。
事實上，整部書從孫悟空離開菩提祖師以後，兩人就再也沒有交集。
西遊記電視劇中有一段孫悟空推到人參樹，四處求人醫治，甚至回去找菩提祖師幫忙，菩提祖師指點他去找觀世音，這一段原著上是沒有的，應該是編劇加上去的。
菩提祖師就是這麼神秘，不但教了孫悟空一身好武藝，連名字也是他取得。
唐僧只給猴哥起了個行者的法號。
扶疏巷
菩提祖師法力高強，有教無類，倡導眾生平等，三教合一，性格讓人著磨不透。菩提祖師的輩分、法力應該是三清同一級，甚至更高。西遊中一直有個神秘大佬沒出現，他就是靈寶天尊（封神中通天教主），遠超大羅金仙聖人級別的祖師，需四聖（太上老君、元始天尊、接引道人、準提道人）合力才能打敗，所倡導的眾生平等，其行事做派、性格都和菩提祖師一模一樣，菩提祖師很可能是通天教主。關於菩提祖師是通天教主的鐵證，西遊原文中有。那就是靈臺方寸山樵夫形容菩提祖師的一句話，《西遊記》中樵夫唱道：“相逢處，非仙既道，靜坐講《黃庭》”，樵夫的這句話大有玄機，想當年通天教主就預測到他的弟子們會捲入西歧的戰爭，為了阻止這一切，通天教主告誡自己的弟子們，商周大戰期間，不得下山。《封神演義》中說通天教主的截教是“緊閉洞門，靜誦《黃庭》叄兩卷”。樵夫的這句話就是講這個情景。
菩提祖師是真實存在的，他不是由哪個大神或者大能幻化而成。 孫悟空在斜月三星洞打雜七年，學藝三年，共十年時間，哪個大神會閒著沒事，變化十年就為教孫悟空法術。太上老君在天庭又要煉丹，又要制兵器，還受天庭制度管束，他是沒時間來陪孫悟空的。如來佛祖在西天有諸多佛事要處理，他也不會這麼長時間不在位。更何況，貴為道祖、佛祖這樣高級別的領導，根本不需要偷偷摸摸變化他人來收徒。而通天教主有這個時間，也有收徒的愛好，還有教無類。想當年萬仙來朝是何等風光，但封神大戰後，截教死傷殆盡，其內心是何等的不忍。通天教主在被鴻鈞老祖帶到紫霄宮思過，參悟了道、佛、儒三教真諦，經老祖允許出來後，他很可能找個地方稱菩提祖師繼續收徒傳道，只是不在象過去那麼張揚。這也是他在攆孫悟空走時，為什麼會說：“別人見你有，便要你教他，你若不允，他便要害你。”鴻鈞老祖在分寶巖將眾多上古法寶都傳給了通天教主，截教萬仙來朝，盛及一時，惹他人妒忌，最終召致群毆被滅，教訓深刻啊！
有人說如來佛祖是接引道人，菩提祖師是準提道人，兩人是師兄弟關係，那是不可能的，因為西遊裡燃燈古佛當過如來的老師，那樣的話燃燈道人豈不成了接引道人和準提道人的老師？說不通。而且性格也不一樣，準提道人的口頭禪：“某某某與我西方教有緣”，菩提祖師從未說過。菩提祖師敢愛敢恨這一點和通天教主很相似。菩提祖師氣憤時威脅：“把你這猢猻剝皮挫骨，將神魂貶在九幽之處，叫汝萬劫不得翻身！”通天教主氣憤時威脅：“重立地水風火，重開世界，再造乾坤！”
孫悟空在取經路上遇到妖怪總是要找其主人或師傅，但為什麼孫悟空大鬧天宮時，沒有一個人問過他師承何處，因為大家都猜到了他的師傅是誰，只是不願意說破。從取經路上可以看出，孫悟空戰力其實一般，但大鬧天宮時居然顯得無人能敵，因為滿天星宿神仙大多是通天教主的徒弟，他們怎麼可能為難孫悟空，只能佯裝不敵小師弟，集體放水。 天庭二十八星宿的奎木狼星（黃袍怪）在被孫悟空騙去內丹的情況下還能和孫悟空打得難解難分，更何況其他眾仙。最有意思的是大師伯太上老君，不但被孫悟空偷吃許多仙丹，在其被抓後搶著要用三昧真火煉化孫悟空，結果非但沒燒死孫悟空，反而友情贈送一對火眼睛睛，還佯裝被猴子撞了個倒栽衝，要知道紅孩兒的三昧真火就能將孫悟空燒昏死過去，老君的坐騎青牛精也能讓孫悟空束手無策。二師伯元始天尊在孫悟空大鬧天宮時更是躲著不見，否則，像老君、元始這樣的聖人出手，可以妙殺孫悟空，但他們都裝作沒辦法。因為如果愛徒被弄死，以通天教主的性格，有可能引起新一輪的封神大戰，通天教主是最護犢子的。天庭最英明的還是玉皇大帝，先是招安誘惑，在拉攏不成的情況下，才出兵剿滅，而且天上地下有那麼多大神都能殺死孫悟空，偏要宣西方佛老降伏，想想通天教主與多寶如來的關係，讓如來降伏孫悟空，可以說各個方面都照顧到了，玉帝實在高明。
