文山市較早就有人類居住，建制已有2000多年的歷史。公元前111年西漢王朝置郡縣時就已納入牂牁郡，進桑二縣轄地。到西漢元封二年（公元前109年），另設賁古縣時，縣境西部歸屬賁古縣。東南部為夢都、進桑二縣地。縣名從《易經》的“賁”和“大畜”二卦推演而得，即“取諸賁而得文之源，取大畜而知山之固”，改名文山縣。清雍正八年（1730年）裁開化通判，設文山縣，屬開化府，轄區為開化府所設開化、永平、安南、王弄、東安、樂龍、逢春、江那八里，後從樂龍分新現共九里，裡下設甲、牌，均屬原三長官司所屬地。嘉慶二十五年（1820年）改馬白同知為安平廳，分管逢春、永平、東安三里，文山縣轄六里。民國1年（1912年）成立縣公署，2年（1913年）劃分南區設靖邊行政區。1914年複名文山縣。2010年12月2日，經國務院批准，同意決定撤銷文山縣，設立文山市。撤縣設市後，原文山縣行政範圍為文山市的行政區域，隸屬關係不變。
2012年，經雲南省、文山州批准，撤銷文山市開化鎮，設立開化、臥龍、新平三街道：
開化街道轄：北橋、樑子、振華、興隆、螺峰、沙壩、大興、西山、永通、銅廠、幹河11個社區；
臥龍街道轄；高登、攀枝花、臥龍、文新街、七花、白沙坡、塘子寨、大以古8個社區；
新平街道轄：紅旗、新平壩、里布嘎、迷灑、高末5個社區。[6]
2014年6月，文山市轄3個街道辦事處、7個鎮、7個鄉（含5個民族鄉）：開化街道、臥龍街道、新平街道、古木鎮、平壩鎮、馬塘鎮、德厚鎮、小街鎮、追慄街鎮、薄竹鎮、新街鄉、喜古鄉、東山彝族鄉、柳井彝族鄉、壩心彝族鄉、秉烈彝族鄉、紅甸回族鄉
。[7]
2015年，文山市轄文山、硯山、西疇、麻栗坡、馬關、丘北、廣南、富寧8個縣（市），101個鄉（鎮）（其中16個民族鄉），3個街道辦事處，960個行政村（居委會），13807個自然村，16100個村民小組（隊）[2] 。
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