二代火影堪稱木葉的發明大師，他發明了大量實用忍術，以及大量禁術，為木葉的忍術發展做出了卓越貢獻。但實際上，“二代火影是發明大師”這個設定其實是後期加上的，而且稍顯不合理，因為二代火影在某些術的研究上跟大蛇丸沒有區別，二者的下場卻截然不同。
大蛇丸同樣是發明大師，他跟二代火影差了兩代人，卻是唯一一個繼承了二代火影發明思想的科學家。只是因為他擅自做人體試驗，被三代火影發現後不得不叛逃離開。可是，大蛇丸和二代火影之間又有什麼區別呢？
先說人體試驗的問題，大蛇丸做人體試驗不被木葉所容忍，原因是這種試驗有違人道、褻瀆死者，可是二代火影開發的穢土轉生何嘗不是褻瀆死者的術？這可不是我說的，而是三代火影目睹了穢土轉生之後親口說的：
可以看出三代火影的態度還是很堅決的，他看到大蛇丸的人體試驗，認為這無法容忍，看到穢土轉生，同樣覺得無法容忍。問題在於，既然這兩種褻瀆同樣都是無法容忍的，為什麼二代火影的名聲就那麼好，大蛇丸就被趕出了村子？
再說大蛇丸其他的那些不被容忍的術，比如雙蛇相殺，這一招是大蛇丸所研究的同歸於盡之術，用一個人的命換另一個人的命，這種忍術對於一個想要蓬勃發展的忍村來說也是難以容忍的，所以整個木葉只有大蛇丸的徒弟紅豆學過這個術：
而二代火影也開發過同歸於盡之術，也就是互乘起爆符。這個術開發出來之後直接被列為禁術，因為互乘起爆符會不斷通靈出更多的起爆符，威力強大的同時也無法控制爆炸的範圍和規模，會把施術者一起捲入爆炸之中。
還有一些常規忍術的改造，比如二代火影改進了分身術，首創了能夠參與戰鬥的分身，也就是現在的影分身術，這個術被大規模推廣，整個忍界都把這個術當做基礎來教學，即使這個術有著平分查克拉之後會猝死的風險……
大蛇丸同樣改造了替身術，發明了大蛇丸流替身術，可以從嘴裡吐出另一個自己。這個術的效果改變了替身術的使用習慣，可以承受傷害之後通過蛻皮來逃脫。從佐助和大蛇丸對這個術的使用過程來看，這個術並不會危害他人生命，可是忍界卻依然把這個術認為是邪惡的存在。
說到底，其實二代火影和大蛇丸所做的研究並沒有本質上的區別，他們都探求了生死界限、開發了新型忍術，所以二代火影功成名就、大蛇丸卻身敗名裂就顯得很不合理，而這種不合理的根源來自於岸本胡亂修改設定的習慣。
從早期三代對穢土轉生的評價可以看出，一開始這個術其實應該是由大蛇丸發明的，到了後期忍界大戰，岸本為了讓劇情能進展下去，才把這個術劃歸了二代，這才讓二代獲得了忍術發明家的稱號，同時揹負了跟大蛇丸同樣褻瀆死者的設定，進一步導致了二人處境的不合理。
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